उत्क्रांती आनुवंशिकी
सेवा फायदे
टाकगी वगैरे.,वनस्पती जर्नल, 2013
●सर्वसमावेशक जैव सूचनात्मक विश्लेषण:अनुवांशिक विविधतेचा अंदाज सक्षम करणे, जे प्रजातींच्या उत्क्रांतीच्या संभाव्यतेचे प्रतिबिंबित करते आणि अभिसरण उत्क्रांती आणि समांतर उत्क्रांतीच्या कमीत कमी प्रभावासह प्रजातींमधील विश्वसनीय फिलोजेनेटिक संबंध प्रकट करते
●वैकल्पिक सानुकूलित विश्लेषण: जसे की न्यूक्लियोटाइड आणि एमिनो ऍसिडस् स्तरावरील फरकांवर आधारित विचलन वेळ आणि गतीचा अंदाज.
●विस्तृत कौशल्य आणि प्रकाशन रेकॉर्ड: BMKGene ने 15 वर्षांहून अधिक काळ लोकसंख्या आणि उत्क्रांतीविषयक अनुवांशिक प्रकल्पांमध्ये प्रचंड अनुभव जमा केला आहे, ज्यामध्ये हजारो प्रजातींचा समावेश आहे, आणि नेचर कम्युनिकेशन्स, मॉलिक्युलर प्लांट्स, प्लांट बायोटेक्नॉलॉजी जर्नल इ. मध्ये प्रकाशित 1000 हून अधिक उच्च-स्तरीय प्रकल्पांमध्ये योगदान दिले आहे.
● अत्यंत कुशल बायोइन्फर्मेटिक्स टीम आणि लहान विश्लेषण चक्र: प्रगत जीनोमिक्स विश्लेषणातील उत्तम अनुभवासह, BMKGene चा कार्यसंघ झटपट टर्नअराउंड वेळेसह सर्वसमावेशक विश्लेषणे वितरीत करतो.
● विक्रीनंतरचे समर्थन:आमची वचनबद्धता 3 महिन्यांच्या विक्री-पश्चात सेवा कालावधीसह प्रकल्प पूर्ण होण्याच्या पलीकडे विस्तारते. या वेळी, आम्ही परिणामांशी संबंधित कोणत्याही शंकांचे निराकरण करण्यासाठी प्रोजेक्ट फॉलो-अप, समस्यानिवारण सहाय्य आणि प्रश्नोत्तर सत्रे ऑफर करतो.
सेवा तपशील आणि आवश्यकता
| क्रमवारीचा प्रकार | शिफारस केलेले लोकसंख्या स्केल | अनुक्रम धोरण | न्यूक्लियोटाइड आवश्यकता |
| संपूर्ण जीनोम सिक्वेन्सिंग | ≥ 30 व्यक्ती, प्रत्येक उपसमूहातील ≥ 10 व्यक्तींसह
| 10x | एकाग्रता: ≥ 1 ng/ µL एकूण रक्कम≥ ३०ng मर्यादित किंवा कोणतीही ऱ्हास किंवा दूषितता नाही |
| स्पेसिफिक-लोकस ॲम्प्लीफाइड फ्रॅगमेंट (SLAF) | टॅग खोली: 10x टॅगची संख्या: <400 Mb: WGS ची शिफारस केली जाते <1Gb: 100K टॅग 1Gb >2Gb: 300K टॅग कमाल 500k टॅग | एकाग्रता ≥ 5 ng/µL एकूण रक्कम ≥ 80 एनजी नॅनोड्रॉप OD260/280=1.6-2.5 Agarose जेल: नाही किंवा मर्यादित ऱ्हास किंवा दूषितता
|
सेवा कार्य प्रवाह
प्रयोग डिझाइन
नमुना वितरण
ग्रंथालय बांधकाम
अनुक्रम
डेटा विश्लेषण
विक्रीनंतर सेवा
सेवेमध्ये लोकसंख्येची रचना (फायलोजेनेटिक ट्री, पीसीए, लोकसंख्या स्तरीकरण चार्ट), लोकसंख्येची विविधता आणि लोकसंख्येची निवड (लिंकेज असंतुलन, फायदेशीर साइट्सची निवडक स्वीप-निवड) यांचा समावेश होतो. सेवेमध्ये सानुकूलित विश्लेषण देखील समाविष्ट केले जाऊ शकते (उदा. विचलन वेळ, जनुक प्रवाह).
*येथे दाखवलेले डेमो परिणाम सर्व BMKGENE सह प्रकाशित जीनोमचे आहेत
1. उत्क्रांती विश्लेषणामध्ये फायलोजेनेटिक वृक्ष, लोकसंख्येची रचना आणि अनुवांशिक फरकांवर आधारित पीसीएचे बांधकाम समाविष्ट आहे.
फायलोजेनेटिक वृक्ष सामान्य पूर्वज असलेल्या प्रजातींमधील वर्गीकरण आणि उत्क्रांती संबंधांचे प्रतिनिधित्व करते.
PCA चे उद्दिष्ट उप-लोकसंख्येमधील जवळीक पाहण्याचे आहे.
लोकसंख्येची रचना एलील फ्रिक्वेन्सीच्या संदर्भात अनुवांशिकदृष्ट्या वेगळ्या उप-लोकसंख्येची उपस्थिती दर्शवते.
चेन, इ. अल.,PNAS, २०२०
2.निवडक स्वीप
निवडक स्वीप म्हणजे अशा प्रक्रियेचा संदर्भ आहे ज्याद्वारे एक फायदेशीर साइट निवडली जाते आणि लिंक केलेल्या तटस्थ साइटची वारंवारता वाढविली जाते आणि लिंक न केलेल्या साइट्सची वारंवारता कमी केली जाते, परिणामी प्रादेशिक घट होते.
निवडक स्वीप प्रदेशांवरील जीनोम-व्यापी शोधाची प्रक्रिया एका विशिष्ट पायरीवर (10 Kb) स्लाइडिंग विंडोमध्ये (100 Kb) सर्व SNP च्या जनुकीय अनुवांशिक निर्देशांक (π，Fst, Tajima's D) ची गणना करून केली जाते.
न्यूक्लियोटाइड विविधता (π)
ताजिमाचे डी
फिक्सेशन इंडेक्स (Fst)
वू, इ. अल.,आण्विक वनस्पती, 2018
3.जीन फ्लो
वू, इ. अल.,आण्विक वनस्पती, 2018
4.लोकसंख्याशास्त्रीय इतिहास
झांग, इ. अल.,निसर्ग पर्यावरणशास्त्र आणि उत्क्रांती, २०२१
5. विचलन वेळ
झांग, इ. अल.,निसर्ग पर्यावरणशास्त्र आणि उत्क्रांती, २०२१
BMKGene च्या उत्क्रांती अनुवांशिक सेवांद्वारे प्रकाशने तयार केलेल्या संग्रहाद्वारे सुलभ केलेल्या प्रगतीचे अन्वेषण करा:
हसन्यार, एके इ. (२०२३) 'होल-जीनोम रिक्वेंसिंगद्वारे एपिस सेराना सेराना लार्व्हामध्ये सॅकब्रूड व्हायरस रेझिस्टन्सशी संबंधित एसएनपी आण्विक मार्कर आणि उमेदवार जीन्सचा शोध',आण्विक विज्ञान आंतरराष्ट्रीय जर्नल, 24(7). doi: 10.3390/IJMS24076238.
चाय, जे. आणि इतर. (2022) 'वन्य, अनुवांशिकदृष्ट्या शुद्ध चिनी राक्षस सॅलमँडरचा शोध नवीन संवर्धन संधी निर्माण करतो',प्राणीशास्त्रीय संशोधन, 2022, Vol. 43, अंक 3, पृष्ठे: 469-480, 43(3), pp. 469-480. doi: 10.24272/J.ISSN.2095-8137.2022.101.
हान, एम. वगैरे. (2022) 'किंघाई-तिबेट पठारावरील स्थानिक एलिमस सिबिरिकस एल.चा भौतिकशास्त्रीय नमुना आणि लोकसंख्या उत्क्रांती इतिहास',वनस्पती विज्ञान मध्ये फ्रंटियर्स, 13, पी. 882601. doi: 10.3389/FPLS.2022.882601/BIBTEX.
वांग, जे. आणि इतर. (2022) 'क्रोमोसोम-स्तरीय जीनोम असेंब्लीमधून लाँगन उत्क्रांतीमधील जीनोमिक अंतर्दृष्टी आणि लाँगन ऍक्सेसन्सचे लोकसंख्या जीनोमिक्स',फलोत्पादन संशोधन, 9. doi: 10.1093/HR/UHAC021.
