Exclusive Agency for Korea

条形баннер-03

Эпигенетик

  • Hi-C дээр суурилсан хроматин харилцан үйлчлэл

    Hi-C дээр суурилсан хроматин харилцан үйлчлэл

    Hi-C нь ойрын зайд суурилсан харилцан үйлчлэл болон өндөр дамжуулалтын дарааллыг хослуулан геномын тохиргоог олж авахад зориулагдсан арга юм. Энэ арга нь хроматиныг формальдегидтэй холбож, дараа нь задаргаа хийж, зөвхөн ковалентаар холбогдсон хэсгүүд нь холбосон бүтээгдэхүүн үүсгэдэг байдлаар дахин холбодог. Эдгээр холбосон бүтээгдэхүүнийг дараалалд оруулснаар геномын 3D зохион байгуулалтыг судлах боломжтой. Hi-C нь геномын хөнгөн савласан хэсгүүдийн (А тасалгаанууд, эухроматин) болон транскрипцийн хувьд илүү идэвхтэй байх магадлалтай хэсгүүдийн тархалтыг судлах боломжийг олгодог. Hi-C-ийг мөн топологийн холбоотой домэйн (TADs), атираат бүтэцтэй, ижил төстэй илэрхийлэлийн загвартай байх магадлалтай геномын бүсүүдийг тодорхойлох, хроматин гогцоо, уургаар бэхлэгдсэн ДНХ-ийн бүсүүдийг тодорхойлоход ашиглаж болно. ихэвчлэн зохицуулалтын элементүүдээр баяжуулсан. BMKGene-ийн Hi-C дараалал тогтоох үйлчилгээ нь судлаачдад геномын орон зайн хэмжигдэхүүнийг судлах боломжийг олгож, геномын зохицуулалт, түүний эрүүл мэнд, өвчинд үзүүлэх нөлөөг ойлгох шинэ боломжийг нээж өгдөг.

  • Хроматин дархлалын тунадасжилтын дараалал (ChIP-seq)

    Хроматин дархлалын тунадасжилтын дараалал (ChIP-seq)

    Хроматин иммунопреципитаци (CHIP) нь ДНХ холбогч уураг болон тэдгээрийн харгалзах геномикийн зорилтуудыг сонгон баяжуулахын тулд эсрэгбиемүүдийг хөшүүрэг болгодог арга юм. Үүнийг NGS-тэй нэгтгэснээр гистоны өөрчлөлт, транскрипцийн хүчин зүйл болон бусад ДНХ холбогч уурагтай холбоотой ДНХ-ийн зорилтот геномын профайлыг тодорхойлох боломжийг олгодог. Энэхүү динамик арга нь янз бүрийн эсийн төрөл, эд эс эсвэл нөхцөл байдлын хооронд холбох газруудыг харьцуулах боломжийг олгодог. ChIP-Seq-ийн хэрэглээ нь транскрипцийн зохицуулалт, хөгжлийн замыг судлахаас эхлээд өвчний механизмыг тодруулах хүртэлх өргөн хүрээг хамардаг бөгөөд энэ нь геномын зохицуулалтын ландшафтыг ойлгох, эмчилгээний ойлголтыг сайжруулахад зайлшгүй шаардлагатай хэрэгсэл болгодог.

    Платформ: Illumina NovaSeq

  • Бүх геномын бисульфитын дараалал (WGBS)

    Бүх геномын бисульфитын дараалал (WGBS)

    企业微信截图_17374388013932

    Бүхэл геномын бисульфитын дараалал (WGBS) нь ДНХ-ийн метилжилтийг гүнзгий судлах алтан стандарт аргачлал бөгөөд ялангуяа генийн илэрхийлэл ба эсийн үйл ажиллагааны гол зохицуулагч болох цитозины (5-mC) тавдугаар байрыг эзэлдэг. WGBS-ийн үндсэн зарчим нь бисульфитын эмчилгээ бөгөөд метилжүүлсэн цитозиныг урацил (C-U) болгон хувиргах, харин метилжүүлсэн цитозиныг өөрчлөхгүй байх явдал юм. Энэхүү техник нь нэг суурьтай нарийвчлалыг санал болгож, судлаачдад метиломыг иж бүрэн судалж, янз бүрийн нөхцөл байдал, ялангуяа хорт хавдартай холбоотой хэвийн бус метиляцийн хэв маягийг илрүүлэх боломжийг олгодог. WGBS-ийг ашигласнаар эрдэмтэд геномын хэмжээнд байгаа метилизацийн ландшафтын талаар хосгүй ойлголттой болж, биологийн янз бүрийн үйл явц, өвчний үндэс суурь болох эпигенетик механизмын талаар нарийн ойлголттой болно.

  • Өндөр дамжуулалтын дараалал бүхий Транспозазын хүртээмжтэй хроматины шинжилгээ (ATAC-seq)

    Өндөр дамжуулалтын дараалал бүхий Транспозазын хүртээмжтэй хроматины шинжилгээ (ATAC-seq)

    ATAC-seq нь геномын өргөн хүрээтэй хроматин хүртээмжтэй байдлын шинжилгээнд ашигладаг өндөр хүчин чадалтай дарааллын техник юм. Энэ хэрэглээ нь генийн илэрхийлэлд дэлхийн эпигенетик хяналтын цогц механизмыг илүү гүнзгий ойлгох боломжийг олгодог. Энэ арга нь дарааллын адаптеруудыг оруулах замаар нээлттэй хроматин бүсүүдийг нэгэн зэрэг хувааж, шошголохын тулд гиперактив Tn5 транспозазыг ашигладаг. Дараагийн ПГУ-ын олшруулалтын үр дүнд дарааллын номын санг бий болгож, тодорхой орон зай-цаг хугацааны нөхцөлд нээлттэй хроматин бүсүүдийг цогцоор нь тодорхойлох боломжийг олгодог. ATAC-seq нь зөвхөн транскрипцийн хүчин зүйлийг холбох газар эсвэл гистоноор өөрчилсөн тодорхой бүс нутгуудад төвлөрдөг аргуудаас ялгаатай нь хроматин ландшафтын хүртээмжтэй байдлыг цогцоор нь харуулдаг. Эдгээр нээлттэй хроматин бүсүүдийг дараалалд оруулснаар ATAC-seq нь зохицуулалтын дараалал болон транскрипцийн хүчин зүйлийг холбох боломжит газруудыг илүү ихээр илрүүлж, геном дахь генийн илэрхийллийн динамик модуляцын талаар үнэ цэнэтэй ойлголтыг өгдөг.

  • Багасгасан төлөөллийн бисульфит дараалал (RRBS)

    Багасгасан төлөөллийн бисульфит дараалал (RRBS)

    图片84

    Багасгасан төлөөллийн бисульфитын дараалал (RRBS) нь ДНХ-ийн метилжилтийн судалгаанд бүхэл геномын бисульфитын дараалал (WGBS)-ийн өртөг багатай, үр ашигтай хувилбар болж гарч ирсэн. WGBS нь нэг суурь нарийвчлалтайгаар геномыг бүхэлд нь судлах замаар иж бүрэн ойлголт өгдөг ч өндөр өртөг нь хязгаарлах хүчин зүйл болдог. RRBS нь геномын төлөөллийн хэсгийг сонгон шинжлэх замаар энэ сорилтыг стратегийн хувьд багасгадаг. Энэхүү аргачлал нь CpG арлын баялаг бүс нутгийг MspI-ийн хуваагдлаар баяжуулж, дараа нь 200-500/600 бит/с фрагментийн хэмжээг сонгоход тулгуурладаг. Иймд зөвхөн CpG арлуудтай ойролцоох бүс нутгуудыг дараалалд оруулдаг бол алслагдсан CpG арлуудыг шинжилгээнд хамруулаагүй болно. Энэхүү процесс нь бисульфитын дараалалтай хослуулан ДНХ-ийн метилжилтийг өндөр нарийвчлалтай илрүүлэх боломжийг олгодог ба дараалал тогтоох арга буюу PE150 нь дунд хэсэгт биш харин оруулгын төгсгөлд онцгой анхаарал хандуулж, метилжилтийн профайлын үр ашгийг нэмэгдүүлдэг. RRBS нь ДНХ-ийн метилжилтийг хэмнэлттэй судалгаа хийх, эпигенетик механизмын талаарх мэдлэгийг дээшлүүлэх боломжийг олгодог үнэлж баршгүй хэрэгсэл юм.

Бидэнд мессежээ илгээнэ үү: