● सिक्वेंसींग प्लॅटफॉर्म: पॅकबीओ रेव्हो
● सिक्वेंसींग मोड: सीसीएस (एचआयएफआय वाचतो)
Target लक्ष्य प्रदेशाचे प्रवर्धन त्यानंतर एचआयएफआय एसएमआरटी बेल लायब्ररीच्या तयारीपूर्वी अॅमप्लिकॉनचा लिंकिंग
●उच्च वर्गीकरण ठराव: टीहान शॉर्ट-एम्प्लिकॉन अनुक्रम,प्रजाती स्तरावर उच्च ओटीयू वर्गीकरण दर सक्षम करणे.
●अत्यंत अचूक बेस कॉलिंग: पॅकबीओ सीसीएस मोड सिक्वेंसींग (एचआयएफआय वाचतो).
●अलगाव-मुक्त: पर्यावरणीय नमुन्यांमध्ये सूक्ष्मजीव रचनाची वेगवान ओळख.
●व्यापकपणे लागू: विविध सूक्ष्मजीव समुदाय अभ्यास.
●व्यापक बायोइन्फॉर्मेटिक विश्लेषण: डेटाबेस, भाष्य, ओटीयू/एएसव्हीच्या बाबतीत विविध विश्लेषणासह नवीनतम QIIME2 पॅकेज (मायक्रोबियल इकोलॉजीमध्ये परिमाणात्मक अंतर्दृष्टी).
●विस्तृत कौशल्य: दरवर्षी हजारो अॅम्प्लिकॉन सिक्वेंसींग प्रकल्पांसह, बीएमकेजीनने दशकभर अनुभव, एक अत्यंत कुशल विश्लेषण कार्यसंघ, सर्वसमावेशक सामग्री आणि विक्रीनंतरचे उत्कृष्ट समर्थन आणले.
लायब्ररी | अनुक्रम धोरण | डेटा शिफारस केलेला |
अॅमप्लिकॉन | Pacbio Revio | 10/30/50 के टॅग (सीसीएस) |
एकाग्रता (एनजी/µL) | एकूण रक्कम (µg) | खंड (µL) |
≥5 | ≥0.3 | ≥20 |
द्रव नायट्रोजनमधील नमुने hours- hours तास गोठवा आणि द्रव नायट्रोजनमध्ये किंवा -80 डिग्री ते दीर्घकालीन आरक्षणामध्ये ठेवा. कोरड्या बर्फासह नमुना शिपिंग आवश्यक आहे.
खालील विश्लेषणाचा समावेश आहे:
● कच्चा डेटा गुणवत्ता नियंत्रण
● ओटीयू क्लस्टरिंग/डी-नाईस (एएसव्ही)
● ओटीयू भाष्य
● अल्फा विविधता विश्लेषण: शॅनन, सिम्पसन आणि ऐससह एकाधिक अनुक्रमणिका.
● बीटा विविधता विश्लेषण
Group आंतर-गट विश्लेषण
● परस्परसंबंध विश्लेषण: पर्यावरणीय घटक आणि रचना आणि विविधता दरम्यान
● 16 एस फंक्शनल जनुक अंदाज
वर्गीकरण वितरणाचा हिस्टोग्राम
समुदाय वितरण फिलोजेनेटिक वृक्ष
अल्फा विविधता विश्लेषण: निपुण
बीटा विविधता विश्लेषण: पीसीओए
आंतरसमूह विश्लेषण: एनोवा
प्रकाशनांच्या क्युरेटेड संग्रहातून पॅकबीओसह बीएमकेजीनच्या अॅम्प्लिकॉन सिक्वेंसींग सर्व्हिसेसद्वारे सुलभ केलेल्या प्रगतीचे अन्वेषण करा.
जीएओ, एक्स. आणि वांग, एच. (२०२23) 'अल्पाइन मेडोवर दोन वाढत्या टप्प्यांसह अल्पाइन मेरिनो मेंढीमध्ये भिन्न फिनोलॉजी (रीग्रिन वि. 1), पी. 16. डीओआय: 10.3390/किण्वन 9010016/एस 1.
ली, एस. इट अल. . doi: 10.1038/S41522-023-00439-8.
म्यू, एल. एट अल. . 1487. doi: 10.1002/jsfa.11482.
यांग, जे. इत्यादी. . प्रौढ झेब्राफिशमध्ये ऑक्साझोलोन-प्रेरित आतड्यांसंबंधी ऑक्सिडेटिव्ह तणावात, अँटीऑक्सिडेंट्स 2023, खंड. 12, पृष्ठ 192, 12 (1), पी. 192. डीओआय: 10.3390/अँटीओएक्स 12010192.