Exclusive Agency for Korea

उत्पादने

Bmkmanu s3000_spatial ट्रान्सक्रिप्टोम

स्थानिक ट्रान्सक्रिप्टोमिक्स वैज्ञानिक नावीन्यपूर्णतेच्या अग्रभागी उभे आहेत, संशोधकांना त्यांचे स्थानिक संदर्भ जपून ऊतींमध्ये जटिल जनुक अभिव्यक्तीच्या नमुन्यांचा शोध घेण्यास सक्षम बनवतात. विविध प्लॅटफॉर्मवर, बीएमकेजीनने बीएमकेएमएएनयू एस 3000 स्थानिक ट्रान्सक्रिप्टोम चिप विकसित केला आहे, 3.5µm च्या वर्धित रिझोल्यूशनचा अभिमान बाळगला आहे, सबसेल्युलर श्रेणीपर्यंत पोहोचला आहे आणि बहु-स्तरीय रिझोल्यूशन सेटिंग्ज सक्षम केल्या आहेत. एस 3000 चिप, अंदाजे 4 दशलक्ष स्पॉट्स असलेले, स्पॅटियलली बारकोड कॅप्चर प्रोबसह भरलेल्या मणीसह स्तरित मायक्रोव्हल्स कार्यरत आहेत. स्थानिक बारकोड्ससह समृद्ध असलेली सीडीएनए लायब्ररी एस 3000 चिपमधून तयार केली जाते आणि त्यानंतर इल्युमिना नोव्हासेक प्लॅटफॉर्मवर अनुक्रमित केली जाते. स्थानिक बारकोड नमुने आणि यूएमआयचे संयोजन व्युत्पन्न केलेल्या डेटाची अचूकता आणि विशिष्टता सुनिश्चित करते. बीएमकेएमएएनयू एस 3000 चिप अत्यंत अष्टपैलू आहे, बहु-स्तरीय रिझोल्यूशन सेटिंग्ज ऑफर करते जे वेगवेगळ्या ऊतींवर आणि तपशीलांच्या इच्छित स्तरांवर बारीक ट्यून केले जाऊ शकते. ही अनुकूलता विविध स्थानिक ट्रान्सक्रिप्टोमिक्स अभ्यासासाठी एक उत्कृष्ट निवड म्हणून चिपला स्थान देते, कमीतकमी आवाजासह अचूक स्थानिक क्लस्टरिंग सुनिश्चित करते. बीएमकेएमएएनयू एस 3000 सह सेल सेगमेंटेशन तंत्रज्ञानाचा वापर पेशींच्या सीमेवर ट्रान्सक्रिप्शनल डेटाचे मर्यादा घालण्यास सक्षम करते, परिणामी विश्लेषण होते ज्यास थेट जैविक अर्थ आहे. याउप्पर, एस 3000 च्या सुधारित रिझोल्यूशनमुळे प्रत्येक सेलमध्ये आढळलेल्या जनुकांची संख्या आणि यूएमआयची संख्या जास्त होते, ज्यामुळे स्थानिक ट्रान्सक्रिप्शनच्या नमुन्यांचे आणि पेशींच्या क्लस्टरिंगचे अधिक अचूक विश्लेषण सक्षम होते.

आमच्याशी संपर्क साधा

सेवा तपशील

बायोइन्फॉरमॅटिक्स

डेमो निकाल

एस 3000 आणि एस 1000 मधील फरक

Bmkmanu S3000 स्थानिक ट्रान्सक्रिप्टोम तांत्रिक योजना

वैशिष्ट्ये

- रिझोल्यूशन: 3.5 µm

- स्पॉट व्यास: 2.5 µm

- स्पॉट्सची संख्या: अंदाजे 4 दशलक्ष

- 3 संभाव्य कॅप्चर क्षेत्र स्वरूप: 6.8 मिमी * 6.8 मिमी, 11 मिमी * 11 मिमी किंवा 15 मिमी * 20 मिमी

- प्रत्येक बारकोड मणी 4 विभागांनी बनविलेल्या प्राइमरसह लोड केली जाते:

M एमआरएनए प्राइमिंग आणि सीडीएनए संश्लेषणासाठी पॉली (डीटी) शेपटी,

Mp एम्प्लिफिकेशन पूर्वाग्रह सुधारण्यासाठी अद्वितीय आण्विक अभिज्ञापक (यूएमआय)

