-
मेटाजेनोमिक सिक्वेन्सिंग -एनजीएस
मेटाजेनोम हा पर्यावरणीय आणि मानवी मेटाजेनोम्स सारख्या जीवांच्या मिश्र समुदायाच्या एकूण अनुवांशिक सामग्रीचा संग्रह आहे. यात लागवडीयोग्य आणि अकृषक अशा दोन्ही सूक्ष्मजीवांचे जीनोम आहेत. NGS सह शॉटगन मेटाजेनॉमिक सीक्वेन्सिंगमुळे पर्यावरणीय नमुन्यांमध्ये एम्बेड केलेल्या या क्लिष्ट जीनोमिक लँडस्केपचा अभ्यास वर्गीकरणात्मक प्रोफाइलिंग पेक्षा अधिक प्रदान करून, प्रजाती विविधता, विपुलता गतिशीलता आणि जटिल लोकसंख्येच्या संरचनांबद्दल बारीक अंतर्दृष्टी प्रदान करून सक्षम करते. वर्गीकरणाच्या अभ्यासाच्या पलीकडे, शॉटगन मेटाजेनॉमिक्स एक कार्यात्मक जीनोमिक्स दृष्टीकोन देखील प्रदान करते, ज्यामुळे एन्कोड केलेल्या जनुकांचा शोध आणि पर्यावरणीय प्रक्रियांमध्ये त्यांची भूमिका सक्षम होते. शेवटी, अनुवांशिक घटक आणि पर्यावरणीय घटक यांच्यातील परस्परसंबंध नेटवर्कची स्थापना सूक्ष्मजीव समुदाय आणि त्यांच्या पर्यावरणीय पार्श्वभूमीमधील गुंतागुंतीच्या परस्परसंवादाच्या समग्र समजामध्ये योगदान देते. शेवटी, मेटाजेनॉमिक सिक्वेन्सिंग हे विविध सूक्ष्मजीव समुदायांच्या जीनोमिक गुंतागुंत उलगडण्यासाठी, या जटिल परिसंस्थांमधील आनुवंशिकता आणि पर्यावरणातील बहुआयामी संबंधांना प्रकाश देणारे एक महत्त्वाचे साधन आहे.
प्लॅटफॉर्म: Illumina NovaSeq आणि DNBSEQ-T7
-
मेटाजेनोमिक सिक्वेन्सिंग-TGS
मेटाजेनोम हा पर्यावरणीय आणि मानवी मेटाजेनोम्स सारख्या जीवांच्या मिश्र समुदायाच्या अनुवांशिक सामग्रीचा संग्रह आहे. यात लागवडीयोग्य आणि अकृषक अशा दोन्ही सूक्ष्मजीवांचे जीनोम आहेत. मेटाजेनॉमिक सिक्वेन्सिंगमुळे वर्गीकरणापेक्षा अधिक प्रदान करून पर्यावरणीय नमुन्यांमध्ये एम्बेड केलेल्या या गुंतागुंतीच्या जीनोमिक लँडस्केपचा अभ्यास करणे शक्य होते. एनकोड केलेल्या जनुकांचा आणि पर्यावरणीय प्रक्रियेतील त्यांच्या महत्त्वाच्या भूमिकांचा शोध घेऊन ते कार्यात्मक जीनोमिक्स दृष्टीकोन देखील प्रदान करते. इलुमिना सिक्वेन्सिंगसह पारंपारिक शॉटगन पद्धतींचा वापर मेटाजेनोमिक अभ्यासांमध्ये मोठ्या प्रमाणावर केला जात असताना, नॅनोपोर आणि पॅकबायो लाँग-रीड सिक्वेन्सिंगच्या आगमनाने क्षेत्र बदलले आहे. नॅनोपोर आणि PacBio तंत्रज्ञान डाउनस्ट्रीम बायोइन्फॉर्मेटिक विश्लेषणे वाढवतात, विशेषत: मेटाजेनोम असेंबली, अधिक सतत असेंब्ली सुनिश्चित करते. अहवाल सूचित करतात की नॅनोपोर-आधारित आणि PacBio-आधारित मेटाजेनोमिक्सने जटिल मायक्रोबायोम्स (मॉस, ईएल, एट अल., नेचर बायोटेक, 2020) पासून यशस्वीरित्या पूर्ण आणि बंद जिवाणू जीनोम तयार केले आहेत. इलुमिना रीड्ससह नॅनोपोर रीड्स एकत्रित केल्याने त्रुटी सुधारण्यासाठी एक धोरणात्मक दृष्टीकोन उपलब्ध होतो, ज्यामुळे नॅनोपोरची अंतर्निहित कमी अचूकता कमी होते. हे सिनर्जिस्टिक कॉम्बिनेशन प्रत्येक सिक्वेन्सिंग प्लॅटफॉर्मच्या सामर्थ्याचा फायदा घेते, संभाव्य मर्यादांवर मात करण्यासाठी आणि मेटाजेनोमिक विश्लेषणांची अचूकता आणि विश्वासार्हता वाढविण्यासाठी एक मजबूत उपाय ऑफर करते.
