Лавлагаа геномтой mRNA-seq (NGS).
RNA-seq нь геном ба протеомын хоорондох ялгааг арилгах, амьдрал, газар тариалангийн шинжлэх ухааны стандарт хэрэгсэл юм. Түүний хүч чадал нь шинэ хуулбарыг олж илрүүлж, тэдгээрийн илэрхийлэлийг нэг шинжилгээгээр хэмждэгт оршдог. Энэ нь мутантыг зэрлэг төрөлтэй харьцуулах, тодорхой нөхцөлд генийн илэрхийлэлийг илрүүлэх гэх мэт янз бүрийн шинж чанар, фенотиптэй холбоотой генүүдэд гэрэл тусгах, харьцуулсан транскриптомийн судалгаанд өргөн хэрэглэгддэг. BMKCloud mRNA(Лавлага) APP нь илэрхийлэлийн хэмжигдэхүүн, дифференциал илэрхийллийн шинжилгээ (DEG) болон дарааллын бүтцийн шинжилгээг mRNA-seq(NGS) биоинформатик дамжуулах хоолойд нэгтгэж, ижил төстэй програм хангамжийн давуу талуудыг нэгтгэж, тав тухтай, хэрэглэгчдэд ээлтэй байдлыг хангадаг. Хэрэглэгчид өөрсдийн RNA-seq өгөгдлөө үүлэнд байршуулах боломжтой бөгөөд энэ програм нь биоинформатик шинжилгээний цогц, нэг цэгийн шийдлийг санал болгодог. Нэмж дурдахад, энэ нь хэрэглэгчийн туршлагыг нэн тэргүүнд тавьж, хэрэглэгчдийн тусгай хэрэгцээнд тохируулсан үйл ажиллагааг санал болгодог. Хэрэглэгчид параметрүүдийг тохируулах, дамжуулах хоолойн даалгаврыг өөрсдөө илгээх, интерактив тайланг шалгах, өгөгдөл/диаграммыг үзэх, зорилтот ген сонгох, функциональ кластер хийх, диаграмм хийх гэх мэт өгөгдлийг бүрэн олборлох боломжтой.
Платформ:Иллюмина, MGI
Стратеги:RNA-Seq
Зохион байгуулалт: Хосолсон, цэвэр өгөгдөл.
Номын сангийн төрөл:fr-unstrand, fr-firststrand эсвэл fr-secondstrand
Унших урт:150 bp
Файлын төрөл:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz эсвэл *.fq.gz. Систем болно.fastq файлуудыг файлын нэрийн дагуу автоматаар хослуулах,жишээ нь *_1.fastq-г *._2.fastq-тай хослуулсан.
Дээжийн тоо:Тооны хувьд ямар ч хязгаарлалт байхгүйдээжийн тоо, харин шинжилгээний хугацаа нь тоогоор нэмэгдэнэдээж ургадаг.
Санал болгож буй өгөгдлийн хэмжээ:Дээж бүрт 6G