PEP150 सह इल्युमिना नोव्हासेक वर अनुक्रम.
● सेवेसाठी फॉर्मलडिहाइडसह क्रॉस-लिंक करण्यासाठी आणि डीएनए-प्रोटीन परस्परसंवादाचे संवर्धन करण्यासाठी, काढलेल्या न्यूक्लिक ids सिडच्या ऐवजी ऊतकांचे नमुने आवश्यक आहेत.
● हाय-सी प्रयोगात बायोटिनसह चिकट टोकांची निर्बंध आणि शेवटची दुरुस्ती समाविष्ट आहे, त्यानंतर परस्परसंवादाचे रक्षण करताना परिणामी बोथट समाप्तीचे परिपत्रक. त्यानंतर डीएनए स्ट्रेप्टाविडिन मणीसह खाली खेचले जाते आणि त्यानंतरच्या लायब्ररीच्या तयारीसाठी शुद्ध केले जाते.
हाय-सीचे विहंगावलोकन
(लिबरमॅन-एडेन ई एट अल.,विज्ञान, 2009)
●अनुवांशिक लोकसंख्येच्या डेटाची आवश्यकता दूर करणे:एचआय-सी कॉन्टिग अँकरिंगसाठी आवश्यक माहिती आवश्यक आहे.
●उच्च मार्कर घनता:उच्च कॉन्टिग अँकरिंग रेशो 90%पेक्षा जास्त आहे.
●विस्तृत कौशल्य आणि प्रकाशन रेकॉर्डःबीएमकेजीनला 1000 वेगवेगळ्या प्रजाती आणि विविध पेटंट्समधील एचआय-सी जीनोम असेंब्लीच्या 2000 हून अधिक प्रकरणांचा मोठा अनुभव आहे. 200 हून अधिक प्रकाशित प्रकरणांमध्ये 2000 पेक्षा जास्त एक संचयित प्रभाव घटक आहे.
●अत्यंत कुशल बायोइन्फॉरमॅटिक्स टीम:एचआय-सी प्रयोग आणि डेटा विश्लेषणासाठी इन-हाऊस पेटंट्स आणि सॉफ्टवेअर कॉपीराइट्ससह, स्वयं-विकसित व्हिज्युअलायझेशन डेटा सॉफ्टवेअर मॅन्युअल ब्लॉक हलविणे, उलट करणे, रद्द करणे आणि पुन्हा करणे सक्षम करते.
●विक्रीनंतरचे समर्थन:आमची वचनबद्धता 3 महिन्यांच्या विक्री-सेवा कालावधीसह प्रकल्प पूर्ण होण्यापलीकडे आहे. यावेळी, आम्ही निकालांशी संबंधित कोणत्याही प्रश्नांची पूर्तता करण्यासाठी प्रोजेक्ट पाठपुरावा, समस्यानिवारण सहाय्य आणि प्रश्नोत्तर सत्रे ऑफर करतो.
●सर्वसमावेशक भाष्य: आम्ही एकाधिक डेटाबेस वापरण्यासाठी ओळखल्या गेलेल्या भिन्नतेसह जीन्सचे कार्यशीलपणे भाष्य करण्यासाठी आणि संबंधित संवर्धन विश्लेषण करण्यासाठी, एकाधिक संशोधन प्रकल्पांवर अंतर्दृष्टी प्रदान करण्यासाठी.
ग्रंथालयाची तयारी | अनुक्रम धोरण | शिफारस केलेले डेटा आउटपुट | गुणवत्ता नियंत्रण |
हाय-सी लायब्ररी | इल्युमिना नोवाशेक पीई 150 | 100x | Q30 ≥ 85% |
ऊतक | आवश्यक रक्कम |
प्राणी व्हिसेरा | ≥ 2 ग्रॅम |
प्राणी स्नायू | |
सस्तन प्राणी रक्त | ≥ 2 मिली |
पोल्ट्री/फिश रक्त | |
वनस्पती- ताजे पान | ≥ 3 ग्रॅम |
सुसंस्कृत पेशी | ≥ 1x107 |
कीटक | ≥ 2 ग्रॅम |
1) कच्चा डेटा क्यूसी
२) हाय-सी लायब्ररी क्यूसी: वैध हाय-सी परस्परसंवादाचा अंदाज
)) हाय-सी असेंब्ली: गटांमध्ये कॉन्टिग्सचे क्लस्टरिंग, त्यानंतर प्रत्येक गटात कॉन्टिग ऑर्डर करणे आणि कॉन्टिग ओरिएंटेशन देणे
4) हाय-सी मूल्यांकन
हाय-सी लायब्ररी क्यूसी-हाय-सी वैध परस्परसंवाद जोड्यांचा अंदाज
हाय-सी असेंब्ली-आकडेवारी
पोस्ट-असेंबली मूल्यांकन-डिब्बे दरम्यान सिग्नलच्या तीव्रतेचे हीटमॅप
प्रकाशनांच्या क्युरेट केलेल्या संग्रहाद्वारे बीएमकेजीनच्या हाय-सी असेंब्ली सेवांद्वारे सुलभ केलेल्या प्रगतीचे अन्वेषण करा.
टियान, टी. एट अल. . doi: 10.1038/s41588-023-01297-y.
वांग, झेडएल एट अल. . 524140. डोई: 10.3389/fgene.2020.00279/बिबटेक्स.
झांग, एफ. एट अल. . doi: 10.1038/S41467-023-37133-4.
झांग, एक्स. एट अल. . doi: 10.1016/j.cell.2020.09.043