Бүх геномын Bisul BISUL FI TE TE SEES (WGBS)
Бүхэл бүтэн геномын бизулитын дараалал (WGB), Төрийн метилжилтыг (5 метолин) генийг (5 метолин) генийг (5 миль), генийн илэрхийлэл, эсийн илэрхийлэл. WGISE WGISE CERTOLED CYTOSINE-ийг Unmetline-ийн хөрвүүлэлтийг uracilin (c-ийг u) болгон хувиргах, метилжуулсан цитозиныг өөрчлөх нь өөрчлөгдөөгүй. Энэ техник нь нэг үндсэн нарийвчлалтай нягтралыг санал болгож, олон төрлийн метиломыг ашиглан метиломыг ашиглан метиломыг судлах, маш хэвийн бус метиляр хэлбэрийг илтгэх боломжийг олгодог. WGBS-ийг ажиллуулах замаар эрдэмтэд, олон янзын биологийн боловсруулалт, өвчнөөр өвөрмөц ойлголтыг бий болгож чаддаг.
Тангээлгийн байдал
● Лавлах геномыг шаарддаг.
● Ламбда ДНХ нь Bisulfite хөрвүүлэх хэмнэлтийг хянах зорилгоор нэмдэг.
● Illumina Novaseq дээр дараалан шилжих.
Үйлчилгээний давуу тал
●ДНХ метилацийн судалгааны ажилд зориулсан алтан стандарт: Энэхүү төлөвшсөн метиляр хөрвүүлэлт боловсруулах технологи нь өндөр нарийвчлалтай, сайн нөхөн үржихүйтэй байдаг.
●Өргөн хамрах хүрээ, нэг үндсэн тогтоол:геномын өргөн хүрээнд метиляцийн сайтыг илрүүлэх.
●Бүрэн платформ:Дээж боловсруулах, Номын сангийн барилгын ажлыг шалгаж, BIOINFOLOFTECTECTECT-т ШАЛГАХ, БИДЭНД ОРОЛЦОГЧ, ЗОРИУЛСАН.
●Өргөтгөсөн туршлага: WGBS дараалсан төслүүдийн төслүүдийн дагуу BMKGENE, BMKGENE нь арван жилийн турш амжилттай туршлагатай, хамгийн чадварлаг шинжилгээний баг, Борлуулалтын дараахь сайн агуулга,
●Транскриптомын шинжилгээнд нэгдэх боломж: RNA-SEQ гэх мэт бусад Omps-ийн нэгдсэн өгөгдөлтэй холбоотой дүн шинжилгээ хийх боломжийг олгодог.
Дээжийн тодорхойлолт
| Номын сан | Дараалсан стратеги | Санал болгож буй өгөгдлийн гарц | Чанарын шалгалт |
| Bisulfite эмчилсэн | Illumina pe150 | 30x гүн | Q30 ≥ 85% Bisulfite хувиргах> 99% |
Дээжийн шаардлага
| Төвлөрөл (NG / мкл) | Нийт дүн (мкг) | Нэмэмтэй шаардлага | |
| Геномын д импорт | ≥ 5 | ≥ 400 ng | Хязгаарлагдмал доройтол эсвэл бохирдол |
Үйлчилгээний ажлын урсгал
Түүвэрлэлтийг хүргэх
ДНХ-ийн олборлолт
Номын санний барилга
Дараалал
Мэдээллийн дүн шинжилгээ хийх
Мэдээлэл мэдээлэл
Дараахь дүн шинжилгээ хийх:
● түүхий дараалсан чанарын хяналт;
● Лавлах геном руу зураглал хийх;
● 5MC метилжуулсан баазыг илрүүлэх;
● метилацийн хуваарилалт, тэмдэглэгээний дүн шинжилгээ хийх;
● Өөр өөр метилжуулсан бүсийн дүн шинжилгээ (DMRS);
● DMRS-тэй холбоотой генийн функциональ тэмдэглэгээ.
5MC метиляци илрүүлэх: Метилжуулсан сайтын төрөл
Метиляцийн газрын зураг. 5MC метиляци геномын геномын өргөн тархалт
Өндөр метилжуулсан бүсийн тэмдэглэгээ
Ялгаатай метилжуулсан бүсүүд: Холбоотой генүүд
ХӨГЖЛИЙН МЭДЭЭЛЛИЙН МЭДЭЭЛЭЛ: Холбоотой генийн тэмдэглэгээ (Gene Ontology)
BMKGENE-ийн ГЭР БҮЛИЙН ГЭР БҮЛИЙН ГЭР БҮЛИЙН ГЭР БҮЛИЙН ГЭР БҮЛИЙН ГЭР БҮЛИЙН ГЭР БҮЛИЙН ХУДАЛДААНЫ ХУДАЛДААНЫ ТӨЛӨВЛӨГӨӨ.
Сэнс, y. et al. (2020) "БИДНИЙ МЭДЭЭЛЛИЙН МЭДЭЭЛЛИЙН ТУХАЙ ХАМГИЙН БУПТЛЕРИЙН ПРОГЛОЛТЫН НЭГДСЭН НЭГДСЭН НЭГДСЭН НЭГДҮГЭЭРBMC геномикууд, 21 (1), PP. 1-15. DOI: 10.1186 / S12864-020-6751-5.
Zhao, x. et al. (2022) 'RoxyrobibonubleuclecleuctiCle-ийн хор хөнөөлийг Винил хлорид руу илчилсэн.Токсикологи, аж үйлдвэрийн эрүүл мэнд, 38 (7), PP. 377-388. DOI: 10.1177 / 0748233722288109868
Zuo, j. et al. (2020) 'метилжилтийн хоорондох харилцаа, кодчилол, MRNAS, MRNAS, MRNASING READING READING READING READINE,Ургамлын сэтгүүл, 103 (3), PP. 980-994. DOI: 10.11111 / TPJ.14778.
