Генийн хувьсал, пангеном
Пан-геном гэж юу вэ?
Хуримтлагдсан нотолгоо нь тухайн зүйлийн янз бүрийн омог хоорондын ялгаа нь асар том байж болно. Нэг геном нь нэг зүйлийн удамшлын мэдээллийг бүхэлд нь олж авахад хангалттай хол байна. Сен-геномын судалгааны зорилго нь төрөл бүрийн геномик генийн графикийг олж авах, геномын болон генетик кодыг илүү гүн, геногийн кодыг даван туулах явдал юм.
Пан-геномын судалгаагаар хандлага
Зураг 1 Пан-геномын судалгааны баримт бичгийн чиглэлийн чиг хандлага.
ТАЙЛБАР: Зураг нь "PAN-геном" гарчгийг хайж, мөнх, эс, эс, шинжлэх ухааны цуврал сэтгүүлүүдийг хайхад "Pan-Genome" -ийг харуулж байна
. Олон дээжээс уншсан нь лавлагаа, үл хамаарах зүйлүүдтэй нийцэж байгаа нь роман оригинал руу цуглардаг. Эдгээр романыг анхны лавлах дарааллаар нэмэх замаар пангеномын лавлагаа нь баригдаж болно. Хяналт ширхэгтэй бүс нутгийг зураглал дээр үндэслэн тодорхойлсон бүх уншлага нь пангеном руу буцаж ирдэг.
б. Де Ново угсрах Геномын угсрах нь бүх геномын эгнээгээр нэвтрэх боломжтой геномын талбайнуудтай харьцах боломжийг олгодог.
в. Пан-гомомын графикийг бүхэлд нь графиктай холбож, эсвэл даяар тархсан бүс нутгийг бүхэлд нь графикаар дамжуулж өгдөг.
Pan-геномыг хэрхэн барих вэ?
Зураг 2 Пан-геномын аргыг харьцуулж үзэх1-1
. Олон дээжээс уншсан нь лавлагаа, үл хамаарах зүйлүүдтэй нийцэж байгаа нь роман оригинал руу цуглардаг. Эдгээр романыг анхны лавлах дарааллаар нэмэх замаар пангеномын лавлагаа нь баригдаж болно. Хяналт ширхэгтэй бүс нутгийг зураглал дээр үндэслэн тодорхойлсон бүх уншлага нь пангеном руу буцаж ирдэг.
б. Де Ново угсрах Геномын угсрах нь бүх геномын эгнээгээр нэвтрэх боломжтой геномын талбайнуудтай харьцах боломжийг олгодог.
в. Пан-гомомын графикийг бүхэлд нь графиктай холбож, эсвэл даяар тархсан бүс нутгийг бүхэлд нь графикаар дамжуулж өгдөг.
Саяхан PAN-геномыг нийтлэв
● хүчингэмлэг Pan-genomes2
● Улаан лоолийн PAN-геномууд 3
● будаа тогоо-анхилуун4
● Наранцэцгийн Pan-GenomeНэвтрэлт 5
● Soybean Pan-Genome 6
● будаа тогоо-геном7
● Barley Pan-GenomeҮд
● Улаан буудайн тогоо-геном9
● SORGHOM PAN-GENGOME10
● Фитопланктон Пан Пан-геном11
Сануулга
1. Bayer Pe, Gearez Aa, Schicez Aa, Bayben A, Bayben A, BATLEN J, EDWASE D. PAND PAN-гийн PAN-гэгээлэг бол шинэ лавлагаа юм. Нат ургамал. 2020; 6 (8): 914-920. DOI: 10.1038 / S41477-020-0203-0
2. Дуу Жм, Гуан Z, HU j, y et al. Найман өндөр чанартай геномес нь Pan-геном архитектур, Брассика шагналтыг илтгэнэ. Нат ургамал. 2020; 6 (1): 34-45. DOI: 10.1038 / S41477-019-057-057-057-7-0
3. GAO L, Gonda I, SUN H, ET ET. Улаан лоолийн Pan-геноме нь шинэ геном, жимсний амтыг зохицуулдаг. Nat genet. 2019; 51 (6): 1044-1051. DOI: 10.1038 / S41588-019-040-0410-0410-0410
4. Жао Ас, Фэн q, LU H, et al. PAN Genome шинжилгээ нь тариалсан, зэрлэг будааны геномик хувилбаруудын хэмжээг онцлон тэмдэглэв. 2018 оны 8-р сар; 50 (8): 1196]. Nat genet. 2018; 50 (2): 278-284. DOI: 10.1038 / S41588-018-0041-Z
5. HÜBNER S, BECERCECH N, TODESCO M, ET. Наранцэцгийн Pan-Genome шинжилгээ нь эрлийзжил шинжилгээ нь генийн агууламж, өвчний эсэргүүцэлтэй тулгарч байгааг харуулж байна. Нат ургамал. 2019; 5 (1): 54-62. DOI: 10.1038 / S41477-018-032-0
6. Liu y, du h, li p, et ol. Зэрлэг, тариалсан шар буурцагны амтат. Эс. 2020; 182 (1): 162-176.E13. DOI: 10.116016 / j.cell.2020.020.05.05.023
7. Qin P, LU H, DU H, DUE H, ET AL. Сенетикийн хувьд Genetalical-ийн Genetalical Generalical Fenome-ийн дүн шинжилгээ нь нууцлагдсан генийн өөрчлөлтийг илтгэдэг. Эс. 2021; S0092-8674 (21) 00581-00. DOI: 10.11016 / J.CALL.2021.04.04.04.046.046
8. Jayakodi m, padmarasu s, haberer g, et al. Арвайны Pan-геноме нь мутацийн үржлийн далд өвийг илчилдэг. Байгаль. 2020; 588 (5837): 284-289. DOI: 10.1038 / S41586-020-220-2947-8
9. WalkowIAK S, GAO L, Monat C, ET AL. Олон тооны улаан буудайн геномес орчин үеийн үржлийн салбар дахь дэлхийн өөрчлөлтийг илтгэнэ. Байгаль. 2020; 588 (7837): 277-283. DOI: 10.1038 / S41586-020-020-2961-x
10. Tao y, luo h, xu xu x x, al. Тариалан, зэрлэг сорми, зэрлэг сормуусны хүрээнд өргөн хүрээтэй хэлбэлзэл. Нат ургамал. 2021; 10.1038 / S41477-029-02925-x. DOI: 10.1038 / S41477-029-00925-x
11. Fan x, qiu h, han w, han w et al. Фитопланктон Пангеномеоменомом нь олон янзын функциональ генийг илтгэдэг. Sci adv. 2020; 6 (18): EABA0111. 2020 оны 4-р сарын 29-ний өдрийн нийтлэгдсэн. DOI: DOI: 10.1126 / SCAIDV.ABA0111111111111111111111111111111111111111111111111111
Шуудангийн цаг: Jan-04-2022