条形 बॅनर-03

उत्पादने

स्पेसिफिक-लोकस ॲम्प्लीफाइड फ्रॅगमेंट सिक्वेन्सिंग (SLAF-Seq)

उच्च-थ्रूपुट जीनोटाइपिंग, विशेषत: मोठ्या प्रमाणावरील लोकसंख्येवर, अनुवांशिक संबंध अभ्यासातील मूलभूत पायरी आहे आणि कार्यात्मक जनुक शोध, उत्क्रांती विश्लेषण इ. साठी अनुवांशिक आधार प्रदान करते. संपूर्ण जीनोम पुन्हा अनुक्रमित करण्याऐवजी,रिड्यूस्ड रिप्रेझेंटेशन जीनोम सिक्वेन्सिंग (RRGS)अनुवांशिक मार्कर शोधात वाजवी कार्यक्षमता राखून प्रति नमुन्याची अनुक्रमिक किंमत कमी करण्यासाठी या अभ्यासांमध्ये अनेकदा वापरले जाते. RRGS प्रतिबंधित एन्झाईमसह डीएनए पचवून आणि विशिष्ट तुकड्याच्या आकाराच्या श्रेणीवर लक्ष केंद्रित करून हे साध्य करते, त्याद्वारे जीनोमचा फक्त एक अंश अनुक्रमित करते. विविध RRGS पद्धतींपैकी, स्पेसिफिक-लोकस ॲम्प्लीफाइड फ्रॅगमेंट सिक्वेन्सिंग (SLAF) हा एक सानुकूल आणि उच्च-गुणवत्तेचा दृष्टीकोन आहे. BMKGene द्वारे स्वतंत्रपणे विकसित केलेली ही पद्धत, प्रत्येक प्रकल्पासाठी निर्बंध एंझाइम सेट इष्टतम करते. हे SLAF टॅग्सची (400-500 bps क्षेत्रे जीनोम अनुक्रमित केली जात आहे) मोठ्या संख्येने तयार करणे सुनिश्चित करते जे पुनरावृत्ती क्षेत्रांना प्रभावीपणे टाळून संपूर्ण जीनोममध्ये समान रीतीने वितरित केले जातात, अशा प्रकारे सर्वोत्तम अनुवांशिक मार्कर शोधाची खात्री देते.


सेवा तपशील

बायोइन्फॉरमॅटिक्स

डेमो परिणाम

वैशिष्ट्यीकृत प्रकाशने

कार्यप्रवाह

图片31

तांत्रिक योजना

企业微信截图_17371044436345

सेवा वैशिष्ट्ये

● NovaSeq वर PE150 सह अनुक्रम.

● दुहेरी बारकोडिंगसह लायब्ररीची तयारी, 1000 हून अधिक नमुने एकत्र करणे सक्षम करणे.

● हे तंत्र संदर्भ जीनोमसह किंवा त्याशिवाय वापरले जाऊ शकते, प्रत्येक केससाठी वेगवेगळ्या बायोइन्फॉर्मेटिक पाइपलाइनसह:

संदर्भ जीनोमसह: SNP आणि InDel शोध

संदर्भ जीनोमशिवाय: नमुना क्लस्टरिंग आणि SNP शोध

● मध्येसिलिको मध्येप्री-डिझाइन स्टेज मल्टिपल रिस्ट्रिक्शन एन्झाइम कॉम्बिनेशन्स जीनोमच्या बाजूने SLAF टॅग्जचे एकसमान वितरण निर्माण करणारे शोधण्यासाठी तपासले जातात.

● पूर्व-प्रयोगादरम्यान, 9 SLAF लायब्ररी तयार करण्यासाठी 3 नमुन्यांमध्ये तीन एन्झाईम संयोगांची चाचणी केली जाते आणि या माहितीचा वापर प्रकल्पासाठी इष्टतम प्रतिबंधित एन्झाइम संयोजन निवडण्यासाठी केला जातो.

सेवा फायदे

उच्च अनुवांशिक मार्कर शोध: उच्च-थ्रूपुट दुहेरी बारकोड प्रणाली एकत्रित केल्याने मोठ्या लोकसंख्येच्या एकाचवेळी क्रमवारीसाठी अनुमती मिळते आणि लोकस-विशिष्ट प्रवर्धन कार्यक्षमता वाढवते, हे सुनिश्चित करते की टॅग संख्या विविध संशोधन प्रश्नांच्या विविध आवश्यकता पूर्ण करतात.

