-
PacBio-पूर्ण-लांबीचे 16S/18S/ITS ॲम्प्लिकॉन सिक्वेन्सिंग
Amplicon (16S/18S/ITS) प्लॅटफॉर्म मायक्रोबियल विविधता प्रकल्प विश्लेषणाच्या अनेक वर्षांच्या अनुभवासह विकसित केले आहे, ज्यामध्ये प्रमाणित मूलभूत विश्लेषण आणि वैयक्तिक विश्लेषण समाविष्ट आहे: मूलभूत विश्लेषणामध्ये सध्याच्या सूक्ष्मजीव संशोधनाच्या मुख्य प्रवाहातील विश्लेषण सामग्रीचा समावेश आहे, विश्लेषण सामग्री समृद्ध आणि व्यापक आहे, आणि विश्लेषण परिणाम प्रकल्प अहवाल स्वरूपात सादर केले जातात; वैयक्तिक विश्लेषणाची सामग्री वैविध्यपूर्ण आहे. वैयक्तिक गरजा लक्षात घेऊन नमुने निवडले जाऊ शकतात आणि मूलभूत विश्लेषण अहवाल आणि संशोधन उद्देशानुसार पॅरामीटर्स लवचिकपणे सेट केले जाऊ शकतात. विंडोज ऑपरेटिंग सिस्टम, सोपी आणि वेगवान.
-
PacBio-पूर्ण-लांबीचे ट्रान्सक्रिप्टोम (संदर्भ नसलेले)
पॅसिफिक बायोसायन्सेस (PacBio) Isoform अनुक्रम डेटा इनपुट म्हणून घेऊन, हे ॲप पूर्ण-लांबीचे प्रतिलेख अनुक्रम (असेंबलीशिवाय) ओळखण्यास सक्षम आहे. संदर्भ जीनोमच्या विरूद्ध पूर्ण-लांबीच्या अनुक्रमांचे मॅपिंग करून, प्रतिलिपी ज्ञात जीन्स, प्रतिलेख, कोडिंग क्षेत्र इत्यादींद्वारे ऑप्टिमाइझ केली जाऊ शकतात. या प्रकरणात, mRNA संरचनांची अधिक अचूक ओळख, जसे की पर्यायी स्प्लिसिंग इ. साध्य करता येते. एनजीएस ट्रान्सक्रिप्टोम सिक्वेन्सिंग डेटासह संयुक्त विश्लेषण ट्रान्सक्रिप्ट स्तरावर अभिव्यक्तीमध्ये अधिक व्यापक भाष्य आणि अधिक अचूक परिमाण सक्षम करते, जे मुख्यत्वे डाउनस्ट्रीम विभेदक अभिव्यक्ती आणि कार्यात्मक विश्लेषणास लाभ देते.
-
टूलकिट
BMKCloud हे जीनोमिक प्रोग्राम्ससाठी वन-स्टॉप सोल्यूशन प्रदान करणारे एक अग्रगण्य बायोइन्फॉरमॅटिक प्लॅटफॉर्म आहे, ज्यावर वैद्यकीय, कृषी, पर्यावरण इत्यादींसह विविध क्षेत्रातील संशोधकांचा मोठ्या प्रमाणावर विश्वास आहे. BMKCloud बायोइन्फॉरमॅटिक विश्लेषण प्लॅटफॉर्म आणि साधनांसह एकात्मिक, विश्वासार्ह आणि कार्यक्षम सेवा प्रदान करण्यासाठी वचनबद्ध आहे. , संगणकीय संसाधने, सार्वजनिक डाटाबेस, बायोइन्फॉर्मेटिक ऑनलाइन अभ्यासक्रम इ. BMKCloud मध्ये विविध जीन एनोटेशन, उत्क्रांती अनुवांशिक साधने, एनसीआरएनए, डेटा गुणवत्ता नियंत्रण, असेंब्ली, अलाइनमेंट, डेटा एक्सट्रॅक्शन, उत्परिवर्तन, सांख्यिकी, आकृती जनरेटर, अनुक्रम विश्लेषण इत्यादींचा समावेश असलेली जैव सूचनात्मक साधने वारंवार वापरली जातात.
