
अॅम्प्लिकॉन सिक्वेंसींग (16 एस/18 एस/आयटीएस)
एम्प्लिकॉन (16 एस/18 एस/आयटीएस) इल्युमिना सह अनुक्रम मायक्रोबियल प्रोफाइल त्यांच्या अनुक्रमांनुसार ओळखून आणि नंतर प्रत्येक नमुन्यात आणि नमुन्यांमधील समुदाय समृद्धता आणि विविधता समजून घेण्याचा प्रयत्न करून सूक्ष्मजीव विविधतेचे विश्लेषण करण्याची एक पद्धत आहे. बीएमक्लॉड अॅम्प्लिकॉन (एनजीएस) पाइपलाइन 16 एस, 18 एस, त्याच्या आणि एकाधिक फंक्शनल जीन्सच्या विश्लेषणास अनुमती देते. हे रीड ट्रिमिंग, पेअर-एंड रीड असेंब्ली आणि गुणवत्ता मूल्यांकन यापासून सुरू होते, त्यानंतर सहा वेगवेगळ्या विश्लेषण विभागांमध्ये वापरल्या जाणार्या ऑपरेशनल टॅक्सोनॉमिक युनिट्स (ओटीयू) तयार करण्यासाठी समान वाचनांचे क्लस्टरिंग होते. वर्गीकरण भाष्य प्रत्येक नमुन्यांच्या सापेक्ष विपुलता आणि रचनांची माहिती प्रदान करते, तर अल्फा आणि बीटा विविधता अनुक्रमे आणि नमुने दरम्यान सूक्ष्मजीव विविधतेवर लक्ष केंद्रित करते. गटांमधील भिन्न विश्लेषणामध्ये ओटीयू आढळतात जे पॅरामीट्रिक आणि नॉन-पॅरामीट्रिक चाचण्या वापरुन भिन्न आहेत, तर परस्परसंबंध विश्लेषण या फरक पर्यावरणीय घटकांशी संबंधित आहे. अखेरीस, कार्यात्मक जनुक विपुलतेचा अंदाज मार्कर जनुक विपुलतेवर आधारित केला जातो, प्रत्येक नमुन्यात कार्य आणि पर्यावरणाची अंतर्दृष्टी प्रदान करते ..