प्लॅटफॉर्म: Nanopore PromethION 48, Illumia आणि PacBio Revio
-
16S/18S/ITS अँप्लिकॉन सिक्वेन्सिंग-PacBio
16S आणि 18S rRNA जीन्स, इंटर्नल ट्रान्स्क्राइब्ड स्पेसर (ITS) क्षेत्रासह, अत्यंत संरक्षित आणि हायपर-व्हेरिएबल प्रदेशांच्या संयोगामुळे निर्णायक आण्विक फिंगरप्रिंटिंग मार्कर म्हणून काम करतात, ज्यामुळे ते प्रोकॅरियोटिक आणि युकेरियोटिक जीवांचे वैशिष्ट्य दर्शवण्यासाठी अमूल्य साधने बनतात. या प्रदेशांचे प्रवर्धन आणि अनुक्रम विविध परिसंस्थांमध्ये सूक्ष्मजीव रचना आणि विविधता तपासण्यासाठी अलगाव-मुक्त दृष्टीकोन देतात. इल्युमिना सिक्वेन्सिंग सामान्यत: 16S आणि ITS1 च्या V3-V4 सारख्या लहान हायपरव्हेरिएबल प्रदेशांना लक्ष्य करते, असे दिसून आले आहे की 16S, 18S आणि ITS च्या संपूर्ण लांबीच्या अनुक्रमाने उत्कृष्ट वर्गीकरण भाष्य साध्य करता येते. या सर्वसमावेशक पध्दतीचा परिणाम अचूकपणे वर्गीकृत अनुक्रमांच्या उच्च टक्केवारीत होतो, ज्यामुळे प्रजातींच्या ओळखापर्यंत विस्तारित रेझोल्यूशनची पातळी प्राप्त होते. PacBio चे सिंगल-मॉलिक्युल रिअल-टाइम (SMRT) सिक्वेन्सिंग प्लॅटफॉर्म अत्यंत अचूक लाँग रीड्स (HiFi) प्रदान करून वेगळे आहे जे पूर्ण-लांबीचे ॲम्प्लिकॉन कव्हर करते, इलुमिना सिक्वेन्सिंगच्या अचूकतेला टक्कर देते. ही क्षमता संशोधकांना एक अतुलनीय फायदा प्राप्त करण्यास अनुमती देते - अनुवांशिक लँडस्केपचे एक विहंगम दृश्य. विस्तारित कव्हरेज विशेषत: जीवाणू किंवा बुरशीजन्य समुदायांमध्ये, प्रजाती भाष्यातील रिझोल्यूशनला लक्षणीयरीत्या वाढवते, ज्यामुळे सूक्ष्मजीवांच्या लोकसंख्येच्या गुंतागुंतीची सखोल माहिती मिळते.
-
16S/18S/ITS अँप्लिकॉन सिक्वेन्सिंग-एनजीएस
इल्युमिना तंत्रज्ञानासह ॲम्प्लिकॉन सिक्वेन्सिंग, विशेषत: 16S, 18S आणि ITS अनुवांशिक चिन्हकांना लक्ष्य करते, ही सूक्ष्मजीव समुदायांमध्ये फायलोजेनी, वर्गीकरण आणि प्रजातींचे विपुलता उलगडण्यासाठी एक शक्तिशाली पद्धत आहे. या पध्दतीमध्ये हाऊसकीपिंग अनुवांशिक मार्करच्या हायपरव्हेरिएबल क्षेत्रांचा अनुक्रम समाविष्ट आहे. द्वारे मूलतः आण्विक फिंगरप्रिंट म्हणून सादर केले गेलेवोसेस वगैरे1977 मध्ये, या तंत्राने अलगाव-मुक्त विश्लेषणे सक्षम करून मायक्रोबायोम प्रोफाइलिंगमध्ये क्रांती केली आहे. 16S (बॅक्टेरिया), 18S (बुरशी), आणि इंटर्नल ट्रान्स्क्राइब्ड स्पेसर (ITS, बुरशी) च्या क्रमवारीद्वारे, संशोधक केवळ विपुल प्रजातीच नव्हे तर दुर्मिळ आणि अनोळखी प्रजाती देखील ओळखू शकतात. एक प्रमुख साधन म्हणून व्यापकपणे स्वीकारण्यात आलेले, मानवी तोंड, आतडे, मल आणि त्यापलीकडे असलेल्या विविध वातावरणात विभेदक सूक्ष्मजीव रचनांचे आकलन करण्यासाठी ॲम्प्लिकॉन सिक्वेन्सिंग महत्त्वपूर्ण ठरले आहे.
-
जिवाणू आणि बुरशीजन्य संपूर्ण जीनोम री-सिक्वेंसिंग
जिवाणू आणि बुरशीजन्य संपूर्ण-जीनोम री-सिक्वेंसिंग प्रकल्प मायक्रोबियल जीनोमची पूर्णता आणि तुलना सक्षम करून मायक्रोबियल जीनोमिक्सच्या प्रगतीसाठी महत्त्वपूर्ण आहेत. हे किण्वन अभियांत्रिकी, औद्योगिक प्रक्रियांचे ऑप्टिमायझेशन आणि दुय्यम चयापचय मार्गांचे अन्वेषण सुलभ करते. शिवाय, बुरशीजन्य आणि जीवाणूंचे पुनर्क्रमण हे पर्यावरणीय अनुकूलन समजून घेण्यासाठी, ताणांना अनुकूल करण्यासाठी आणि अनुवांशिक उत्क्रांती गतीशीलता प्रकट करण्यासाठी, औषध, कृषी आणि पर्यावरण विज्ञानातील व्यापक परिणामांसह महत्त्वपूर्ण आहे.
-
प्रोकेरियोटिक आरएनए सिक्वेन्सिंग
RNA अनुक्रमणिका विशिष्ट परिस्थितीत सर्व RNA प्रतिलेखांच्या सर्वसमावेशक प्रोफाइलिंगला सक्षम करते. हे अत्याधुनिक तंत्रज्ञान एक शक्तिशाली साधन म्हणून काम करते, विविध जैविक प्रक्रियांशी संबंधित जटिल जनुक अभिव्यक्ती प्रोफाइल, जनुक संरचना आणि आण्विक यंत्रणा उघड करते. मूलभूत संशोधन, क्लिनिकल डायग्नोस्टिक्स आणि ड्रग डेव्हलपमेंटमध्ये व्यापकपणे दत्तक घेतलेले, RNA अनुक्रम सेल्युलर डायनॅमिक्स आणि अनुवांशिक नियमनाच्या गुंतागुंतीमध्ये अंतर्दृष्टी देते. आमची प्रोकेरियोटिक आरएनए नमुना प्रक्रिया प्रोकेरियोटिक ट्रान्सक्रिप्टोमसाठी तयार केली गेली आहे, ज्यामध्ये आरआरएनए कमी होणे आणि दिशात्मक लायब्ररी तयार करणे समाविष्ट आहे.
