Жижиг РНХ-ийн дараалал-Илюмина
Онцлогууд
● Номын сангийн бэлтгэл нь хэмжээ сонгох үе шатыг агуулдаг
● МиРНХ-ийн таамаглал ба тэдгээрийн зорилтод төвлөрсөн биоинформатик шинжилгээ
Үйлчилгээний давуу тал
●Биоинформатикийн цогц шинжилгээ:Мэдэгдэж байгаа болон шинэ miRNA-г тодорхойлох, миРНХ-ийн зорилтуудыг тодорхойлох, холбогдох функциональ тайлбар хийх, олон мэдээллийн сангуудаар баяжуулах (KEGG, GO)
●Чанарын хатуу хяналт: Бид дээж, номын сан бэлтгэхээс эхлээд дараалал, биоинформатик хүртэлх бүх үе шатанд үндсэн хяналтын цэгүүдийг хэрэгжүүлдэг. Энэхүү нягт нямбай хяналт нь өндөр чанартай үр дүнг тогтмол хүргэх боломжийг олгодог.
●Борлуулалтын дараах дэмжлэг: Бидний амлалт нь төслийн гүйцэтгэлээс давж, борлуулалтын дараах 3 сарын үйлчилгээний хугацаа юм. Энэ хугацаанд бид үр дүнтэй холбоотой аливаа асуултыг шийдвэрлэхийн тулд төслийн хяналт, алдааг олж засварлах, асуулт хариултын сессүүдийг санал болгодог.
●Өргөн цар хүрээтэй туршлага: Төрөл бүрийн судалгааны чиглэлээр 300 гаруй зүйлийг хамарсан олон тооны sRNA төслийг амжилттай хааж чадсан туршлагатай манай баг төсөл болгонд арвин туршлага авчирдаг.
Дээжийн шаардлага ба хүргэлт
| Номын сан | Платформ | Санал болгож буй өгөгдөл | Өгөгдлийн QC |
| Хэмжээ сонгосон | Illumina SE50 | 10-20 сая уншдаг | Q30≥85% |
Загвар шаардлага:
Нуклеотидууд:
| Конц.(нг/мкл) | Хэмжээ (мкг) | Цэвэр байдал | Шударга байдал |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Гель дээр уураг, ДНХ-ийн бохирдол хязгаарлагдмал эсвэл огт байхгүй. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; хязгаарлагдмал буюу үндсэн өндөргүй |
● Ургамал:
Үндэс, иш эсвэл дэлбээ: 450 мг
Навч эсвэл үр: 300 мг
Жимс: 1.2 гр
● Амьтан:
Зүрх ба гэдэс: 450 мг
Дотоод эрхтнүүд эсвэл тархи: 240 мг
Булчин: 600 мг
Яс, үс эсвэл арьс: 1.5 гр
● Артропод:
Шавж: 9 гр
Хавч: 450 мг
● Бүхэл цус: 2 хоолой
● Нүднүүд: 106 эсүүд
● Сийвэн ба плазм:6 мл
Санал болгож буй дээжийн хүргэлт
Сав: 2 мл центрифугийн хоолой (цагаан тугалган цаас хэрэглэхийг зөвлөдөггүй)
Загварын шошго: Бүлэг+хуулбар, жишээ нь A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Хүргэлт:
1. Хуурай мөс: Дээжийг уутанд хийж хуурай мөсөнд булах шаардлагатай.
2. RNAstable хоолой: РНХ-ийн дээжийг РНХ тогтворжуулах хоолойд (жишээ нь RNAstable®) хатааж, өрөөний температурт тээвэрлэж болно.
Үйлчилгээний ажлын урсгал
Туршилтын загвар
Дээж хүргэх
РНХ олборлолт
Номын сангийн барилга
Дараалал
Өгөгдлийн шинжилгээ
Борлуулалтын дараах үйлчилгээ
Биоинформатик
● Түүхий өгөгдлийн чанарын хяналт
● sRNA ангилал
● Лавлагаа геномтой зэрэгцүүлэх
● Мэдэгдэж байгаа болон шинэ miRNA-г тодорхойлох
● Дифференциал миРНХ илэрхийллийн шинжилгээ
● МиРНХ-ийн зорилтуудын функциональ тайлбар
МиРНХ-ийг тодорхойлох: бүтэц, гүн
МиРНХ-ийн дифференциал илэрхийлэл - шаталсан кластер
Дифференциалаар илэрхийлэгдсэн миРНХ-ийн зорилтот функцийн тайлбар
BMKGene-ийн sRNA-ийн дараалал тогтоох үйлчилгээгээр хийсэн судалгааны дэвшлийг сонгон шалгаруулсан нийтлэлийн цуглуулгаар судлаарай.
Чен, H. нар. (2023) 'Вирүсийн халдварууд нь Panax notoginseng дахь сапонины биосинтез ба фотосинтезийг саатуулдаг', Ургамлын физиологи ба биохими, 203, х. 108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et al. (2023) "FYVE домэйн агуулсан уураг FREE1 ургамал нь микропроцессорын бүрэлдэхүүн хэсгүүдтэй холбогдож, миРНХ-ийн биогенезийг дарангуйлдаг" гэж EMBO тайлан, 24(1). doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Ю, Ж. нар. (2023) 'MicroRNA Ame-Bantam-3p нь зөгийн бал, Apis mellifera дахь олон эпидермисийн өсөлтийн хүчин зүйлтэй төстэй домэйн 8 генийг (megf8) чиглүүлэх замаар авгалдайн хүүхэлдэйний хөгжлийг хянадаг, Apis mellifera', Олон улсын молекулын шинжлэх ухааны сэтгүүл, 24(6), х . 5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al. (2018) 'Махны чанарт хамаарах МиРНХ ба генийн нэгдсэн шинжилгээ нь Gga-MiR-140-5p тахианы махны булчинд өөх хуримтлагдахад нөлөөлдөг болохыг харуулж байна', эсийн физиологи, биохими, 46(6), хуудас 2421–2433. doi: 10.1159/000489649.
