प्रोकेरियोटिक आरएनए सिक्वेन्सिंग
वैशिष्ट्ये
● RNA नमुना प्रक्रियेमध्ये rRNA कमी होणे आणि त्यानंतर दिशात्मक RNA लायब्ररी तयार करणे समाविष्ट होते.
● संदर्भ जीनोमच्या संरेखनावर आधारित जैव सूचनात्मक विश्लेषण
● विश्लेषणामध्ये जनुक अभिव्यक्ती आणि डीईजी समाविष्ट आहेत परंतु प्रतिलेख रचना आणि sRNA विश्लेषण देखील समाविष्ट आहे
सेवा फायदे
●कठोर गुणवत्ता नियंत्रण: आम्ही नमुना आणि लायब्ररीच्या तयारीपासून अनुक्रम आणि बायोइन्फॉरमॅटिक्सपर्यंत सर्व टप्प्यांवर कोर नियंत्रण बिंदू लागू करतो. हे सूक्ष्म निरीक्षण सातत्याने उच्च-गुणवत्तेचे परिणाम प्रदान करते.
●स्ट्रँड-विशिष्ट अनुक्रम डेटा: RNA लायब्ररीची तयारी दिशात्मक असल्याने, संवेदनाविरोधी प्रतिलेखांची ओळख सक्षम करते.
●प्रोकॅरियोटिक ट्रान्सक्रिप्टोम्ससाठी तयार केलेले संपूर्ण विश्लेषण: बायोइन्फॉरमॅटिक पाइपलाइनमध्ये केवळ जनुक अभिव्यक्तीचे विश्लेषणच नाही तर ओपेरॉन, यूटीआर आणि प्रवर्तकांच्या ओळखीसह ट्रान्सक्रिप्ट स्ट्रक्चरचे विश्लेषण देखील समाविष्ट आहे. यात sRNA चे विश्लेषण देखील समाविष्ट आहे, म्हणजे भाष्य आणि दुय्यम संरचना आणि लक्ष्यांचे अंदाज.
●पोस्ट-विक्री समर्थन: आमची वचनबद्धता 3 महिन्यांच्या विक्री-पश्चात सेवा कालावधीसह प्रकल्प पूर्ण होण्याच्या पलीकडे विस्तारते. या वेळी, आम्ही परिणामांशी संबंधित कोणत्याही शंकांचे निराकरण करण्यासाठी प्रोजेक्ट फॉलो-अप, समस्यानिवारण सहाय्य आणि प्रश्नोत्तर सत्रे ऑफर करतो.
नमुना आवश्यकता आणि वितरण
| लायब्ररी | अनुक्रम धोरण | डेटाची शिफारस केली आहे | गुणवत्ता नियंत्रण |
| rRNA कमी झालेली दिशात्मक लायब्ररी | Illumina PE150 | 1-2 Gb | Q30≥85% |
नमुना आवश्यकता:
| Conc.(ng/μl) | रक्कम (μg) | शुद्धता | सचोटी |
| ≥ ५० | ≥ १ | OD260/280=1.8-2.0 OD260/230=1.0-2.5 जेलवर मर्यादित किंवा कोणतेही प्रथिने किंवा डीएनए दूषित नाही. | RIN≥6.5 |
शिफारस केलेले नमुना वितरण
कंटेनर: 2 मिली सेंट्रीफ्यूज ट्यूब (टिन फॉइलची शिफारस केलेली नाही)
नमुना लेबलिंग: गट+प्रतिकृती उदा. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
शिपमेंट:
1. कोरडा बर्फ: नमुने पिशव्यामध्ये पॅक करणे आणि कोरड्या बर्फात पुरणे आवश्यक आहे.
2. RNAstable tubes: RNA नमुने RNA स्थिरीकरण ट्यूब (उदा. RNAstable®) मध्ये वाळवले जाऊ शकतात आणि खोलीच्या तापमानात पाठवले जाऊ शकतात.
सेवा कार्य प्रवाह
नमुना वितरण
ग्रंथालय बांधकाम
अनुक्रम
डेटा विश्लेषण
विक्रीनंतर सेवा
बायोइन्फॉरमॅटिक विश्लेषण कार्यप्रवाह
खालील विश्लेषणाचा समावेश आहे:
● कच्चा डेटा गुणवत्ता नियंत्रण
● संदर्भ जीनोमचे संरेखन
● लायब्ररी गुणवत्ता मूल्यांकन: RNA विखंडन यादृच्छिकता, आकार घाला आणि अनुक्रम संपृक्तता
● अंदाजित कोडिंग जनुकांचे कार्यात्मक भाष्य
● अभिव्यक्ती विश्लेषण: सहसंबंध आणि मुख्य घटक विश्लेषण (PCA)
● भिन्न जनुक अभिव्यक्ती (DEGs)
● कार्यात्मक भाष्य आणि DEGs चे संवर्धन
● sRNA विश्लेषण: अंदाज, भाष्य, लक्ष्य आणि दुय्यम संरचना अंदाज
● ट्रान्स्क्रिप्ट स्ट्रक्चर ॲनालिसिस: ऑपेरन्स, सुरुवात आणि शेवटची पोझिशन्स, अनअनुवादित प्रदेश (UTS), प्रवर्तक आणि SNP/InDel विश्लेषण
अनुक्रम संपृक्तता
कोडिंग जीन्सचे कार्यात्मक भाष्य
नमुन्यांमधील परस्परसंबंध
विभेदक व्यक्त जीन्स (DEGs) विश्लेषण
कार्यात्मक संवर्धन विश्लेषण
sRNA भाष्य
या वैशिष्ट्यीकृत प्रकाशनामध्ये BMKGene च्या Nanopore पूर्ण-लांबीच्या mRNA अनुक्रम सेवांद्वारे सुलभ केलेल्या प्रगतीचे अन्वेषण करा.
गुआन, सीपी इत्यादी. (2018) 'बायोफिल्म-फॉर्मिंग स्टॅफिलोकोकस एपिडर्मिडिसचे ग्लोबल ट्रान्सक्रिप्टम चेंजेस रिस्पॉन्सिंग टू टोटल अल्कलॉइड्स ऑफ सोफोरिया ॲलोपेक्युरोइड्स',पोलिश जर्नल ऑफ मायक्रोबायोलॉजी, 67(2), p. 223. doi: 10.21307/PJM-2018-024.