प्लॅटफॉर्म: Illumina NovaSeq
-
मेटाट्रान्सक्रिप्टोम सिक्वेन्सिंग
इलुमिना सिक्वेन्सिंग तंत्रज्ञानाचा लाभ घेत, BMKGENE ची मेटाट्रान्सक्रिप्टोम सिक्वेन्सिंग सेवा माती, पाणी, समुद्र, मल आणि आतडे यांसारख्या नैसर्गिक वातावरणात युकेरियोट्स ते प्रोकेरियोट्स आणि विषाणूंच्या विविध प्रकारच्या सूक्ष्मजंतूंच्या डायनॅमिक जीन अभिव्यक्तीचे अनावरण करते. आमची सर्वसमावेशक सेवा संशोधकांना जटिल सूक्ष्मजीव समुदायांच्या संपूर्ण जनुक अभिव्यक्ती प्रोफाइलमध्ये शोधण्याचे सामर्थ्य देते. वर्गीकरण विश्लेषणाच्या पलीकडे, आमची मेटाट्रान्सक्रिप्टोम सिक्वेन्सिंग सेवा कार्यात्मक समृद्धीमध्ये अन्वेषण सुलभ करते, भिन्न व्यक्त जीन्स आणि त्यांच्या भूमिकांवर प्रकाश टाकते. या वैविध्यपूर्ण पर्यावरणीय कोनाड्यांमधील जनुक अभिव्यक्ती, वर्गीकरण विविधता आणि कार्यात्मक गतिशीलतेच्या जटिल लँडस्केपमध्ये नेव्हिगेट करताना जैविक अंतर्दृष्टींचा खजिना शोधा.
-
डी नोव्हो फंगल जीनोम असेंब्ली
BMKGENE बुरशीजन्य जीनोमसाठी बहुमुखी उपाय ऑफर करते, विविध संशोधन गरजा आणि इच्छित जीनोम पूर्णतेची पूर्तता करते. केवळ शॉर्ट-रीड इलुमिना सिक्वेन्सिंगचा वापर केल्याने मसुदा जीनोम तयार होऊ शकतो. नॅनोपोर किंवा पॅकबिओ वापरून शॉर्ट-रीड्स आणि लाँग-रीड सिक्वेन्सिंग अधिक परिष्कृत बुरशीजन्य जीनोमसाठी एकत्रित केले जातात ज्यामध्ये लांब कॉन्टिग्स असतात. शिवाय, हाय-सी सिक्वेन्सिंग समाकलित केल्याने क्षमता आणखी वाढतात, ज्यामुळे संपूर्ण गुणसूत्र-स्तरीय जीनोम प्राप्त करणे शक्य होते.
-
डी नोव्हो बॅक्टेरियल जीनोम असेंब्ली
आम्ही पूर्ण बॅक्टेरियल जीनोम असेंब्ली सेवा प्रदान करतो, 0 अंतराची हमी देतो. असेंब्लीसाठी नॅनोपोर आणि PacBio सारख्या लाँग-रीड सिक्वेन्सिंग तंत्रज्ञान आणि असेंबली व्हॅलिडेशन आणि ONT रीड्सच्या त्रुटी सुधारण्यासाठी Illumina सह शॉर्ट-रीड सिक्वेन्सिंग एकत्रित करून हे शक्य आहे. आमची सेवा विशिष्ट संशोधन उद्दिष्टे पूर्ण करून असेंब्ली, फंक्शनल एनोटेशन आणि प्रगत बायोइन्फॉरमॅटिक विश्लेषणातून संपूर्ण जैव सूचनात्मक कार्यप्रवाह प्रदान करते. ही सेवा विविध अनुवांशिक आणि जीनोमिक अभ्यासांसाठी अचूक संदर्भ जीनोम विकसित करण्यास सक्षम करते. याव्यतिरिक्त, हे स्ट्रेन ऑप्टिमायझेशन, अनुवांशिक अभियांत्रिकी आणि सूक्ष्मजीव तंत्रज्ञान विकास यासारख्या अनुप्रयोगांसाठी आधार बनवते, जे वैज्ञानिक अंतर्दृष्टी आणि जैवतंत्रज्ञानविषयक नवकल्पना पुढे नेण्यासाठी महत्त्वपूर्ण विश्वसनीय आणि अंतर-मुक्त जीनोमिक डेटा सुनिश्चित करते.
