डी नोव्हो बॅक्टेरियल जीनोम असेंब्ली
आम्ही पूर्ण बॅक्टेरियल जीनोम असेंब्ली सेवा प्रदान करतो, 0 अंतराची हमी देतो. असेंब्लीसाठी नॅनोपोर आणि PacBio सारख्या लाँग-रीड सिक्वेन्सिंग तंत्रज्ञान आणि असेंबली व्हॅलिडेशन आणि ONT रीड्सच्या त्रुटी सुधारण्यासाठी Illumina सह शॉर्ट-रीड सिक्वेन्सिंग एकत्रित करून हे शक्य आहे. आमची सेवा विशिष्ट संशोधन उद्दिष्टे पूर्ण करून असेंब्ली, फंक्शनल एनोटेशन आणि प्रगत बायोइन्फॉरमॅटिक विश्लेषणातून संपूर्ण जैव सूचनात्मक कार्यप्रवाह प्रदान करते. ही सेवा विविध अनुवांशिक आणि जीनोमिक अभ्यासांसाठी अचूक संदर्भ जीनोम विकसित करण्यास सक्षम करते. याव्यतिरिक्त, हे स्ट्रेन ऑप्टिमायझेशन, अनुवांशिक अभियांत्रिकी आणि सूक्ष्मजीव तंत्रज्ञान विकास यासारख्या अनुप्रयोगांसाठी आधार बनवते, ज्यामुळे वैज्ञानिक अंतर्दृष्टी आणि जैवतंत्रज्ञानविषयक नवकल्पना पुढे नेण्यासाठी विश्वासार्ह आणि अंतर-मुक्त जीनोमिक डेटाची खात्री करणे आवश्यक आहे.
सेवा वैशिष्ट्ये
● जीनोम पूर्णतेच्या इच्छित डिग्रीवर अवलंबून निवडण्यासाठी दोन संभाव्य पर्यायांसह.
● मसुदा जीनोम पर्याय: Illumina NovaSeq PE150 सह शॉर्ट-रीड सिक्वेन्सिंग.
● 0 अंतर जीनोम पूर्ण करा.
● जीनोम असेंब्लीसाठी Nanopore PromethION 48 किंवा PacBio Revio वर दीर्घ-वाचनीय अनुक्रम.
● जीनोम प्रमाणीकरण आणि त्रुटी दुरुस्ती (नॅनोपोर) किंवा मसुदा जीनोम तयार करण्यासाठी Illumina NovaSeq वर शॉर्ट-रीड सिक्वेन्सिंग.
सेवा फायदे
●झिरो-गॅप जीनोमची हमी: हे लांब रीड सिक्वेन्सिंग (Nanopore किंवा PacBio) सह Illumina सिक्वेन्सिंगच्या एकत्रीकरणामुळे आहे.
●बायोइन्फॉरमॅटिक्स वर्कफ्लो पूर्ण करा:यामध्ये जीनोम असेंब्ली आणि एकाधिक जीनोमिक घटकांचा अंदाज, कार्यात्मक जनुक भाष्य आणि सर्कोस प्लॉट सारख्या जीनोम व्हिज्युअलायझेशनचा समावेश आहे.
●विस्तृत कौशल्य: 20,000 पेक्षा जास्त मायक्रोबियल जीनोम एकत्र करून, BMKGENE एक दशकाहून अधिक अनुभव, एक अत्यंत कुशल विश्लेषण टीम, सर्वसमावेशक सामग्री आणि विक्रीनंतरचा उत्कृष्ट समर्थन आणते.
●पोस्ट-विक्री समर्थन:आमची वचनबद्धता 3 महिन्यांच्या विक्री-पश्चात सेवा कालावधीसह प्रकल्प पूर्ण होण्याच्या पलीकडे विस्तारते. या वेळी, आम्ही परिणामांशी संबंधित कोणत्याही शंकांचे निराकरण करण्यासाठी प्रोजेक्ट फॉलो-अप, समस्यानिवारण सहाय्य आणि प्रश्नोत्तर सत्रे ऑफर करतो.
●एकाधिक क्रमवारी धोरणे उपलब्ध:विविध संशोधन उद्दिष्टे आणि जीनोम पूर्णतेच्या आवश्यकतांसाठी.
