जीनोम-वाइड असोसिएशन विश्लेषण
कार्यप्रवाह
सेवा फायदे
●विस्तृत कौशल्य आणि प्रकाशन रेकॉर्ड: GWAS मधील संचित अनुभवासह, BMKGene ने लोकसंख्येतील GWAS संशोधनात शेकडो प्रजाती प्रकल्प पूर्ण केले आहेत, संशोधकांना 100 पेक्षा जास्त लेख प्रकाशित करण्यात मदत केली आहे आणि एकत्रित प्रभाव घटक 500 पर्यंत पोहोचला आहे.
● सर्वसमावेशक बायोइन्फॉरमॅटिक्स विश्लेषण: वर्कफ्लोमध्ये SNP-ट्रेट असोसिएशन विश्लेषण, उमेदवार जीन्सचा संच आणि त्यांच्या संबंधित कार्यात्मक भाष्याचा समावेश आहे.
●अत्यंत कुशल बायोइन्फर्मेटिक्स टीम आणि लहान विश्लेषण चक्र: प्रगत जीनोमिक्स विश्लेषणातील उत्तम अनुभवासह, BMKGene चा कार्यसंघ झटपट टर्नअराउंड वेळेसह सर्वसमावेशक विश्लेषणे वितरीत करतो.
●पोस्ट-विक्री समर्थन:आमची वचनबद्धता 3 महिन्यांच्या विक्री-पश्चात सेवा कालावधीसह प्रकल्प पूर्ण होण्याच्या पलीकडे विस्तारते. या वेळी, आम्ही परिणामांशी संबंधित कोणत्याही शंकांचे निराकरण करण्यासाठी प्रोजेक्ट फॉलो-अप, समस्यानिवारण सहाय्य आणि प्रश्नोत्तर सत्रे ऑफर करतो.
सेवा तपशील आणि आवश्यकता
| क्रमवारीचा प्रकार | शिफारस केलेले लोकसंख्या स्केल | अनुक्रम धोरण | न्यूक्लियोटाइड आवश्यकता |
| संपूर्ण जीनोम सिक्वेन्सिंग | 200 नमुने | 10x | एकाग्रता: ≥ 1 ng/ µL एकूण रक्कम≥ ३०ng मर्यादित किंवा कोणतीही ऱ्हास किंवा दूषितता नाही |
| स्पेसिफिक-लोकस ॲम्प्लीफाइड फ्रॅगमेंट (SLAF) | टॅग खोली: 10x टॅगची संख्या: < 400 Mb: WGS ची शिफारस केली जाते < 1Gb: 100K टॅग 1Gb > 2Gb: 300K टॅग कमाल 500k टॅग | एकाग्रता ≥ 5 ng/µL एकूण रक्कम ≥ 80 एनजी नॅनोड्रॉप OD260/280=1.6-2.5 Agarose जेल: नाही किंवा मर्यादित ऱ्हास किंवा दूषितता
|
साहित्य निवड
विविध जाती, उपप्रजाती, लँडरेस/जीनबँक्स/मिश्र कुटुंब/वन्य संसाधने
विविध जाती, उपप्रजाती, लँडरेस
हाफ-सिब फॅमिली/फुल-सिब फॅमिली/वन्य संसाधने
सेवा कार्य प्रवाह
प्रयोग डिझाइन
नमुना वितरण
आरएनए काढणे
ग्रंथालय बांधकाम
अनुक्रम
डेटा विश्लेषण
विक्रीनंतर सेवा
खालील विश्लेषणाचा समावेश आहे:
- जीनोम-वाइड असोसिएशन विश्लेषण: LM, LMM, EMMAX, FASTLMM मॉडेल
- उमेदवार जीन्सचे कार्यात्मक भाष्य
एसएनपी-ट्रेट असोसिएशन विश्लेषण – मॅनहॅटन प्लॉट
SNP-ट्रेट असोसिएशन विश्लेषण - QQ प्लॉट
प्रकाशनांच्या क्युरेट केलेल्या संग्रहाद्वारे BMKGene च्या de GWAS सेवांनी सुलभ केलेल्या प्रगतीचे अन्वेषण करा:
Lv, L. et al. (2023) 'जीनोम-वाइड असोसिएशन स्टडीद्वारे रेझर क्लॅम सिनोनोव्हाकुला कॉन्स्ट्रिक्टामध्ये अमोनिया सहिष्णुतेच्या अनुवांशिक आधाराची अंतर्दृष्टी',जलचर, 569, पृ. 739351. doi: 10.1016/J.AQUACULTURE.2023.739351.
ली, एक्स आणि इतर. (2022) '398 फॉक्सटेल बाजरी ऍक्सेसन्सच्या मल्टी-ओमिक्स विश्लेषणात जीनोमिक क्षेत्रे आढळतात जी पाळीवपणा, चयापचय गुणधर्म आणि दाहक-विरोधी प्रभावांशी संबंधित आहेत',आण्विक वनस्पती, 15(8), पृ. 1367–1383. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.
ली, जे. आणि इतर. (२०२२) 'जीनोम-वाइड असोसिएशन मॅपिंग ऑफ हललेस बेरली फेनोटाइप इन ड्रॉफ्ट एन्व्हायर्नमेंट',वनस्पती विज्ञान मध्ये फ्रंटियर्स, 13, पी. 924892. doi: 10.3389/FPLS.2022.924892/BIBTEX.
झाओ, एक्स आणि इतर. (2021) 'GmST1, जे सल्फोट्रान्सफेरेस एन्कोड करते, सोयाबीन मोज़ेक व्हायरस स्ट्रेन G2 आणि G3 ला प्रतिकार देते',वनस्पती, पेशी आणि पर्यावरण, ४४(८), पृ. २७७७–२७९२. doi: 10.1111/PCE.14066.
