Ганц бие - нуклей Рна дараалал
Техникийн стерит
Бөөгийн тусгаарлалт нь 10 × геномик хромын хромыг бүрдүүлдэг. Энэ системд, баркод, прайкер, праймерын бөмбөлгүүдийг, праймер, фермент, нэг цөм нь нанолитер, нэг цөм нь гель-той, нэг цөм нь гель бөмбөлгийг үүсгэдэг. Гем үүссэн тохиолдолд эсийн лизис, эсийн лизи, баркодыг гаргах нь эрдэнийн чулуу тус бүрт хийгддэг. MRNA-ийг буцаан нь CDNA Molecules-ийг 10 × Баркулууд руу шилжүүлдэг.
Ан тэмдэгт
● Хөлдөөсөн эдээс ганц цөмийг түдгэлзүүлэхэд бэлтгэх
● Gel Bead-in-in-in-эмульсийг (Gem) үүсэх нь CDNA SINTHESIS
● Нүхэн дэх ирмэг бүрийг 4 хэсгээс бүрдсэн праймеруудтай хамт ачаалдаг.
MRNA Priming болон CDNA SINTHESIS-д зориулсан поли (DT) сүүл,
Давтагдашгүй молекулын танигч (UMI) олшуулалтыг засахын тулд (UMI)
10x Баркод
Хэсэгчилсэн хэсгийг унших 1 дарааллын 1 дарааллын праймер
Сурталчилгаа
Ганц цөмтус РН-ийг дараалан, нэг эсийн RNA дарааллын хязгаарлалт, идэвхжүүлэх хязгаарлалт:
● Хөлдөөсөн дээжийг ашиглах, зөвхөн шинэхэн дээжээр хязгаарлагдахгүй
● Шинжлэхгүй эсийн ферментик эмчилгээнд тусгайлан дарамттай, сөрөг тал нь дарагдсан генийн хэлбэрээр
● Цусны улаан эсийг зайлуулах шаардлагагүй
● Хязгааргүй эсийн диаметр
● Шинжлэх, эмзэг, эмзэг, эмзэг эд эсийг агуулсан жижиг, эмзэг эд эсийн трик
Нэг эсийн рНХ-ээр дүн шинжилгээ хийж, нэг цөмийн дарааллаар дүн шинжилгээ хийж, ганц цөмийн рН-д хамрагдах боломжтой.
| Эс / эд | Шалтгаан |
| Хөлдөх хөлдсөн эд | Шинэхэн эсвэл урт хэмнэлттэй байгууллагыг олж авах боломжгүй байна |
| Булчингийн эс, мегаарароцит, өөх тос ... | Эс эсийн диаметр нь хэрэгслийг оруулахад хэтэрхий том байна |
| Элэг ... | Нэг эсийг ялгаж салгах боломжгүй |
| Нейрон эс, тархи ... | Илүү мэдрэмтгий, стрессдэхэд хялбар, дарааллын үр дүнг өөрчлөх болно |
| Нойр булчирхай, бамбай булчирхай ... | Нэг эсийн түдгэлзүүлэх үйлдвэрлэлд нөлөөлж, эндоген ферментэд баялаг |
Дан цөм ба ганц эс
| Ганц цөм | Ганц эс |
| Хязгааргүй эсийн диаметр | Эсийн диаметр: 10-40 мкм |
| Материал нь хөлдсөн эд байж болно | Материал нь шинэхэн эд байх ёстой |
| Хөлдөөсөн эсийн бага стресс | Фермент эмчилгээ нь эсийн стрессийн хариу урвал үүсгэж болзошгүй юм |
| Цусны улаан эсийг арилгах шаардлагагүй | Цусны улаан эсийг арилгах хэрэгтэй |
| Цөмийн нь биоинфлийг илэрхийлдэг | Бүхэл эс нь биоиникийг илэрхийлдэг |
Анилга