 जीनोमवर कमी अवलंबित्व: हे संदर्भ जीनोमसह किंवा त्याशिवाय प्रजातींवर लागू केले जाऊ शकते.

लवचिक योजना डिझाइन: एकल-एंझाइम, दुहेरी-एंझाइम, बहु-एंझाइम पचन आणि विविध प्रकारचे एन्झाईम्स या सर्व वेगवेगळ्या संशोधन उद्दिष्टे किंवा प्रजाती पूर्ण करण्यासाठी निवडल्या जाऊ शकतात. दसिलिको मध्येइष्टतम सजीवांच्या शरीरात निर्मार्ण होणारे द्रव्य डिझाइन सुनिश्चित करण्यासाठी पूर्व-डिझाइन केले जाते.

 एंजाइमॅटिक पचन मध्ये उच्च कार्यक्षमता: एक च्या वहनसिलिको मध्येपूर्व-डिझाइन आणि पूर्व-प्रयोगाने गुणसूत्रावर SLAF टॅगचे समान वितरण (1 SLAF टॅग/4Kb) आणि कमी पुनरावृत्ती अनुक्रम (<5%) सह इष्टतम डिझाइनची खात्री दिली.

विस्तृत कौशल्य: वनस्पती, सस्तन प्राणी, पक्षी, कीटक आणि जलचरांसह शेकडो प्रजातींवरील 5000 SLAF-Seq प्रकल्प बंद करण्याच्या ट्रॅक रेकॉर्डसह आमचा कार्यसंघ प्रत्येक प्रकल्पासाठी अनुभवाचा खजिना आणतो.

 स्वयं-विकसित बायोइन्फॉर्मेटिक वर्कफ्लो: BMKGENE ने अंतिम आउटपुटची विश्वासार्हता आणि अचूकता सुनिश्चित करण्यासाठी SLAF-Seq साठी एकात्मिक जैव सूचनात्मक कार्यप्रवाह विकसित केला आहे.

 

सेवा तपशील

 

विश्लेषणाचा प्रकार

शिफारस केलेले लोकसंख्या स्केल

अनुक्रम धोरण

टॅग अनुक्रमांची खोली

टॅग क्रमांक

अनुवांशिक नकाशे

2 पालक आणि > 150 अपत्ये

पालक: 20x WGS

संतती: 10x

जीनोम आकार:

<400 Mb: WGS ची शिफारस केली जाते

<1Gb: 100K टॅग

1-2Gb:: 200K टॅग

>2Gb: 300K टॅग

कमाल 500k टॅग

जीनोम-वाइड असोसिएशन स्टडीज (GWAS)

≥200 नमुने

10x

अनुवांशिक उत्क्रांती

≥30 नमुने, प्रत्येक उपसमूहातील >10 नमुने

10x

सेवा आवश्यकता

एकाग्रता ≥ 5 ng/µL

एकूण रक्कम ≥ 80 एनजी

नॅनोड्रॉप OD260/280=1.6-2.5

Agarose जेल: नाही किंवा मर्यादित ऱ्हास किंवा दूषितता

शिफारस केलेले नमुना वितरण

कंटेनर: 2 मिली सेंट्रीफ्यूज ट्यूब

(बहुतेक नमुन्यांसाठी, आम्ही इथेनॉलमध्ये जतन न करण्याची शिफारस करतो)

नमुना लेबलिंग: नमुना माहिती फॉर्म सबमिट करण्यासाठी नमुने स्पष्टपणे लेबल केलेले आणि एकसारखे असणे आवश्यक आहे.

शिपमेंट: ड्राय-बर्फ: नमुने प्रथम पिशव्यामध्ये पॅक करणे आणि कोरड्या बर्फात पुरणे आवश्यक आहे.

सेवा कार्यप्रवाह

नमुना QC
पायलट प्रयोग
SLAF प्रयोग
लायब्ररीची तयारी
अनुक्रम
डेटा विश्लेषण
विक्रीनंतर सेवा

नमुना QC

पायलट प्रयोग

SLAF-प्रयोग

लायब्ररीची तयारी

अनुक्रम

डेटा विश्लेषण

विक्रीनंतरच्या सेवा


  • मागील:
  • पुढील:

  • 图片32खालील विश्लेषणाचा समावेश आहे:

    • डेटा क्रमवारी QC
    • SLAF टॅग विकास

    संदर्भ जीनोमसाठी मॅपिंग

    संदर्भ जीनोमशिवाय: क्लस्टरिंग

    • SLAF टॅगचे विश्लेषण.: आकडेवारी, जीनोमवर वितरण
    • मार्कर शोध: SNP, InDel, SNV, CV कॉलिंग आणि भाष्य

    गुणसूत्रांवर SLAF टॅगचे वितरण:

     图片33

     

    गुणसूत्रांवर SNP चे वितरण:

     图片34SNP भाष्य

    图片35

     

    वर्ष

    जर्नल

    IF

    शीर्षक

    अर्ज

    2022

    निसर्ग संप्रेषण

    १७.६९४

    गीगा-क्रोमोसोमचा जीनोमिक आधार आणि ट्री पेनीचा गिगा-जीनोम

    Paeonia ostii

    SLAF-GWAS

    2015

    नवीन फायटोलॉजिस्ट

    ७.४३३

    मधील कृषिशास्त्रीय महत्त्व असलेल्या जीनोमिक क्षेत्रांना घरगुती पायाचे ठसे नांगरतात

    सोयाबीन

    SLAF-GWAS

    2022

    प्रगत संशोधन जर्नल

    १२.८२२

    G. हर्सुटममध्ये गॉसिपियम बार्बाडेन्सचे जीनोम-व्यापी कृत्रिम प्रवेश

    कापूस फायबर गुणवत्ता आणि उत्पन्नाच्या एकाच वेळी सुधारण्यासाठी उत्कृष्ट स्थान प्रकट करा

    वैशिष्ट्ये

    SLAF - उत्क्रांती आनुवंशिकी

    2019

    आण्विक वनस्पती

    १०.८१

    लोकसंख्या जीनोमिक विश्लेषण आणि डी नोव्हो असेंब्ली विडीचे मूळ प्रकट करते

    एक उत्क्रांतीवादी खेळ म्हणून तांदूळ

    SLAF - उत्क्रांती आनुवंशिकी

    2019

    नेचर जेनेटिक्स

    ३१.६१६

    सामान्य कार्प, सायप्रिनस कार्पिओचा जीनोम अनुक्रम आणि अनुवांशिक विविधता

    SLAF-लिंकेज नकाशा

    2014

    नेचर जेनेटिक्स

    २५.४५५

    लागवड केलेल्या शेंगदाण्याचे जीनोम शेंगाच्या कॅरिओटाइप, पॉलीप्लॉइडची अंतर्दृष्टी प्रदान करते

    उत्क्रांती आणि पीक पाळीवपणा.

    SLAF-लिंकेज नकाशा

    2022

    प्लांट बायोटेक्नॉलॉजी जर्नल

    ९.८०३

    ST1 ची ओळख बियाणे आकारविज्ञानाच्या हिचहाइकिंगचा समावेश असलेली निवड प्रकट करते

    आणि सोयाबीन पाळीव करताना तेलाचे प्रमाण

    SLAF-मार्कर विकास

    2022

    आंतरराष्ट्रीय आण्विक विज्ञान जर्नल

    ६.२०८

    गहू-लेयमस मॉलिस 2Ns (2D) साठी ओळख आणि डीएनए मार्कर विकास

    डिसोमिक क्रोमोसोम प्रतिस्थापन

    SLAF-मार्कर विकास

     

    वर्ष

    जर्नल

    IF

    शीर्षक

    अर्ज

    2023

    वनस्पती विज्ञान मध्ये आघाडीवर

    ६.७३५

    Pyrus pyrifolia ची फळे पिकवताना साखर सामग्रीचे QTL मॅपिंग आणि ट्रान्सक्रिप्टोम विश्लेषण

    अनुवांशिक नकाशा

    2022

    प्लांट बायोटेक्नॉलॉजी जर्नल

    ८.१५४

    ST1 ची ओळख सोयाबीनच्या पाळीव प्रक्रियेदरम्यान बियाणे आकारविज्ञान आणि तेल सामग्रीचा हिचहाइकिंगचा समावेश असलेली निवड प्रकट करते

     

    SNP कॉलिंग

    2022

    वनस्पती विज्ञान मध्ये आघाडीवर

    ६.६२३

    जीनोम-वाइड असोसिएशन मॅपिंग ऑफ हललेस बेरली फेनोटाइप इन ड्रॉट एन्व्हायर्नमेंट.

     

    GWAS

    एक कोट मिळवा

    तुमचा संदेश इथे लिहा आणि आम्हाला पाठवा

    तुमचा संदेश आम्हाला पाठवा: