-
BMKMANU S3000_Spatial Transscriptome
अवकाशीय ट्रान्स्क्रिप्टॉमिक्स हे वैज्ञानिक नवोपक्रमात आघाडीवर आहे, संशोधकांना त्यांचे अवकाशीय संदर्भ जपून टिशूंमधील गुंतागुंतीच्या जनुक अभिव्यक्ती नमुन्यांचा शोध घेण्यास सक्षम करते. विविध प्लॅटफॉर्ममध्ये, BMKGene ने BMKManu S3000 स्पेशियल ट्रान्सक्रिप्टोम चिप विकसित केली आहे, 3.5µm च्या वर्धित रिझोल्यूशनची बढाई मारून, सबसेल्युलर श्रेणीपर्यंत पोहोचते आणि बहु-स्तरीय रिझोल्यूशन सेटिंग्ज सक्षम करते. S3000 चिप, अंदाजे 4 दशलक्ष स्पॉट्स असलेले, स्पेसली बारकोडेड कॅप्चर प्रोबसह लोड केलेल्या मणीसह स्तरित मायक्रोवेल्स वापरते. स्थानिक बारकोडसह समृद्ध असलेली cDNA लायब्ररी S3000 चिप वरून तयार केली जाते आणि त्यानंतर Illumina NovaSeq प्लॅटफॉर्मवर अनुक्रमित केली जाते. अवकाशीय बारकोड केलेले नमुने आणि UMI चे संयोजन व्युत्पन्न केलेल्या डेटाची अचूकता आणि विशिष्टता सुनिश्चित करते. BMKManu S3000 चीप अत्यंत अष्टपैलू आहे, बहु-स्तरीय रिझोल्यूशन सेटिंग्ज ऑफर करते जी वेगवेगळ्या टिश्यूज आणि तपशीलांच्या इच्छित स्तरांवर बारीकपणे ट्यून केली जाऊ शकते. ही अनुकूलता चिपला विविध अवकाशीय ट्रान्सक्रिप्टॉमिक्स अभ्यासासाठी उत्कृष्ट पर्याय म्हणून स्थान देते, कमीतकमी आवाजासह अचूक अवकाशीय क्लस्टरिंग सुनिश्चित करते. BMKManu S3000 सह सेल सेगमेंटेशन तंत्रज्ञानाचा वापर पेशींच्या सीमांपर्यंत ट्रान्सक्रिप्शनल डेटाचे सीमांकन सक्षम करते, परिणामी थेट जैविक अर्थ असलेले विश्लेषण होते. शिवाय, S3000 च्या सुधारित रिझोल्यूशनमुळे प्रति सेलमध्ये उच्च संख्येने जीन्स आणि UMI आढळून येतात, ज्यामुळे अवकाशीय ट्रान्सक्रिप्शन पॅटर्न आणि पेशींच्या क्लस्टरिंगचे अधिक अचूक विश्लेषण शक्य होते.
-
सिंगल- न्यूक्ली आरएनए सिक्वेन्सिंग
एकल-सेल कॅप्चर आणि सानुकूल लायब्ररी बांधकाम तंत्रांचा विकास, उच्च-थ्रूपुट अनुक्रमांसह, सेल स्तरावर जनुक अभिव्यक्ती अभ्यासात क्रांती घडवून आणली आहे. ही प्रगती सर्व पेशींवरील जनुक अभिव्यक्तीच्या सरासरीशी संबंधित मर्यादांवर मात करून आणि या लोकसंख्येमधील खरी विषमता जपून, जटिल पेशींच्या लोकसंख्येचे सखोल आणि अधिक व्यापक विश्लेषण करण्यास अनुमती देते. सिंगल-सेल आरएनए सिक्वेन्सिंग (scRNA-seq) चे निर्विवाद फायदे असले तरी, ते विशिष्ट ऊतकांमध्ये आव्हानांना सामोरे जाते जेथे सिंगल-सेल सस्पेंशन तयार करणे कठीण होते आणि नवीन नमुने आवश्यक असतात. BMKGene वर, आम्ही अत्याधुनिक 10X जीनोमिक्स क्रोमियम तंत्रज्ञानाचा वापर करून सिंगल-न्यूक्लियस RNA सिक्वेन्सिंग (snRNA-seq) ऑफर करून हा अडथळा दूर करतो. हा दृष्टिकोन एकल-सेल स्तरावर ट्रान्सक्रिप्टोम विश्लेषणासाठी सक्षम नमुन्यांचा स्पेक्ट्रम विस्तृत करतो.
केंद्रकांचे पृथक्करण नाविन्यपूर्ण 10X जीनोमिक्स क्रोमियम चिपद्वारे पूर्ण केले जाते, ज्यामध्ये दुहेरी क्रॉसिंगसह आठ-चॅनेल मायक्रोफ्लुइडिक्स प्रणाली आहे. या प्रणालीमध्ये, बारकोड, प्राइमर्स, एन्झाईम्स आणि एकल न्यूक्लियस समाविष्ट करणारे जेल मणी नॅनोलिटर-आकाराच्या तेलाच्या थेंबांमध्ये अंतर्भूत केले जातात, जे जेल बीड-इन-इमल्शन (GEM) तयार करतात. जीईएम निर्मितीनंतर, प्रत्येक जीईएममध्ये सेल लिसिस आणि बारकोड रिलीज होते. त्यानंतर, mRNA रेणू 10X बारकोड आणि युनिक मॉलिक्युलर आयडेंटिफायर्स (UMIs) समाविष्ट करून cDNA मध्ये उलट प्रतिलेखन करतात. या cDNAs नंतर मानक अनुक्रमिक लायब्ररी बांधकामाच्या अधीन केले जातात, एकल-सेल स्तरावर जनुक अभिव्यक्ती प्रोफाइलचे मजबूत आणि व्यापक अन्वेषण सुलभ करते.
प्लॅटफॉर्म: 10× जीनोमिक्स क्रोमियम आणि इलुमिना नोव्हासेक प्लॅटफॉर्म
-
10x जीनोमिक्स व्हिजियम स्पेशियल ट्रान्सक्रिप्टोम
अवकाशीय ट्रान्सक्रिप्टॉमिक्स हे एक अत्याधुनिक तंत्रज्ञान आहे जे संशोधकांना त्यांचे अवकाशीय संदर्भ जपून ऊतींमधील जनुक अभिव्यक्ती नमुन्यांची तपासणी करण्यास अनुमती देते. या डोमेनमधील एक शक्तिशाली प्लॅटफॉर्म म्हणजे 10x जेनोमिक्स व्हिजिअम आणि इलुमिना सिक्वेन्सिंग. 10X व्हिजिअमचे तत्त्व एका विशिष्ट चिपवर आहे ज्यामध्ये एक नियुक्त कॅप्चर क्षेत्र आहे जेथे ऊतक विभाग ठेवलेले आहेत. या कॅप्चर क्षेत्रामध्ये बारकोड केलेले स्पॉट्स असतात, प्रत्येक टिश्यूमधील एका अद्वितीय अवकाशीय स्थानाशी संबंधित असतात. रिव्हर्स ट्रान्सक्रिप्शन प्रक्रियेदरम्यान टिश्यूमधून कॅप्चर केलेले आरएनए रेणू नंतर अद्वितीय आण्विक अभिज्ञापक (यूएमआय) सह लेबल केले जातात. हे बारकोड केलेले स्पॉट्स आणि UMIs अचूक स्थानिक मॅपिंग आणि एकल-सेल रिझोल्यूशनवर जनुक अभिव्यक्तीचे प्रमाणीकरण सक्षम करतात. अवकाशीय बारकोड केलेले नमुने आणि UMI चे संयोजन व्युत्पन्न केलेल्या डेटाची अचूकता आणि विशिष्टता सुनिश्चित करते. या अवकाशीय ट्रान्सक्रिप्टॉमिक्स तंत्रज्ञानाचा वापर करून, संशोधक पेशींच्या अवकाशीय संघटनेची आणि ऊतींमध्ये होणाऱ्या जटिल आण्विक परस्परसंवादाची सखोल माहिती मिळवू शकतात, ऑन्कोलॉजी, न्यूरोसायन्स, डेव्हलपमेंटल बायोलॉजी, इम्युनोलॉजी यासह अनेक क्षेत्रांमध्ये जैविक प्रक्रियांच्या अंतर्निहित यंत्रणेबद्दल अमूल्य अंतर्दृष्टी देऊ शकतात. , आणि वनस्पतिशास्त्र अभ्यास.
प्लॅटफॉर्म: 10X जीनोमिक्स व्हिजियम आणि इलुमिना नोव्हासेक
