
Pacbio Бүрэн хэмжээний транскриптом
PacBio бүрэн хэмжээний транскриптомын дараалал, Isoseq нь транскриптийн изоформыг үнэн зөв тодорхойлох боломжийг олгож, өөр полиадениляци болон залгахад гэрэл тусгаж, генийн экспрессийн шинжилгээг илүү нарийвчлалтай хийхэд хүргэдэг. BMKCloud PacBio бүрэн хэмжээний транскриптомын дамжуулах хоолой нь Circular Consensus Sequencing (CCS) горимд дараалсан cDNA сангуудад дүн шинжилгээ хийх зориулалттай бөгөөд бүрэн уртын химерик бус (FLNC) дарааллыг тодорхойлж, дараа нь илүүдэл бус транскрипт болгон нэгтгэдэг. Дараагийн BUSCO шинжилгээ нь транскриптомын угсралтын бүрэн байдлыг үнэлдэг. Угсарсан транскриптомоос олон шинжилгээг хийдэг: өөр залгалт, энгийн дарааллын давталт (SSR), lncRNA болон харгалзах зорилтот генийг урьдчилан таамаглах, шинэ генийг урьдчилан таамаглах, генийн гэр бүлийн шинжилгээ, транскрипцийн хүчин зүйлийн шинжилгээ, транскриптийн функциональ тайлбар.
Биоинформатик
