10x जीनोमिक्स व्हिसियम स्थानिक ट्रान्सक्रिप्टोम
तांत्रिक योजना
वैशिष्ट्ये
● रिझोल्यूशन: 100 µ मी
● स्पॉट व्यास: 55 µ मी
Sp स्पॉट्सची संख्या: 4992
● कॅप्चर क्षेत्र: 6.5 x 6.5 मिमी
Bar प्रत्येक बारकोड स्पॉट 4 विभागांनी बनलेल्या प्राइमरसह लोड केला जातो:
- एमआरएनए प्राइमिंग आणि सीडीएनए संश्लेषणासाठी पॉली (डीटी) शेपटी
- एम्प्लिफिकेशन बायस सुधारण्यासाठी अनन्य आण्विक अभिज्ञापक (यूएमआय)
- स्थानिक बारकोड
- आंशिक वाचन 1 अनुक्रम प्राइमरचे बंधनकारक अनुक्रम
Sections विभागांचे एच आणि ई स्टेनिंग
फायदे
●एक स्टॉप सेवा: क्रायो-सेक्शनिंग, स्टेनिंग, टिशू ऑप्टिमायझेशन, स्थानिक बारकोडिंग, लायब्ररीची तयारी, अनुक्रम आणि बायोइन्फॉरमॅटिक्स यासह सर्व अनुभव आणि कौशल्य-आधारित चरण समाकलित करते.
● अत्यंत कुशल तांत्रिक संघ: मानवी, उंदीर, सस्तन प्राण्यांसह 250 पेक्षा जास्त ऊतक प्रकार आणि 100+ प्रजातींचा अनुभव आहे.
●संपूर्ण प्रकल्प वर रीअल-टाइम अद्यतन: प्रायोगिक प्रगतीच्या पूर्ण नियंत्रणासह.
●सर्वसमावेशक मानक बायोइन्फॉरमॅटिक्स:पॅकेजमध्ये 29 विश्लेषणे आणि 100+ उच्च-गुणवत्तेच्या आकडेवारीचा समावेश आहे.
●सानुकूलित डेटा विश्लेषण आणि व्हिज्युअलायझेशन: भिन्न संशोधन विनंत्यांसाठी उपलब्ध.
●सिंगल-सेल एमआरएनए अनुक्रमांसह पर्यायी संयुक्त विश्लेषण
वैशिष्ट्ये
| नमुना आवश्यकता | लायब्ररी | अनुक्रम धोरण | डेटा शिफारस केलेला | गुणवत्ता नियंत्रण |
| ऑक्टोबर-एम्बेडेड क्रायो नमुने (इष्टतम व्यास: अंदाजे 6x6x6 मिमी) प्रति नमुना 2 ब्लॉक | 10x व्हिसियम सीडीएनए लायब्ररी | इल्युमिना पीई 150 | 50 के पीई प्रति स्पॉट वाचते (60 जीबी) | रिन> 7 |
नमुना तयारी मार्गदर्शन आणि सेवा वर्कफ्लोवरील अधिक माहितीसाठी, कृपया मोकळ्या मनानेबीएमकेजीन तज्ञ
सेवा वर्कफ्लो
नमुना तयार करण्याच्या टप्प्यात, उच्च-गुणवत्तेची आरएनए मिळू शकेल हे सुनिश्चित करण्यासाठी प्रारंभिक बल्क आरएनए एक्सट्रॅक्शन चाचणी केली जाते. टिशू ऑप्टिमायझेशन टप्प्यात विभाग डागलेले आणि व्हिज्युअलाइज्ड असतात आणि ऊतकांमधून एमआरएनए सोडण्याच्या पारगम्यतेची परिस्थिती अनुकूलित केली जाते. त्यानंतर ऑप्टिमाइझ्ड प्रोटोकॉल लायब्ररीच्या बांधकामादरम्यान लागू केले जाते, त्यानंतर अनुक्रम आणि डेटा विश्लेषण केले जाते.
संपूर्ण सेवा वर्कफ्लोमध्ये रिअल-टाइम अद्यतने आणि क्लायंट पुष्टीकरणांचा समावेश आहे जो प्रतिसादात्मक अभिप्राय लूप राखण्यासाठी, गुळगुळीत प्रकल्प अंमलबजावणी सुनिश्चित करतो.
खालील विश्लेषणाचा समावेश आहे:
डेटा गुणवत्ता नियंत्रण:
o डेटा आउटपुट आणि गुणवत्ता स्कोअर वितरण
ओ जनुक शोध प्रति स्पॉट
ओ टिशू कव्हरेज
अंतर्गत-नमुना विश्लेषण:
ओ जनुक समृद्धी
ओ स्पॉट क्लस्टरिंग, कमी आयाम विश्लेषणासह
o क्लस्टर्समधील भिन्न अभिव्यक्ती विश्लेषण: मार्कर जीन्सची ओळख
ओ फंक्शनल एनोटेशन आणि मार्कर जीन्सची समृद्धी
आंतर-गट विश्लेषण
o दोन्ही नमुने (उदा. रोगग्रस्त आणि नियंत्रण) पासून स्पॉट्सची पुन्हा एकत्रिकरण आणि पुन्हा क्लस्टर
o प्रत्येक क्लस्टरसाठी मार्कर जीन्सची ओळख
ओ फंक्शनल एनोटेशन आणि मार्कर जीन्सची समृद्धी
o गटांमधील समान क्लस्टरची भिन्न अभिव्यक्ती
अंतर्गत-नमुना विश्लेषण
स्पॉट क्लस्टरिंग
मार्कर जीन्स ओळख आणि स्थानिक वितरण
आंतर-गट विश्लेषण
दोन्ही गटांचे डेटा संयोजन आणि री-क्लस्टर
नवीन क्लस्टर्सचे मार्कर जीन्स
या वैशिष्ट्यीकृत प्रकाशनांमध्ये बीएमकेजीनच्या स्थानिक ट्रान्सक्रिप्टोमिक्स सेवेद्वारे 10x व्हिसियमद्वारे सुलभ केलेल्या प्रगतीचे अन्वेषण करा:
चेन, डी. एट अल. .अमेरिकेच्या नॅशनल Academy कॅडमी ऑफ सायन्सेसची कार्यवाही, 120 (30), पी. E2303462120. doi: /10.1073/pnas.2303462120
चेन, वाय. एट अल. (2023) 'स्टील स्पॅटिओटेम्पोरल ट्रान्सक्रिप्टोमिक डेटाचे उच्च-रिझोल्यूशन डिलिनेशन सक्षम करते',बायोइन्फॉरमॅटिक्समध्ये ब्रीफिंग्ज, 24 (2), पीपी. 1-10. doi: 10.1093/बिब/बीबीएडी 068.
लिऊ, सी. इत्यादी. (2022) 'ऑर्किड फुलांच्या विकासामध्ये ऑर्गेनोजेनेसिसचा स्पॅटिओटेम्पोरल las टलस',न्यूक्लिक ids सिडस् संशोधन, 50 (17), पीपी. 9724-9737. doi: 10.1093/nar/gkac773.
वांग, जे. एट अल. .आंतरराष्ट्रीय जर्नल ऑफ बायोलॉजिकल सायन्सेस, 19 (8), पीपी. 2515–2530. doi: 10.7150/ijbs.83510.
