पूर्ण लांबीचे एमआरएनए सिक्वेंसींग -पॅकबिओ
वैशिष्ट्ये
Poly पॉली-ए एमआरएनए पासून सीडीएनए संश्लेषण त्यानंतर लायब्ररीची तयारी
CC सीसीएस मोडमध्ये अनुक्रम, एचआयएफआय वाचते
The पूर्ण-लांबीच्या उतार्‍याचे अनुक्रम
● विश्लेषणास संदर्भ जीनोमची आवश्यकता नाही; तथापि, ते नोकरीस असू शकते
● बायोइन्फॉर्मेटिक विश्लेषण ट्रान्सक्रिप्ट्सचे विश्लेषण आयसोफॉर्म एलएनसीआरएनए, जनुक फ्यूजन, पॉली-en डिनेलेशन आणि जनुक रचना सक्षम करते
सेवा फायदे
●उच्च अचूकता: एचआयएफआय अचूकतेसह वाचते> 99.9% (क्यू 30), एनजीएसशी तुलना करण्यायोग्य
● वैकल्पिक स्प्लिंग विश्लेषण: संपूर्ण ट्रान्सक्रिप्ट्सचे अनुक्रम आयसोफॉर्म ओळख आणि वैशिष्ट्य सक्षम करते
●विस्तृत कौशल्य: 1100 हून अधिक पॅकबीओ पूर्ण-लांबीच्या ट्रान्सक्रिप्टोम प्रकल्प पूर्ण करण्याच्या आणि 2300 पेक्षा जास्त नमुन्यांची प्रक्रिया करण्याच्या ट्रॅक रेकॉर्डसह, आमची कार्यसंघ प्रत्येक प्रकल्पात अनुभवाची संपत्ती आणते.
●विक्रीनंतरचे समर्थन: आमची वचनबद्धता 3 महिन्यांच्या विक्री-सेवा कालावधीसह प्रकल्प पूर्ण होण्यापलीकडे वाढते. यावेळी, आम्ही निकालांशी संबंधित कोणत्याही प्रश्नांची पूर्तता करण्यासाठी प्रोजेक्ट पाठपुरावा, समस्यानिवारण सहाय्य आणि प्रश्नोत्तर सत्रे ऑफर करतो.
नमुना आवश्यकता आणि वितरण
| लायब्ररी | अनुक्रम धोरण | डेटा शिफारस केलेला | गुणवत्ता नियंत्रण |
| पॉलीया समृद्ध एमआरएनए सीसीएस लायब्ररी | पॅकबीओ सिक्वेल II Pacbio Revio | 20/40 जीबी 5/10 मीटर सीसीएस | Q30≥85% |
नमुना आवश्यकता:
न्यूक्लियोटाइड्स:
● वनस्पती:
रूट, स्टेम किंवा पाकळी: 450 मिलीग्राम
पान किंवा बियाणे: 300 मिलीग्राम
फळ: 1.2 ग्रॅम
● प्राणी:
हृदय किंवा आतडे: 300 मिलीग्राम
व्हिसेरा किंवा मेंदू: 240 मिलीग्राम
स्नायू: 450 मिलीग्राम
हाडे, केस किंवा त्वचा: 1 जी
Ro आर्थ्रोपॉड्स:
कीटक: 6 जी
क्रस्टेसिया: 300 मिलीग्राम
● संपूर्ण रक्त: 1 ट्यूब
● पेशी: 106 पेशी
| कंक. (एनजी/μL) | रक्कम (μg) | शुद्धता | सचोटी |
| ≥ 100 | ≥ 1.0 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 जेलवर मर्यादित किंवा कोणतेही प्रथिने किंवा डीएनए दूषितता दर्शविली. | वनस्पतींसाठी: rin≥7.5; प्राण्यांसाठी: rin≥8.0; 5.0≥ 28 एस/18 एस 1.0; मर्यादित किंवा कोणतीही बेसलाइन उंची नाही |
शिफारस केलेले नमुना वितरण
कंटेनर: 2 एमएल सेंट्रीफ्यूज ट्यूब (टिन फॉइलची शिफारस केलेली नाही)
नमुना लेबलिंग: गट+प्रतिकृती उदा. ए 1, ए 2, ए 3; बी 1, बी 2, बी 3.
शिपमेंट:
1. कोरड्या-बर्फ: नमुने पिशव्या मध्ये पॅक करणे आवश्यक आहे आणि कोरड्या बर्फात पुरणे आवश्यक आहे.
२. आरएनएस्टेबल ट्यूब: आरएनए नमुने आरएनए स्टेबिलायझेशन ट्यूब (उदा. आरएनएस्टेबल) मध्ये वाळवले जाऊ शकतात आणि खोलीच्या तपमानात पाठविले जाऊ शकतात.
सेवा कामाचा प्रवाह
प्रयोग डिझाइन
नमुना वितरण
आरएनए एक्सट्रॅक्शन
ग्रंथालय बांधकाम
अनुक्रम
डेटा विश्लेषण
विक्रीनंतर सेवा
खालील विश्लेषणाचा समावेश आहे:
● कच्चा डेटा गुणवत्ता नियंत्रण
● वैकल्पिक पॉलीएडेनेलेशन विश्लेषण (एपीए)
● फ्यूजन ट्रान्सक्रिप्ट विश्लेषण
● वैकल्पिक स्प्लिंग विश्लेषण
● बेंचमार्किंग युनिव्हर्सल सिंगल-कॉपी ऑर्थोलॉज (बुस्को) विश्लेषण
● कादंबरी ट्रान्सक्रिप्ट विश्लेषण: कोडिंग सीक्वेन्स (सीडीएस) आणि फंक्शनल एनोटेशनचा अंदाज
N एलएनसीआरएनए विश्लेषण: एलएनसीआरएनए आणि लक्ष्यांचा अंदाज
● मायक्रोसेटलाइट आयडेंटिफिकेशन (एसएसआर)
बसको विश्लेषण
वैकल्पिक स्प्लिंग विश्लेषण
वैकल्पिक पॉलीएडेनेलेशन विश्लेषण (एपीए)
कादंबरी उतार्‍याची कार्यात्मक भाष्य
या वैशिष्ट्यीकृत प्रकाशनात बीएमकेजीनच्या नॅनोपोरच्या पूर्ण-लांबीच्या एमआरएनए सिक्वेंसींग सर्व्हिसेसद्वारे सुलभ केलेल्या प्रगतीचे अन्वेषण करा.
मा, वाय. एट अल. . 110709. डोई: 10.1016/j.ygeno.2023.110709.
चाओ, प्र. एट अल. (2019) 'पोपुलस स्टेम ट्रान्सक्रिप्टोमची डेव्हलपमेंटल डायनेमिक्स', प्लांट बायोटेक्नॉलॉजी जर्नल, 17 (1), पीपी. 206-2219. doi: 10.1111/pbi.12958.
डेंग, एच. एट अल. . 5808. डीओआय: 10.3390/आयजेएमएस 23105808/एस 1.
हुआ, एक्स. एट अल. . doi: 10.1038/S42003-022-03000-z.
लिऊ, एम. एट अल. . 363. डीओआय: 10.3390/कीटक 13040363/एस 1.
वांग, लिजुन एट अल. (2019) 'रिसिनस कम्युनिटी', बीएमसी जेनोमिक्स, २० (१), पीपी. १-१– मधील रिकिनोलिक acid सिड बायोसिंथेसिसच्या चांगल्या प्रकारे समजून घेण्यासाठी इल्युमिना आरएनए सिक्वेंसींगसह पीएसीबीआयओ सिंगल-रेणू रीअल-टाइम विश्लेषणाचा वापर करून ट्रान्सक्रिप्टोम जटिलतेचे सर्वेक्षण. doi: 10.1186/s12864-019-5832-9.