सेवा तपशील
| सेवा | अनुक्रम धोरण |
| मसुदा जीनोम | Illumina PE150 100x |
| 0 गॅप जीनोम | नॅनोपोर 100x + Illumina PE150 100x Or Pacbio HiFi 30x + Illumina PE150 100x (पर्यायी) |
नमुना आवश्यकता:
| एकाग्रता (ng/µL) | एकूण रक्कम (µg) | आवाज (µL) | OD260/280 | OD260/230 | |
| PacBio | ≥२० | ≥१.२ | ≥२० | १.७-२.२ | ≥1.0 |
| नानोपोर | ≥40 | ≥2 | ≥२० | १.७-२.२ | १.०-३.० |
| इल्युमिना | ≥१ | ≥०.०६ | ≥२० | - | - |
· जीवाणू: ≥3.5x1010 पेशी
सेवा कार्य प्रवाह
नमुना वितरण
ग्रंथालय बांधकाम
अनुक्रम
डेटा विश्लेषण
विक्रीनंतर सेवा
खालील विश्लेषणाचा समावेश आहे:
● डेटा गुणवत्ता नियंत्रण अनुक्रमित करणे
● जीनोम असेंब्ली
● जीनोम घटक विश्लेषण: सीडीएस आणि एकाधिक जीनोमिक घटकांचा अंदाज
● एकाधिक सामान्य डेटाबेस (GO, KEGG, इ) आणि प्रगत डेटाबेस (CARD, VFDB, इ.) सह कार्यात्मक भाष्य
● जीनोम व्हिज्युअलायझेशन
आम्ही जीनोम सहज प्रवेश करण्यायोग्य फास्टा स्वरूपात आणि जीनोम भाष्य फाइल (gff) प्रदान करतो.
जनुक भाष्य – जा
जनुक भाष्य - CAZY कार्बोहायड्रेट
जीनोम व्हिज्युअलायझेशन - सर्कोस प्लॉट
प्रकाशनांच्या क्युरेट केलेल्या संग्रहाद्वारे BMKGene च्या बॅक्टेरियल जीनोम असेंब्ली सेवांद्वारे सुलभ केलेल्या प्रगतीचे अन्वेषण करा.
दाई, डब्ल्यू. आणि इतर. (2023) 'स्वस्थ मानवी कोलनातून अल्सरेटिव्ह कोलायटिसच्या उपचारांसाठी सुरक्षित आणि नवीन प्रोबायोटिक बॅक्टेरियम म्हणून बॅक्टेरॉइड्स युनिफॉर्मिस F18-22 चा शोध',आंतरराष्ट्रीय आण्विक विज्ञान जर्नल, 24(19), p. 14669. doi: 10.3390/IJMS241914669/S1.
कांग, प्र. इ. (2021) 'मल्टीड्रग-प्रतिरोधक प्रोटीयस मिराबिलिस चीनमधील वन्यजीवांपासून ब्लाओएक्सए-1 आणि ब्लाएनडीएम-1 वाहून नेणारे वेगळे करतात: सार्वजनिक आरोग्याचा धोका वाढतो',एकात्मिक प्राणीशास्त्र, 16(6), pp. 798–809. doi: 10.1111/1749-4877.12510.
वांग, टीटी वगैरे. (2017) 'एन्डोफाईट बॅसिलस फ्लेक्सस KLBMP 4941 चा संपूर्ण जीनोम क्रम त्याच्या वनस्पती वाढीस प्रोत्साहन देणारी यंत्रणा आणि मीठ सहनशीलतेसाठी अनुवांशिक आधार प्रकट करतो',जर्नल ऑफ बायोटेक्नॉलॉजी, 260, पृ. 38-41. doi: 10.1016/J.JBIOTEC.2017.09.001.
वांग, एक्स आणि इतर. (२०२१) 'मल्टिपल-रिप्लिकॉन रेझिस्टन्स प्लाझमिड्स ऑफ क्लेब्सिएला मेडिएट एक्सटेन्सिव्ह डिसेमिनेशन ऑफ अँटीमाइक्रोबियल जीन्स',मायक्रोबायोलॉजी मध्ये फ्रंटियर्स, 12, पी. 754931. doi: 10.3389/FMICB.2021.754931/BIBTEX.
