●विस्तृत कौशल्य आणि प्रकाशन रेकॉर्ड: जमा झाल्यामुळे, बीएमकेजीनने 90 पेक्षा जास्त तुलनात्मक जीनोमिक्स प्रकल्प पूर्ण केले आहेत, एक संचयी प्रभाव घटक 900 पर्यंत पोहोचला आहे.
●व्यापक बायोइन्फॉरमॅटिक्स विश्लेषण: विश्लेषणे पॅकेजमध्ये आठ सामान्यत: आवश्यक विश्लेषणे आहेत, जे चांगल्या प्रकारे डिझाइन केलेले रेडी-टू-प्रकाशन आकडेवारी प्रदान करतात आणि निकालांचे सुलभ स्पष्टीकरण देण्यास परवानगी देतात
●अत्यंत कुशल बायोइन्फॉरमॅटिक्स टीम आणि लघु विश्लेषण चक्र: तुलनात्मक जीनोमिक्स विश्लेषणाच्या उत्कृष्ट अनुभवासह, बीएमकेजीनची टीम थोड्या काळामध्ये विविध वैयक्तिकृत विश्लेषणाच्या मागणीची पूर्तता करते
●विक्रीनंतरचे समर्थन:आमची वचनबद्धता 3 महिन्यांच्या विक्री-सेवा कालावधीसह प्रकल्प पूर्ण होण्यापलीकडे आहे. यावेळी, आम्ही निकालांशी संबंधित कोणत्याही प्रश्नांची पूर्तता करण्यासाठी प्रोजेक्ट पाठपुरावा, समस्यानिवारण सहाय्य आणि प्रश्नोत्तर सत्रे ऑफर करतो.
अंदाजे वळण-वेळ | प्रजातींची संख्या | विश्लेषणे |
30 कार्य दिवस | 6 - 12 | जीन फॅमिली क्लस्टरिंग जनुक कौटुंबिक विस्तार आणि संकुचन फिलोजेनेटिक वृक्ष बांधकाम डायव्हर्जन्स वेळ अंदाज (जीवाश्म कॅलिब्रेशन आवश्यक) एलटीआर अंतर्भूत वेळ (वनस्पतींसाठी) संपूर्ण जीनोम डुप्लिकेशन (वनस्पतींसाठी) निवडक दबाव Synteny विश्लेषण |
● जनुक कुटुंब
● फिलोजेनेटिक्स
● डायव्हर्जन्स वेळ
● निवडक दबाव
● synteny विश्लेषण
ऊतकांसाठी
प्रजाती | ऊतक | सर्वेक्षण | पॅकबीओ सीसीएस |
प्राणी | व्हिस्ट्रल टिशू | 0.5 ~ 1 ग्रॅम | ≥ 3.5 ग्रॅम |
स्नायू ऊतक | |||
≥ 5.0 ग्रॅम | |||
≥ 5.0 मिली | |||
सस्तन प्राणी रक्त | |||
≥ 0.5 मिली | |||
पोल्ट्री/फिश रक्त | |||
वनस्पती | ताजे पान | 1 ~ 2 जी | ≥ 5.0 ग्रॅम |
पाकळी/स्टेम | 1 ~ 2 जी | ≥ 10.0 ग्रॅम | |
रूट/बियाणे | 1 ~ 2 जी | .0 20.0 ग्रॅम | |
पेशी | सुसंस्कृत सेल | - | ≥ 1 x 108 |
जीनोम सीक्वेन्स फाइल्स (.फास्ट) आणि जवळच्या संबंधित प्रजातींच्या भाष्य फायली (.जीएफएफ 3)
*येथे दर्शविलेले डेमो निकाल बायोमार्कर तंत्रज्ञानासह प्रकाशित केलेल्या जीनोमचे आहेत
1. एलटीआर घाला वेळ अंदाजः इतर प्रजातींच्या तुलनेत राई जीनोममध्ये एलटीआर-आरटीएस अंतर्भूत वेळेत एक अनोखा द्विपक्षीय वितरण दर्शविला गेला. सर्वात अलीकडील शिखर सुमारे 0.5 दशलक्ष वर्षांपूर्वी दिसू लागले.
ली गुआंग एट अल.,निसर्ग अनुवंशशास्त्र, 2021
२. चायोटे (सेकिअम एडूल) वर फाइलोजेनी आणि जनुक कौटुंबिक विश्लेषण: जीन कुटुंबातील चायोटे आणि इतर 13 संबंधित प्रजातींचे विश्लेषण करून, चायोटे सापाच्या झुबकेशी संबंधित असल्याचे आढळले (ट्रायकोसॅन्थेस एंजुइना). सुमारे 27-45 एमवायए मध्ये सापाच्या आसपासच्या चायोटे आणि संपूर्ण जीनोम डुप्लिकेशन (डब्ल्यूजीडी) चायोटमध्ये 25 ± 4 एमवायएमध्ये पाळले गेले, जे कुकुइबिटासी मधील तिसरे डब्ल्यूजीडी कार्यक्रम आहे.
Fu a et al.,फलोत्पादन संशोधन, 2021
S. सेन्टेनी विश्लेषण: फळांच्या विकासाच्या फायटोहर्मोन्सशी संबंधित काही जीन्स चायोटे, सर्प लबाडी आणि स्क्वॅशमध्ये आढळली. चायोटे आणि स्क्वॅशमधील परस्परसंबंध चायोटे आणि सर्पच्या भड्यांपेक्षा किंचित जास्त आहे.
Fu a et al.,फलोत्पादन संशोधन, 2021
Ge. जीन कौटुंबिक विश्लेषणः जी.थर्बेरी आणि जी. डेव्हिड्सोनी जीनोममधील जीन कौटुंबिक विस्तार आणि आकुंचन यावर केग समृद्धी दर्शविते की स्टिरॉइड बायोसिंथेसिस आणि ब्रॅसिनोस्टेरॉईड बायोसिंथेसिस संबंधित जीन्सचा विस्तार केला गेला.
यांग झेड एट अल.,बीएमसी जीवशास्त्र, 2021
Whe. व्होल जीनोम डुप्लिकेशन विश्लेषण: 4 डीटीव्ही आणि केएस वितरण विश्लेषणाने संपूर्ण जीनोम डुप्लिकेशन इव्हेंट दर्शविला. इंट्रास्पेसीजच्या शिखरांनी डुप्लिकेशन इव्हेंट दर्शविले. छेदनबिंदूच्या शिखरांनी स्पेशिएशन इव्हेंट दर्शविले. विश्लेषणाने असे सूचित केले की इतर तीन जवळपास संबंधित प्रजातींशी तुलना केल्यास ओ. युरोपिया अलीकडेच मोठ्या प्रमाणात जनुकांच्या डुप्लिकेशनमधून गेले.
राव जी एट अल.,फलोत्पादन संशोधन, 2021
बीएमके प्रकरण
प्रिक्लेशिवाय गुलाब: आर्द्रता अनुकूलतेशी जोडलेली जीनोमिक अंतर्दृष्टी
प्रकाशित: राष्ट्रीय विज्ञान पुनरावलोकन, 2021
अनुक्रम धोरणः
'बासे चेकाटा'(आर.Wichurainan) जीनोम:
अंदाजे. 93 x pacbio + अंदाजे. 90 x नॅनोपोर + 267 एक्स इल्युमिना
की परिणाम
१. उच्च गुणवत्ता आर .विचुरियाना जीनोम दीर्घ-वाचन अनुक्रम तंत्राचा वापर करून तयार केले गेले होते, जे 530.07 एमबीचे असेंब्ली उत्पन्न करतात (अंदाजे जीनोम आकार फ्लो सायटोमेट्रीद्वारे अंदाजे 525.9 एमबी आणि जीनोम सर्वेक्षणानुसार 525.5 होता ; हेटरोझीगिटी सुमारे 1.03%होती). बुसको अंदाजे स्कोअर 93.9%होता. “ओल्ड ब्लश” (हॅप्लूब) ची तुलना केल्यास, या जीनोमची गुणवत्ता आणि पूर्णता बेस सिंगल-बेस अचूकता आणि एलटीआर असेंब्ली इंडेक्स (एलएआय = 20.03) द्वारे पुष्टी केली गेली. आर .विचुरियाना जीनोममध्ये 32,674 प्रोटीन कोडिंग जीन्स आहेत.
२. मल्टी-ओमिक्स संयुक्त विश्लेषण, तुलनात्मक जीनोमिक्स, ट्रान्सक्रिप्टोमिक्स, अनुवांशिक लोकसंख्येचे क्यूटीएल विश्लेषण, आर. विचुरियाना आणि रोजा चिनेनेसिस यांच्यातील महत्त्वपूर्ण स्पष्टीकरण उघडकीस आले. तसेच, क्यूटीएलमधील संबंधित जीन्सचे अभिव्यक्ति भिन्नता स्टेम प्रिक्ले पॅटर्निंगशी संबंधित असण्याची शक्यता आहे.
बासेईच्या थॉर्नलेस आणि रोजा चिन्नेसिस यांच्यात तुलनात्मक जीनोमिक्स अॅनायसिस, सिंटनी विश्लेषण, जनुक कौटुंबिक क्लस्टर, विस्तार आणि आकुंचन विश्लेषणासह, मोठ्या संख्येने भिन्नता उघडकीस आली, जे गुलाबांमधील महत्त्वपूर्ण वैशिष्ट्यांशी संबंधित आहेत. एनएसी आणि एफएआर 1/एफआरएस जनुक कुटुंबातील अद्वितीय विस्तार ब्लॅक स्पॉटच्या प्रतिकारांशी संबंधित असण्याची शक्यता आहे.
बीटी आणि हॅप्लूब जीनोम दरम्यान तुलनात्मक जीनोमिक्स विश्लेषण.
झोंग, एम., इत्यादी. “गुलाब न करता गुलाब: आर्द्रता अनुकूलतेशी जोडलेली जीनोमिक अंतर्दृष्टी”राष्ट्रीय विज्ञान पुनरावलोकन, 2021;, nwab092.