-
लहान आरएनए
लहान RNAs हे miRNA, siRNA आणि piRNA सह सरासरी 18-30 nt लांबीचे शॉर्ट नॉन-कोडिंग RNA आहेत. हे लहान आरएनए मोठ्या प्रमाणावर विविध जैविक प्रक्रिया जसे की mRNA डिग्रेडेशन, ट्रान्सलेशन इनहिबिशन, हेटरोक्रोमॅटिन तयार करणे इत्यादींमध्ये गुंतलेले असल्याचे नोंदवले गेले आहे. प्राणी/वनस्पती विकास, रोग, विषाणू इत्यादीवरील अभ्यासांमध्ये लहान आरएनए अनुक्रमिक विश्लेषण मोठ्या प्रमाणावर लागू केले गेले आहे. अनुक्रम विश्लेषण प्लॅटफॉर्ममध्ये मानक विश्लेषण आणि प्रगत डेटा मायनिंगचा समावेश आहे. RNA-seq डेटाच्या आधारावर, मानक विश्लेषण miRNA ओळख आणि अंदाज, miRNA लक्ष्य जनुक अंदाज, भाष्य आणि अभिव्यक्ती विश्लेषण साध्य करू शकते. प्रगत विश्लेषण सानुकूलित miRNA शोध आणि निष्कर्षण, Venn आकृती निर्मिती, miRNA आणि लक्ष्य जनुक नेटवर्क बिल्डिंग सक्षम करते.
-
NGS-WGS (इल्युमिना/BGI)
NGS-WGS हे संपूर्ण जीनोम री-सिक्वेंसिंग ॲनालिसिस प्लॅटफॉर्म आहे, जे बायोमार्कर टेक्नॉलॉजीजमधील समृद्ध अनुभवाच्या आधारे विकसित केले गेले आहे. हे प्लॅटफॉर्म वापरण्यास सुलभतेने काही मूलभूत पॅरामीटर सेट करून एकात्मिक विश्लेषण कार्यप्रवाह द्रुतपणे सादर करण्यास अनुमती देते, जे इलुमिना प्लॅटफॉर्म आणि BGI अनुक्रमण प्लॅटफॉर्म या दोन्हींमधून व्युत्पन्न केलेल्या DNA अनुक्रम डेटासाठी बसते. हे प्लॅटफॉर्म उच्च कार्यप्रदर्शन संगणकीय सर्व्हरवर तैनात केले आहे, जे अत्यंत मर्यादित वेळेत अत्यंत कार्यक्षम डेटा विश्लेषणास सक्षम करते. उत्परिवर्तित जीन क्वेरी, पीसीआर प्राइमर डिझाइन इत्यादीसह मानक विश्लेषणाच्या आधारावर वैयक्तिकृत डेटा मायनिंग उपलब्ध आहे.
-
mRNA(संदर्भ)
ट्रान्सक्रिप्टम हा जीनोमिक अनुवांशिक माहिती आणि जैविक कार्याच्या प्रोटीओममधील दुवा आहे. ट्रान्सक्रिप्शनल लेव्हल रेग्युलेशन हे जीवांचे सर्वात महत्वाचे आणि सर्वात व्यापकपणे अभ्यासलेले नियमन मोड आहे. ट्रान्सक्रिप्टोम सीक्वेन्सिंग कोणत्याही वेळी किंवा कोणत्याही स्थितीत ट्रान्स्क्रिप्टमचा क्रम लावू शकते, एकल न्यूक्लियोटाइडच्या अचूक रिझोल्यूशनसह. ते जनुक प्रतिलेखनाची पातळी गतिशीलपणे परावर्तित करू शकते, एकाच वेळी दुर्मिळ आणि सामान्य प्रतिलेख ओळखू शकते आणि त्याचे प्रमाण ठरवू शकते आणि संरचनात्मक माहिती प्रदान करू शकते. नमुना विशिष्ट प्रतिलेख.
सध्या, ट्रान्सक्रिप्टोम सिक्वेन्सिंग तंत्रज्ञानाचा वापर कृषीशास्त्र, औषध आणि इतर संशोधन क्षेत्रात मोठ्या प्रमाणावर केला जात आहे, ज्यात प्राणी आणि वनस्पती विकास नियमन, पर्यावरणीय अनुकूलन, रोगप्रतिकारक संवाद, जनुक स्थानिकीकरण, प्रजाती अनुवांशिक उत्क्रांती आणि ट्यूमर आणि अनुवांशिक रोग शोधणे समाविष्ट आहे.
