नॅनोपोर पूर्ण-लांबीचे ट्रान्सक्रिप्टोम

नॅनोपोर ट्रान्सक्रिप्टोम सीक्वेन्सिंग ही पूर्ण-लांबीच्या सीडीएनए अनुक्रमित करण्यासाठी, ट्रान्सक्रिप्ट आयसोफॉर्म्स अचूकपणे ओळखण्यासाठी आणि परिमाण करण्यासाठी एक शक्तिशाली पद्धत आहे. BMKCloud नॅनोपोर फुल-लेन्थ ट्रान्स्क्रिप्टोम पाइपलाइन नॅनोपोर प्लॅटफॉर्मवर व्युत्पन्न केलेल्या RNA-Seq डेटाचे विश्लेषण करण्यासाठी डिझाइन केलेली आहे जी उच्च-गुणवत्तेच्या सु-भाष्य संदर्भ जीनोमच्या विरूद्ध, जीन आणि ट्रान्सक्रिप्ट दोन्ही स्तरांवर गुणात्मक आणि परिमाणात्मक विश्लेषण प्रदान करते. गुणवत्ता नियंत्रणानंतर, पूर्ण-लांबीचे नॉन-चिमरिक (FLNC) अनुक्रम प्राप्त केले जातात आणि अनावश्यक प्रतिलेख काढून टाकण्यासाठी संदर्भ जीनोममध्ये एकमत अनुक्रम मॅप केले जातात. या उताऱ्याच्या संचावरून, अभिव्यक्तीचे प्रमाण निश्चित केले जाते आणि भिन्नपणे व्यक्त केलेले जीन्स आणि प्रतिलेख ओळखले जातात आणि कार्यात्मकपणे भाष्य केले जातात. पाइपलाइनमध्ये पर्यायी पॉलीएडेनिलेशन (एपीए) विश्लेषण, पर्यायी स्प्लिसिंग विश्लेषण, साधे अनुक्रम पुनरावृत्ती (एसएसआर) विश्लेषण, एलएनसीआरएनए आणि संबंधित लक्ष्यांचा अंदाज, कोडिंग अनुक्रमांचा अंदाज (सीडीएस), जनुक कुटुंब विश्लेषण, ट्रान्सक्रिप्शन फॅक्टर विश्लेषण, नोव्हेलेजेन विश्लेषण यांचा समावेश आहे. आणि कार्यात्मक भाष्य प्रतिलेख