संदर्भ जीनोमसह mRNA-seq (NGS)
आरएनए-सेक हे जीवन आणि पीक विज्ञानातील एक मानक साधन आहे, जे जीनोम आणि प्रोटीओममधील अंतर कमी करते. नवीन उतारा शोधण्यात आणि त्यांची अभिव्यक्ती एका परिक्षणात मोजण्यात त्याची ताकद आहे. हे तुलनात्मक ट्रान्सक्रिप्टोमिक अभ्यासासाठी, विविध वैशिष्ट्यांशी किंवा फिनोटाइपशी संबंधित जनुकांवर प्रकाश टाकण्यासाठी, जसे की जंगली-प्रकारांशी उत्परिवर्तींची तुलना करणे किंवा विशिष्ट परिस्थितीत जीन अभिव्यक्ती उघड करणे यासाठी मोठ्या प्रमाणावर वापरले जाते. BMKCloud mRNA(संदर्भ) APP अभिव्यक्ती प्रमाणीकरण, विभेदक अभिव्यक्ती विश्लेषण (DEG), आणि अनुक्रम संरचना विश्लेषणे mRNA-seq(NGS) बायोइन्फॉरमॅटिक्स पाइपलाइनमध्ये एकत्रित करते आणि सोयी आणि वापरकर्ता-मित्रत्व सुनिश्चित करून समान सॉफ्टवेअरची ताकद एकत्र करते. वापरकर्ते त्यांचा RNA-seq डेटा क्लाउडवर अपलोड करू शकतात, जेथे ॲप सर्वसमावेशक, वन-स्टॉप बायोइन्फॉरमॅटिक विश्लेषण उपाय ऑफर करतो. याव्यतिरिक्त, ते वापरकर्त्यांच्या विशिष्ट गरजांनुसार वैयक्तिकृत ऑपरेशन्स ऑफर करून, ग्राहक अनुभवाला प्राधान्य देते. वापरकर्ते पॅरामीटर्स सेट करू शकतात आणि पाइपलाइन मिशन स्वतः सबमिट करू शकतात, परस्परसंवादी अहवाल तपासू शकतात, डेटा/डायग्राम पाहू शकतात आणि संपूर्ण डेटा मायनिंग करू शकतात, जसे की: लक्ष्य जनुक निवड, कार्यात्मक क्लस्टरिंग, डायग्रामिंग इ.
प्लॅटफॉर्म:इलुमिना, एमजीआय
धोरण:RNA-Seq
मांडणी: पॅरीड, क्लीन-डेटा.
लायब्ररी प्रकार:fr-unstranded, fr-firststrand किंवा fr-secondstrand
वाचा लांबी:150 bp
फाइल प्रकार:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz किंवा *.fq.gz. यंत्रणा करेलत्यांच्या फाईल नावांनुसार .fastq फाइल्स आपोआप पेअर करा,उदा. *_1.fastq*._2.fastq सह जोडलेले.
नमुन्यांची संख्या:संख्येवर कोणतेही निर्बंध नाहीतनमुने, परंतु विश्लेषण वेळ संख्या म्हणून वाढेलनमुने वाढतात.
शिफारस केलेली डेटा रक्कम:प्रति नमुना 6G