mRNA-seq (NGS) - De novo
mRNA सिक्वेन्सिंग विशिष्ट परिस्थितीत पेशींमधील सर्व mRNA प्रतिलेखांचे प्रोफाइलिंग करण्यास अनुमती देते आणि विविध संशोधन क्षेत्रांमध्ये मोठ्या प्रमाणावर वापरले जाणारे तंत्रज्ञान आहे. BMKCloud De novo mRNA-seq पाइपलाइन कोणत्याही संदर्भ जीनोम उपलब्ध नसताना पॉली-ए समृद्ध सिक्वेन्सिंग लायब्ररींचे विश्लेषण करण्यासाठी डिझाइन केलेली आहे. पाइपलाइन गुणवत्ता नियंत्रणासह सुरू होते, त्यानंतरde novoउतारा असेंबली आणि युनिजीन सेट निवड. युनिजीन संरचना विश्लेषण कोडिंग अनुक्रम (CDS) आणि साधे अनुक्रम पुनरावृत्ती (SSR) ची भविष्यवाणी करते. त्यानंतर, विभेदक अभिव्यक्ती विश्लेषणामध्ये चाचणी केलेल्या परिस्थितींमध्ये भिन्न व्यक्त जीन्स (DEGs) आढळतात, त्यानंतर जैविक अंतर्दृष्टी काढण्यासाठी DEGs चे कार्यात्मक भाष्य आणि संवर्धन होते.
बायोइन्फॉरमॅटिक्स
