16S/18S/ITS अँप्लिकॉन सिक्वेन्सिंग-एनजीएस
सेवा वैशिष्ट्ये
● सिक्वेन्सिंग प्लॅटफॉर्म: Illumina NovaSeq.
● 16S, 18S आणि ITS च्या लहान क्षेत्रांचे प्रवर्धन, इतर प्रवर्धन लक्ष्यांसह.
● ॲम्प्लिकॉनचे लवचिक पर्याय.
● एकाधिक प्रवर्धन लक्ष्यांसह मागील प्रकल्प अनुभव.
सेवा फायदे
●अलगाव-मुक्त:पर्यावरणीय नमुन्यांमधील सूक्ष्मजीव रचनांची जलद ओळख.
●उच्च रिझोल्यूशन: पर्यावरणीय नमुन्यांमधील कमी-विपुल घटकांमध्ये.
●व्यापकपणे लागू: विविध सूक्ष्मजीव समुदाय अभ्यास.
●सर्वसमावेशक जैव सूचनात्मक विश्लेषण: नवीनतम QIIME2 पॅकेज (मायक्रोबियल इकोलॉजीमधील परिमाणात्मक अंतर्दृष्टी) डेटाबेस, भाष्य, OTU/ASV च्या दृष्टीने विविध विश्लेषणांसह.
●विस्तृत कौशल्य: दरवर्षी आयोजित केल्या जाणाऱ्या 150 हजार ॲम्प्लिकॉन सीक्वेन्सिंग प्रकल्पांसह, BMKGENE एक दशकाहून अधिक अनुभव, एक अत्यंत कुशल विश्लेषण टीम, सर्वसमावेशक सामग्री आणि उत्कृष्ट विक्री-पश्चात समर्थन आणते.
सेवा तपशील
| लायब्ररी | अनुक्रम धोरण | डेटाची शिफारस केली आहे |
| अँप्लिकॉन | Illumina PE250 | 50/100/300K टॅग (जोड्या वाचा) |
सेवा आवश्यकता
| एकाग्रता (ng/µL) | एकूण रक्कम (एनजी) | आवाज (µL) |
| ≥१ | ≥२०० | ≥२० |
● माती/गाळ: १-२ ग्रॅम
● आतड्यांसंबंधी सामग्री-प्राणी: 0.5-2 ग्रॅम
● आतड्यांसंबंधी सामग्री-कीटक: 0.1-0.25 ग्रॅम
● वनस्पती पृष्ठभाग (समृद्ध गाळ): 0.1-0.5 ग्रॅम
● किण्वन मटनाचा रस्सा समृद्ध गाळ): 0.1-0.5 ग्रॅम
● विष्ठा (मोठे प्राणी): ०.५-२ ग्रॅम
● विष्ठा (उंदीर): 3-5 दाणे
● पल्मोनरी अल्व्होलर लॅव्हेज फ्लुइड: फिल्टर पेपर
● योनीतून स्वॅब: 5-6 स्वॅब
● त्वचा/जननेंद्रियाच्या स्वॅब/लाळ/तोंडी सॉफ्ट टिश्यू/फॅरेंजियल स्वॅब/रेक्टल स्वॅब: 2-3 स्वॅब
● पृष्ठभागावरील सूक्ष्मजीव: फिल्टर पेपर
● वॉटरबॉडी/एअर/बायोफिल्म: फिल्टर पेपर
● एंडोफाईट्स: 1-2 ग्रॅम
● दंत फलक: 0.5-1 ग्रॅम
सेवा कार्य प्रवाह
नमुना वितरण
ग्रंथालय बांधकाम
अनुक्रम
डेटा विश्लेषण
विक्रीनंतर सेवा
खालील विश्लेषणाचा समावेश आहे:
- कच्चा डेटा गुणवत्ता नियंत्रण
- OTU क्लस्टरिंग /De-noise(ASV)
- OTU भाष्य
- अल्फा विविधता विश्लेषण: शॅनन, सिम्पसन आणि एसीईसह एकाधिक निर्देशांक.
- बीटा विविधता विश्लेषण
- आंतर-समूह विश्लेषण
- सहसंबंध विश्लेषण: पर्यावरणीय घटक आणि आउट रचना आणि विविधता दरम्यान
- 16S कार्यात्मक जनुक अंदाज
वर्गीकरण वितरणाचा हिस्टोग्राम
वर्गीकरण विपुलता क्लस्टरिंग उष्णता नकाशा
अल्फा विविधता विश्लेषण: दुर्मिळ वक्र
बीटा विविधता विश्लेषण: NMDS
इंटरग्रुप विश्लेषण: LEFSE बायोमार्कर शोध
प्रकाशनांच्या क्युरेट केलेल्या संग्रहाद्वारे Illumina सह BMKGene च्या amplicon sequencing सेवांद्वारे सुलभ केलेल्या प्रगतीचे अन्वेषण करा.
डोंग, सी. आणि इतर. (2022) 'असेंबली, कोर मायक्रोबायोटा, आणि फंक्शन ऑफ द रिझोस्फियर सॉइल आणि बार्क मायक्रोबायोटा इन युकोमिया उलमोइड्स', फ्रंटियर्स इन मायक्रोबायोलॉजी, 13. doi: 10.3389/FMICB.2022.85531.
ली, वाय. इत्यादी. (2023) 'उंदरांमध्ये गार्डनरेला योनिलिस-प्रेरित बॅक्टेरियल योनिओसिसच्या उपचारांसाठी सिंथेटिक बॅक्टेरियल कन्सोर्टिया प्रत्यारोपण', मायक्रोबायोम, 11(1), pp. 1-14. doi: 10.1186/s40168-023-01497-y
Yang, J., Fu, Y. आणि Liu, H. (2022) 'जमीन-आधारित बंद बायोरेजनरेटिव्ह लाइफ सपोर्ट प्रयोग "लुनर पॅलेस 365" दरम्यान गोळा केलेले हवेतील धूलिकणांचे मायक्रोबायोम्स, पर्यावरणीय मायक्रोबायोम्स, 17(1), pp. 1-20. doi: 10.1186/S40793-022-00399-0/FIGURES/8.
यिन, एस. आणि इतर. (2022) 'नायट्रोजन ट्रान्सफॉर्मेशन कंट्रोल्ड नायट्रोजन लॉस इन कंपोस्टिंगशी संबंधित फंक्शनल जीन्सचे फीडस्टॉक-डिपेंडंट विपुलता', बायोरिसोर्स टेक्नॉलॉजी, 361, पृ. 127678. doi: 10.1016/J.BIORTECH.2022.127678.