• स्थानिक बारकोड

The आंशिक वाचन 1 अनुक्रम प्राइमरचे बंधनकारक अनुक्रम

- एच आणि ई आणि विभागांचे फ्लोरोसेंट डाग

- सेल सेगमेंटेशन तंत्रज्ञान वापरण्याची शक्यता: प्रत्येक सेलच्या सीमा निश्चित करण्यासाठी आणि प्रत्येक सेलला जनुक अभिव्यक्ती योग्यरित्या नियुक्त करण्यासाठी एच आणि ई स्टेनिंग, फ्लोरोसेंट स्टेनिंग आणि आरएनए अनुक्रमांचे एकत्रीकरण. सेल बिनवर आधारित डाउनस्ट्रीम अवकाशीय प्रोफाइलिंग विश्लेषणावर प्रक्रिया करणे.

- मल्टीलेव्हल रिझोल्यूशन विश्लेषण साध्य करणे शक्यः इष्टतम रिझोल्यूशनमध्ये विविध ऊतकांच्या वैशिष्ट्यांचे निराकरण करण्यासाठी 100म ते 3.5 यूएम पर्यंतचे लवचिक बहु-स्तरीय विश्लेषण.

बीएमकेमनु एस 3000 चे फायदे

-कॅप्चर स्पॉट्सचे दुप्पट 4 दशलक्ष: um. um च्या सुधारित रिझोल्यूशनसह, प्रति सेल उच्च जनुक आणि यूएमआय शोधात. याचा परिणाम ट्रान्सक्रिप्शनल प्रोफाइलवर आधारित पेशींच्या सुधारित क्लस्टरिंगमध्ये परिणाम होतो, ऊतींच्या संरचनेशी जुळणार्‍या उत्कृष्ट तपशीलांसह.

- उप-सेल्युलर रिझोल्यूशन:प्रत्येक कॅप्चर एरियामध्ये> 2.5 µm व्यासासह 2 दशलक्ष स्थानिक बारकोड स्पॉट्स आणि स्पॉट सेंटर दरम्यान 5 µm अंतर, उप-सेल्युलर रेझोल्यूशन (5 µ मी) सह स्थानिक ट्रान्सक्रिप्टोम विश्लेषण सक्षम करते.

-बहु-स्तरीय रिझोल्यूशन विश्लेषण:इष्टतम रिझोल्यूशनमध्ये विविध ऊतकांच्या वैशिष्ट्यांचे निराकरण करण्यासाठी 100 μm ते 5 μm पर्यंतचे लवचिक बहु-स्तरीय विश्लेषण.

अदृषूक“एका स्लाइडमध्ये तीन” सेल सेगमेंटेशन तंत्रज्ञान वापरण्याची शक्यता:फ्लूरोसेंस स्टेनिंग, एच आणि ई स्टेनिंग आणि एकाच स्लाइडवर आरएनए अनुक्रम एकत्रित करणे, आमचे "थ्री-इन-वन" विश्लेषण अल्गोरिदम त्यानंतरच्या सेल-आधारित ट्रान्सक्रिप्टोमिक्ससाठी सेल सीमांची ओळख पटवते.

अदृषूकएकाधिक सिक्वेंसींग प्लॅटफॉर्मसह सुसंगत: दोन्ही एनजी आणि दीर्घ-वाचन अनुक्रम उपलब्ध.

अदृषूक1-8 सक्रिय कॅप्चर क्षेत्राची लवचिक डिझाइन: कॅप्चर क्षेत्राचा आकार लवचिक आहे, 3 स्वरूप (6.8 मिमी * 6.8 मिमी., 11 मिमी * 11 मिमी आणि 15 मिमी * 20 मिमी) वापरणे शक्य आहे.

अदृषूकएक स्टॉप सेवा: क्रायो-सेक्शनिंग, स्टेनिंग, टिशू ऑप्टिमायझेशन, स्थानिक बारकोडिंग, लायब्ररीची तयारी, अनुक्रम आणि बायोइन्फॉरमॅटिक्स यासह सर्व अनुभव आणि कौशल्य-आधारित चरण समाकलित करते.

अदृषूकसर्वसमावेशक बायोइन्फॉरमॅटिक्स आणि परिणामांचे वापरकर्ता-अनुकूल व्हिज्युअलायझेशन:पॅकेजमध्ये 29 विश्लेषणे आणि 100+ उच्च-गुणवत्तेच्या आकडेवारीचा समावेश आहे, सेल स्प्लिटिंग आणि स्पॉट क्लस्टरिंग व्हिज्युअलायझेशन आणि सानुकूलित करण्यासाठी इनहाउस विकसित सॉफ्टवेअरच्या वापरासह.