-
मेटाजेनॉमिक्स (एनजीएस)
हे विश्लेषण व्यासपीठ अनेक वर्षांच्या अनुभवाच्या आधारे शॉटगन मेटाजेनोमिक डेटा विश्लेषणासाठी डिझाइन केले आहे. यामध्ये डेटा प्रोसेसिंग, प्रजाती-स्तरीय अभ्यास, जनुक फंक्शन-लेव्हल स्टडीज, मेटाजेनोम बिनिंग इत्यादींसह सामान्यतः आवश्यक असलेल्या विविध मेटाजेनोमिक्स विश्लेषणांचा समावेश असलेल्या एकात्मिक वर्कफ्लोचा समावेश आहे. शिवाय, मानक विश्लेषण वर्कफ्लोवर सानुकूलित डेटा मायनिंग साधने उपलब्ध आहेत, जीन आणि प्रजाती क्वेरीसह. , पॅरामीटर सेटिंग, वैयक्तिक आकृती निर्माण करणे इ.
-
LncRNA
लाँग नॉन-कोडिंग RNAs (lncRNA) हे 200 nt पेक्षा जास्त लांबीचे ट्रान्सक्रिप्ट्स आहेत, जे प्रथिने कोड करण्यास अक्षम आहेत. संचयी पुरावे सूचित करतात की बहुतेक lncRNA कार्यशील असण्याची शक्यता असते. उच्च-थ्रूपुट सिक्वेन्सिंग तंत्रज्ञान आणि बायोइन्फॉरमॅटिक विश्लेषण साधने आम्हाला lncRNA अनुक्रम आणि स्थिती माहिती अधिक कार्यक्षमतेने प्रकट करण्यास सक्षम करतात आणि आम्हाला महत्त्वपूर्ण नियामक कार्यांसह lncRNAs शोधण्यास प्रवृत्त करतात. जलद, विश्वासार्ह आणि लवचिक lncRNA विश्लेषण साध्य करण्यासाठी आमच्या ग्राहकांना lncRNA अनुक्रम विश्लेषण प्लॅटफॉर्म प्रदान करण्याचा BMKCloud ला अभिमान आहे.
-
GWAS
जीनोम-वाइड असोसिएशन स्टडी (जीडब्ल्यूएएस) चे उद्दिष्ट विशिष्ट वैशिष्ट्यांशी (फिनोटाइप) संबंधित अनुवांशिक रूपे (जीनोटाइप) ओळखणे आहे. GWA अभ्यास अनुवांशिक मार्कर मोठ्या संख्येने व्यक्तींच्या संपूर्ण जीनोमची तपासणी करतो आणि लोकसंख्येच्या पातळीवर सांख्यिकीय विश्लेषणाद्वारे जीनोटाइप-फिनोटाइप असोसिएशनचा अंदाज लावतो. संपूर्ण-जीनोम रिक्वेंसिंग संभाव्यपणे सर्व अनुवांशिक रूपे शोधू शकते. फिनोटाइपिक डेटासह जोडणे, GWAS वर फेनोटाइप संबंधित SNPs, QTL आणि उमेदवार जीन्स ओळखण्यासाठी प्रक्रिया केली जाऊ शकते, जे आधुनिक प्राणी/वनस्पती प्रजननाचा जोरदार समर्थन करते. SLAF ही एक स्वयं-विकसित सरलीकृत जीनोम अनुक्रम धोरण आहे, जी जीनोम-व्यापी वितरित मार्कर, SNP शोधते. हे SNP, आण्विक अनुवांशिक मार्कर म्हणून, लक्ष्यित वैशिष्ट्यांसह संबद्ध अभ्यासासाठी प्रक्रिया केली जाऊ शकते. अनुवांशिक फरकांशी संबंधित जटिल गुणधर्म ओळखण्यासाठी ही एक किफायतशीर धोरण आहे.
-
नॅनोपोर पूर्ण-लांबीचे ट्रान्सक्रिप्टॉमिक्स
जीवांमध्ये जटिल आणि परिवर्तनीय पर्यायी आयसोफॉर्म हे जनुक अभिव्यक्ती आणि प्रथिने विविधता नियंत्रित करण्यासाठी महत्त्वपूर्ण अनुवांशिक यंत्रणा आहेत. प्रतिलेख संरचनांची अचूक ओळख हा जनुक अभिव्यक्ती नियमन नमुन्यांचा सखोल अभ्यास करण्याचा आधार आहे. नॅनोपोर सिक्वेन्सिंग प्लॅटफॉर्मने ट्रान्सक्रिप्टॉमिक अभ्यास यशस्वीरित्या आयसोफॉर्म-स्तरावर आणला आहे. हे विश्लेषण प्लॅटफॉर्म संदर्भ जीनोमच्या आधारावर नॅनोपोर प्लॅटफॉर्मवर व्युत्पन्न केलेल्या RNA-Seq डेटाचे विश्लेषण करण्यासाठी डिझाइन केले आहे, जे जनुक पातळी आणि प्रतिलेख स्तर दोन्हीमध्ये गुणात्मक आणि परिमाणात्मक विश्लेषणे प्राप्त करते.
