ТУСГАЙ ЗОРИУЛСАН НУТГИЙН ХУДАЛДААНЫ ХУДАЛДАА (SLAF-SEQ)
Шарааны ая салхи
Техникийн стерит
Тангээлгийн байдал
● PE150-тай Novaseq дээр дараалан.
● Номын сангийн бэлдмэлийг давхар баркодын бэлдмэл, 1000 гаруй дээж авах боломжтой.
● Энэ техникийг лавлагаа геном ашиглан эсвэл ямар ч тохиолдол бүрийн хувьд өөр өөр биоинфатикикикик хоолойгоор ашиглаж болно.
Лавлах геномтой: SNP ба Indel нээлт
Лавлах гемомегүйгээр: дээжийн бөөгнөрөл ба SNP нээлт
● ДахьСилико хотодДизайнын өмнөх үе шатууд олон хязгаарлалттай ферментийн хослолыг геномын дагуух дүрэмт хуваагдлыг олохын тулд дэлгэцийн хослолыг шалгана.
● Урьдчилан туршилтын үеэр гурван ферментийн хослолыг 3 дээжийн хослолыг туршиж, энэ нь төслийнхөө оновчтой хязгаарлалтыг сонгоход ашиглана.
Үйлчилгээний давуу тал
●Генетикийн өндөр тэмдэглэгээ: Өндөр давхцаж буй давхар баркод системийг нэгтгэх нь том популяци, тосгоны тодорхой ногдуулалтыг нэгтгэх боломжийг олгодог.
● Геномоос бага хамаарал: Үүнийг лавлагааны геномтой хамт эсвэл огт хэрэглэж болно.
●Уян хатан схемийн загвар: Ганц фермент, хос фермент, олон фермент, олон фермент боловсруулалт, олон төрлийн ферментүүд, янз бүрийн ферментүүд нь янз бүрийн судалгааны зорилго эсвэл төрөл зүйлүүдийг сонгох боломжтой. Тухайлах ялгац гишүүнСилико хотодУрьдчилан загварыг оновчтой ферментийн загвар зохион бүтээсэн.
● Ферментийн хоол боловсруулахад өндөр үр ашигтай: ТөлбөрСилико хотодХромосом (1 slomosome) -ийнх нь график шошго, давтамжийг бүрдүүлдэг оновчтой дизайныг оновчтой дизайн, дахин давтагдсан дараалал (<5%).
●Өргөтгөсөн туршлага: Манайн баг нь бүх төслөө, ургамал, хөхтөн амьтан, хөхтөн, шувуу, шавьж, усан организмыг цэгцэлж, трек, хөхтөн амьтан,
● Өөрийгөө хөгжсөн биоинформатын ажлын урсгал: BMKGENE нь эцсийн гаралтын найдвартай байдлыг хангахын тулд BMKGENE BIOINFOMION-ийн ажлын урсгалыг боловсруулсан.
Үйлчилгээтэй
| Шинжил шинжилгээний төрөл | Зөвлөмж болгож буй хүн амын хэмжээ | Дараалсан стратеги | |
| Шошгоны нарийсалт | Хаягдлын | ||
| Генетикийн газрын зураг | 2 Эцэг эх ба> 150 үр удам | Эцэг эхчүүд: 20х WGS Offinging: 10x | Гомомын хэмжээ: <400 MB: WGS санал болгож байна <1GB: 100K шошго 1-2GB :: 200K шошго > 2GB: 300K шошго Макс 500K шошго |
| Гомомын өргөн хоорондын холбоо (GWAS) | ≥200 дээж | 10x | |
| Генетикийн хувьсал | ≥30 дээж, Subgroup бүрээс> 10 дээж бүхий> 10 дээж | 10x | |
Үйлчилгээ буруу
Төвлөрөл ≥ 5 ng / мкл
Нийт дүн ≥ 80 ng
Нанодроп OD260 / 280 = 1.6-2.5
Agarose Gel: Үгүй эсвэл хязгаарлагдмал доройтол эсвэл бохирдол
Зөвлөмж болгож буй дээжийн хүргэлт
Сав: 2 мл Centrifuge хоолой
(Ихэнх дээжийн хувьд бид этилийн этилийнхэнд хадгалагдахгүй байхыг зөвлөж байна)
Дээжийн шошго: дээжийг тодорхой шошготой, дээжийн мэдээллийн маягтыг илтгэх шаардлагатай байна.
Ачаа: Хуурай мөс: Дээжийг эхлээд уутанд хийж, хуурай мөсөөр оршуулах хэрэгтэй.
Үйлчилгээний ажлын урсгал
Qc дээжийн qc
Туршилтын туршилт
Slaf-туршилт
Номын сангийн бэлтгэл хаяг
Дараалал
Мэдээллийн дүн шинжилгээ хийх
Худалдах үйлчилгээ
Дараахь дүн шинжилгээ хийх:
- Дараалсан өгөгдөл QC
- Нохшийг авах ажиллагаа
Лавлах гемомегийн зураглал
Лавлах гемомегүйгээр: Кластеринг
- SLAF TAGS-ийн дүн шинжилгээ .: Стефистик, геномоор тархалт
- Маркер нээлт: SNP, SNP, SNEL, SNV, CV дуудлага, тэмдэглэгээ ба тэмдэглэгээ
Chromosomes дээр SLAF TAGS-ийн түгээлт:
Chromosomes дээр SNPS-ийн түгээлт:
SNP тэмдэглэгээ
| Жил | Сэтгүүл | IF | Гарчиг | Хэрэгжүүлэх |
| 2022 | Байгальын харилцаа | 17.694 | Гига-хромосом ба Гига-геномын гига-геном Paoonia ossii | Slaf-gwas |
| 2012. | Шинэ PHYTOCOMOM | 7.433 | ДОТООД ХУДАЛДАН АВЧ БАЙНА УУ шар буурцаг | Slaf-gwas |
| 2022 | Нарийвчилсан судалгааны сэтгүүл | 12.822 | GORSYPIMIACE-ийн ГООГИКИЙН ГАГИКИЙН ГРАФИКИЙН ГРАФИКИЙН ГАГНАЛИЙН ГАЗРЫН ГРАФИКИЙН ГАЗАР Хөвөн шилэн чанар, ургацыг нэгэн зэрэг сайжруулахын тулд дээд түвшний байршлыг илчлэх шинж чанар | Slaf-Evolutary Genetics |
| 2019 | Молекулын ургамал | 10.81 | Хүн амын геномик дүн шинжилгээ, де Ново угсрах нь WEYEY-ийн гарал үүслийг илчилдэг Хувьслын тоглоом шиг будаа | Slaf-Evolutary Genetics |
| 2019 | Байгалийн генетик | 31.616 | Нийтлэг хивсэн хивс, цикринус хивс | Slaf-Linkage газрын зураг |
| 2014 | Байгалийн генетик | 25.455 | Тариалсан самрын генатегийн генатом нь eogume karyotypes, полиплоид руу ойлголтыг өгдөг хувьсал ба ургацын газар. | Slaf-Linkage газрын зураг |
| 2022 | Ургамлын биотехнологийн сэтгүүл | 9.803 | ST1-ийг таних нь үрийн морфологийн үрийн үйл ажиллагаатай холбоотой сонголтыг илтгэнэ шар буурцагны боомт дахь газрын тосны агуулга | Slaf-Targer боловсруулалт |
| 2022 | Молекулын шинжлэх ухааны олон улсын сэтгүүл | 6.208 | Улаан буудай-Леймус Моллис 2ns 2-т тодорхойлох, ДНХ-ийн тэмдэглэгээ, ДНХ-ийн тэмдэглэгээ 2ns 2ns (2D) Үл тоомсорлох хромосом орлуулах | Slaf-Targer боловсруулалт |
| Жил | Сэтгүүл | IF | Гарчиг | Хэрэгжүүлэх |
| 2023 | Ургамлын шинжлэх ухааны хил хязгаар | 6.735 | QTL зураглал, Pryus Pryfolie-ийн жимсний эмчлэх үед элсэн чихрийн агууламж, тэлнэ | Генетикийн газрын зураг |
| 2022 | Ургамлын биотехнологийн сэтгүүл | 8.154 | ST1-ийг тодорхойлох нь шар буурцагны морфологи, газрын тосны агуулга, газрын тосны агуулгыг илтгэнэ
| SNP дуудах |
| 2022 | Ургамлын шинжлэх ухааны хил хязгаар | 6.623 | Ганхах орчинд харгис хэрцгий бус фенотипийн зураглал.
| Gwas |