अदृषूकसानुकूलित डेटा विश्लेषण आणि व्हिज्युअलायझेशन: भिन्न संशोधन विनंत्यांसाठी उपलब्ध

अदृषूकअत्यंत कुशल तांत्रिक संघ: मानवी, उंदीर, सस्तन प्राण्यांसह 250 पेक्षा जास्त ऊतक प्रकार आणि 100+ प्रजातींचा अनुभव आहे.

अदृषूकसंपूर्ण प्रकल्पावरील रीअल-टाइम अद्यतने: प्रायोगिक प्रगतीच्या पूर्ण नियंत्रणासह.

अदृषूकसिंगल-सेल एमआरएनए अनुक्रमांसह पर्यायी संयुक्त विश्लेषण

सेवा वैशिष्ट्ये

नमुना आवश्यकता

लायब्ररी

अनुक्रम धोरण

डेटा शिफारस केलेला

गुणवत्ता नियंत्रण

ऑक्टोबर-एम्बेडेड क्रायो नमुने

(इष्टतम व्यास: अंदाजे.

6 × 6 × 6 मिमी)

प्रति नमुना 2 ब्लॉक

प्रयोगासाठी 1, बॅकअपसाठी 1

एस 3000 सीडीएनए लायब्ररी

इल्युमिना पीई 150

160 के पीई प्रति 100υ मी वाचते (250 जीबी)

रिन> 7

नमुना तयारी मार्गदर्शन आणि सेवा वर्कफ्लोवरील अधिक माहितीसाठी, कृपया मोकळ्या मनानेबीएमकेजीन तज्ञ

सेवा कामाचा प्रवाह

नमुना तयार करण्याच्या टप्प्यात, उच्च-गुणवत्तेची आरएनए मिळू शकेल हे सुनिश्चित करण्यासाठी प्रारंभिक बल्क आरएनए एक्सट्रॅक्शन चाचणी केली जाते. टिशू ऑप्टिमायझेशन टप्प्यात विभाग डागलेले आणि व्हिज्युअलाइज्ड असतात आणि ऊतकांमधून एमआरएनए सोडण्याच्या पारगम्यतेची परिस्थिती अनुकूलित केली जाते. त्यानंतर ऑप्टिमाइझ्ड प्रोटोकॉल लायब्ररीच्या बांधकामादरम्यान लागू केले जाते, त्यानंतर अनुक्रम आणि डेटा विश्लेषण केले जाते.

संपूर्ण सेवा वर्कफ्लोमध्ये रिअल-टाइम अद्यतने आणि क्लायंट पुष्टीकरणांचा समावेश आहे जो प्रतिसादात्मक अभिप्राय लूप राखण्यासाठी, गुळगुळीत प्रकल्प अंमलबजावणी सुनिश्चित करतो.

मागील: Dnbseq प्री-मेड लायब्ररी

पुढील:

बीएमकेएमएएनयू एस 3000 द्वारे व्युत्पन्न केलेल्या डेटाचे विश्लेषण “बीएसटीएमएट्रिक्स” या सॉफ्टवेअरचा वापर करून केले जाते, जे स्वतंत्रपणे बीएमकेजीनने डिझाइन केलेले आहे, सेल स्तर आणि मल्टीलेव्हल रेझोल्यूशन जनुक अभिव्यक्ति मॅट्रिक्स तयार करते. तिथून, एक मानक अहवाल व्युत्पन्न केला आहे ज्यामध्ये डेटा गुणवत्ता नियंत्रण, अंतर्गत-नमुना विश्लेषण आणि आंतर-गट विश्लेषण समाविष्ट आहे.