-
circ-RNA
वर्तुळाकार RNA(circRNA) हा नॉन-कोडिंग RNA चा एक प्रकार आहे, जो अलीकडेच विकसित होत असलेल्या नियामक नेटवर्कमध्ये महत्त्वाची भूमिका बजावत असल्याचे आढळून आले आहे, पर्यावरणीय प्रतिकार इ. रेषीय RNA रेणूंपासून वेगळे आहे, उदा. mRNA, lncRNA, 3′ आणि 5′ circRNA चे टोक एकमेकांना जोडून गोलाकार रचना तयार करतात, ज्यामुळे त्यांचे पचन होण्यापासून वाचते exonuclease आणि बहुतेक रेषीय RNA पेक्षा अधिक स्थिर आहेत. जनुकांच्या अभिव्यक्तीचे नियमन करण्यासाठी CircRNA मध्ये विविध कार्ये असल्याचे आढळून आले आहे. CircRNA ceRNA म्हणून कार्य करू शकते, जे miRNA ला स्पर्धात्मकपणे बांधते, ज्याला miRNA स्पंज म्हणून ओळखले जाते. CircRNA अनुक्रम विश्लेषण प्लॅटफॉर्म circRNA संरचना आणि अभिव्यक्ती विश्लेषण, लक्ष्य अंदाज आणि इतर प्रकारच्या RNA रेणूंसह संयुक्त विश्लेषणास सक्षम करते
-
BSA
बल्क्ड सेग्रेगंट ॲनालिसिस प्लॅटफॉर्ममध्ये एक-चरण मानक विश्लेषण आणि सानुकूलित पॅरामीटर सेटिंगसह प्रगत विश्लेषण समाविष्ट आहे. BSA हे फिनोटाइपशी संबंधित अनुवांशिक मार्कर पटकन ओळखण्यासाठी वापरले जाणारे तंत्र आहे. BSA च्या मुख्य कार्यप्रवाहामध्ये हे समाविष्ट आहे: 1. अत्यंत विरोधी फिनोटाइप असलेल्या व्यक्तींचे दोन गट निवडणे; 2. सर्व व्यक्तींचे DNA, RNA किंवा SLAF-seq (बायोमार्करद्वारे विकसित) एकत्र करून दोन मोठ्या प्रमाणात DNA तयार करणे; 3. संदर्भ जीनोमच्या विरूद्ध किंवा दरम्यानच्या विभेदक अनुक्रमांची ओळख करणे, 4. ईडी आणि एसएनपी-इंडेक्स अल्गोरिदमद्वारे उमेदवार जोडलेल्या प्रदेशांचा अंदाज लावणे; 5. उमेदवार प्रदेशातील जनुकांवर कार्यात्मक विश्लेषण आणि संवर्धन, इ. आनुवंशिक मार्कर स्क्रीनिंग आणि प्राइमर डिझाइनसह डेटामध्ये अधिक प्रगत खाणकाम देखील उपलब्ध आहे.
-
अँप्लिकॉन (16S/18S/ITS)
Amplicon (16S/18S/ITS) प्लॅटफॉर्म मायक्रोबियल विविधता प्रकल्प विश्लेषणाच्या अनेक वर्षांच्या अनुभवासह विकसित केले आहे, ज्यामध्ये प्रमाणित मूलभूत विश्लेषण आणि वैयक्तिक विश्लेषण समाविष्ट आहे: मूलभूत विश्लेषणामध्ये सध्याच्या सूक्ष्मजीव संशोधनाच्या मुख्य प्रवाहातील विश्लेषण सामग्रीचा समावेश आहे, विश्लेषण सामग्री समृद्ध आणि व्यापक आहे, आणि विश्लेषण परिणाम प्रकल्प अहवाल स्वरूपात सादर केले जातात; वैयक्तिक विश्लेषणाची सामग्री वैविध्यपूर्ण आहे. वैयक्तिक गरजा लक्षात घेऊन नमुने निवडले जाऊ शकतात आणि मूलभूत विश्लेषण अहवाल आणि संशोधन उद्देशानुसार पॅरामीटर्स लवचिकपणे सेट केले जाऊ शकतात. विंडोज ऑपरेटिंग सिस्टम, सोपी आणि वेगवान.