| Дээжийн шаардлага | Номын сан | Дараалсан стратеги | Өгөгдөл санал болгож байна | Чанарын шалгалт |
| Амьтны эд ≥ 200 мг Ургамлын эд ≥ 400 мг | 10x Геномик SN CDNA номын сан | Illumina pe150 | 100K PE нь нүдэнд уншдаг (100-200 GB) | Микроскопын дор ажиглагдсан 700-1200 нум, бөөм |
Түүврийн бэлдмэлийн удирдамж, үйлчилгээний ажлын урсгал дээр дэлгэрэнгүй мэдээлэл авахын тулд A-тэй ярилцах боломжтойBMKGENE-ийн мэргэжилтэн
Үйлчилгээний ажлын урсгал
Дараахь дүн шинжилгээ хийх:
● Чанарын хяналт: Нүдний тоо, генийг илрүүлэх тоо, roma molecules ба илэрхийлэх тоон үзүүлэлт
● Доорх дээжийн дүн шинжилгээ:
Эсийн бөөгнөрөл ба кластерын тэмдэглэгээ
Дифференцийн илэрхийлэл шинжилгээ: Clusters дахь Degs-ийг таних
Функциональ тэмдэглэгээ ба кластерын дегрийг баяжуулах
● Бүлэг бүлгийн дүн шинжилгээ:
Өгөгдөл хослуулах
Дифференциал илэрхийлэл шинжилгээ: бүлгүүдэд DEGS-ийг таних
Функциональ тэмдэглэгээ ба бүлгийн бүлгийг баяжуулах
● Нарийвчилсан шинжилгээ:
Эсийн мөчлөгийн шинжилгээ
Pseudotime шинжилгээ
Гар утасны харилцааны шинжилгээ (гар утас)
GENE SETECTENCE ENSECHNESTEASE шинжилгээ (GSEA)
Дотоод түүврийн дүн шинжилгээ
Эсийн бөөгнөрөл:
Дифференциал илэрхийлэл шинжилгээ: Cluster Degs
Бүлэг бүлгийн дүн шинжилгээ
Дифференциал илэрхийлэл шинжилгээ: Бүлэг Degs
Нарийвчилсан шинжилгээ:
Pseudotime дүн шинжилгээ:
Нүдний мөчлөгийн шинжилгээ:
BMKGENE-ийн нэг цөмийн контенциалыг эдгээр онцлог шинж чанаруудаас 10x хромоор дамжуулж буй дэвшилтэт үйл ажиллагааг судлах.
Wang, L. нар. (2021) 'Ганц эсийг транскриптомик дүн шинжилгээ нь Стероид-тэсвэртэй астма эксма-д дархлааны ландшафтыг илтгэнэ.'Америкийн Нэгдсэн Улсын шинжлэх ухааны академийн хэрэглээ, 118 (2), p. E2005590118. DOI: 10.1073 / PNAS.20055901118
Zheng, h. et al. (2022) 'Генузентийн болон Хашимогийн өвчин, Хашимотогийн микрофизийн дефлютив эсийн дохиолол,Дархиллын урд, 13, p. 879824. DOI: 10.3389 / FIMMU.2022.879824 / BIBTEX.
Tian, h. et al. (2023) 'Нэг эсийн транскриптоми нь генакенели, letokocytity-ийн edukielly tarda (paralichthys olivaceus) -ийг оруулсны дараа лейкоцитын хариу урвал,ANPANDERERERERER, 566, p. 739238. DOI: 10.1016 / J.AQUACENTURE.2023.733.739238.
Yu, y. et al. (2023) 'Фотодинамик эмчилгээ нь ходоодны хорт хавдрын эсрэг утгыг арилгахын тулд дархлааны цэгийн үр дүнг сайжруулдаг.Ходоодны хорт хавдар, 26 (5), PP. 798-813. DOI: 10.1007 / S10120-023-01-01409-X / хэмжигдэхүүн.