- डेटा गुणवत्ता नियंत्रण:

- डेटा आउटपुट आणि गुणवत्ता स्कोअर वितरण

- प्रति स्पॉट जनुक शोध

- ऊतक कव्हरेज

- अंतर्गत-नमुना विश्लेषण:

- जनुक समृद्धी

- स्पॉट क्लस्टरिंग, कमी आयाम विश्लेषणासह

- क्लस्टर्स दरम्यान भिन्न अभिव्यक्ती विश्लेषण: मार्कर जीन्सची ओळख

- कार्यशील भाष्य आणि मार्कर जीन्सची समृद्धी

- आंतर-गट विश्लेषण

-दोन्ही नमुन्यांमधून स्पॉट्सची पुन्हा एकत्रिकरण (उदा. रोगग्रस्त आणि नियंत्रण) आणि पुन्हा क्लस्टर

- प्रत्येक क्लस्टरसाठी मार्कर जीन्सची ओळख

- कार्यशील भाष्य आणि मार्कर जीन्सची समृद्धी

- गटांमधील समान क्लस्टरची भिन्न अभिव्यक्ती

याव्यतिरिक्त, बीएमकेजीनने विकसित केलेले “बीएसटीव्यूअर” हे एक वापरकर्ता-अनुकूल साधन आहे जे वापरकर्त्यास जनुक अभिव्यक्ती आणि स्पॉट क्लस्टरिंगला वेगवेगळ्या रिझोल्यूशनवर दृश्यमान करण्यास सक्षम करते.

बीएमकेजीन अचूक सिंगल-सेल रेझोल्यूशनमध्ये स्थानिक प्रोफाइलिंग सेवा देते (सेल बिन किंवा मल्टीलेव्हल स्क्वेअर बिनवर आधारित 100um ते 3.5um वर आधारित).

एस 3000 स्लाइडवरील ऊतक विभागांमधील स्थानिक प्रोफाइलिंग डेटा खाली खाली उत्कृष्ट कामगिरी करतो.

केस स्टडी 1: माउस ब्रेन

एस 3000 सह माउस ब्रेन सेक्शनच्या विश्लेषणामुळे प्रति सेलमध्ये 2000 डॉलर जनुकांचे मध्यम अनुक्रम असलेल्या ~ 94 000 पेशींची ओळख झाली. 3.5 यूएमच्या सुधारित रिझोल्यूशनचा परिणाम ट्रान्सक्रिप्शनल नमुन्यांवर आधारित पेशींचे अतिशय तपशीलवार क्लस्टरिंग झाले, पेशींच्या क्लस्टर्सने मेंदूत भिन्न रचनांची नक्कल केली. ऑलिगोडेन्ड्रोसाइट्स आणि मायक्रोग्लिया पेशी म्हणून क्लस्टर केलेल्या पेशींच्या वितरणाचे दृश्यमान करून हे सहजपणे पाळले जाते, जे जवळजवळ केवळ अनुक्रमे राखाडी आणि पांढर्‍या पदार्थात स्थित आहेत.

एक्सव्ही (1)

केस स्टडी 2: माउस गर्भ

एक्सव्ही (1)

एस 3000 सह माउस गर्भाच्या विभागाच्या विश्लेषणामुळे प्रति सेल ~ 1600 जनुकांच्या मध्यम अनुक्रमांसह ~ 2200 000 पेशींची ओळख झाली. 3.5 यूएमच्या सुधारित रिझोल्यूशनचा परिणाम ट्रान्सक्रिप्शनल नमुन्यांवर आधारित पेशींचे अतिशय तपशीलवार क्लस्टरिंग झाले, डोळ्याच्या क्षेत्रात 12 क्लस्टर्स आणि मेंदूच्या क्षेत्रात 28 क्लस्टर्स.

एक्सव्ही (1)

अंतर्गत-नमुना विश्लेषण सेल क्लस्टरिंग:

एक्सव्ही (1)

मार्कर जीन्स ओळख आणि स्थानिक वितरण:

एक्सव्ही (1)

-उच्च उप-सेल्युलर रिझोल्यूशन: एस 1000 स्लाइडच्या तुलनेत एस 3000 च्या प्रत्येक कॅप्चर क्षेत्रामध्ये 2.5 µm व्यासासह 4 दशलक्ष स्थानिक बारकोड स्पॉट्स आणि स्पॉट सेंटर दरम्यान 3.5 µm अंतर, उच्च सब-सेल्युलर रिझोल्यूशनसह स्थानिक ट्रान्सक्रिप्टोम विश्लेषण सक्षम करते (स्क्वेअर बिन: 3.5 µm).

- उच्च कॅप्चर कार्यक्षमता: एस 1000 स्लाइडच्या तुलनेत, मेडीयन_मी 30% वरून 70% पर्यंत वाढते, मेडीयन_जेन 30% वरून 60% पर्यंत वाढते

एस 1000 चिपची योजना: