Урт кодчилолгүй дараалал-Illumina
Үйлчилгээний давуу тал
●mRNA болон lncRNA-ийн хамтарсан шинжилгээ: мРНХ транскриптийн тоон үзүүлэлтийг lncRNA болон тэдгээрийн зорилтот судалгаатай хослуулснаар эсийн хариу урвалын зохицуулалтын механизмын талаар гүнзгий тоймтой танилцах боломжтой.
●Өргөн цар хүрээтэй туршлага: Манай баг олон төрлийн сорьцын төрлүүд болон lncRNA төслүүдийг хамарсан BMK-д 23,000 гаруй дээжийг боловсруулсан туршлагатай, төсөл болгондоо баялаг туршлага авчирдаг.
●Чанарын хатуу хяналт: Бид дээж, номын сан бэлтгэхээс эхлээд дараалал, биоинформатик хүртэлх бүх үе шатанд үндсэн хяналтын цэгүүдийг хэрэгжүүлдэг. Энэхүү нягт нямбай хяналт нь өндөр чанартай үр дүнг тогтмол хүргэх боломжийг олгодог.
●Борлуулалтын дараах дэмжлэг: Бидний амлалт нь төслийн гүйцэтгэлээс давж, борлуулалтын дараах 3 сарын үйлчилгээний хугацаа юм. Энэ хугацаанд бид үр дүнтэй холбоотой аливаа асуултыг шийдвэрлэхийн тулд төслийн хяналт, алдааг олж засварлах, асуулт хариултын сессүүдийг санал болгодог.
Дээжийн шаардлага ба хүргэлт
| Номын сан | Платформ | Санал болгож буй өгөгдөл | Өгөгдлийн QC |
| rRNA шавхагдсан чиглэлийн номын сан | Illumina PE150 | 10-16 Гб | Q30≥85% |
Нуклеотидууд:
| Конц.(нг/мкл) | Хэмжээ (мкг) | Цэвэр байдал | Шударга байдал |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Гель дээр уураг, ДНХ-ийн бохирдол хязгаарлагдмал эсвэл огт байхгүй. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; хязгаарлагдмал буюу үндсэн өндөргүй |
● Ургамал:
Үндэс, иш эсвэл дэлбээ: 450 мг
Навч эсвэл үр: 300 мг
Жимс: 1.2 гр
● Амьтан:
Зүрх ба гэдэс: 450 мг
Дотоод эрхтнүүд эсвэл тархи: 240 мг
Булчин: 600 мг
Яс, үс эсвэл арьс: 1.5 гр
● Артропод:
Шавж: 9 гр
Хавч: 450 мг
● Бүхэл цус:2 хоолой
● Эсүүд: 106 эсүүд
● Сийвэн ба плазм: 6 мл
Санал болгож буй дээжийн хүргэлт
Сав: 2 мл центрифугийн хоолой (цагаан тугалган цаас хэрэглэхийг зөвлөдөггүй)
Загварын шошго: Бүлэг+хуулбар, жишээ нь A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Хүргэлт:
1. Хуурай мөс: Дээжийг уутанд хийж хуурай мөсөнд булах шаардлагатай.
2. RNAstable хоолой: РНХ-ийн дээжийг РНХ тогтворжуулах хоолойд (жишээ нь RNAstable®) хатааж, өрөөний температурт тээвэрлэж болно.
Үйлчилгээний ажлын урсгал
Туршилтын загвар
Дээж хүргэх
РНХ олборлолт
Номын сангийн барилга
Дараалал
Өгөгдлийн шинжилгээ
Борлуулалтын дараах үйлчилгээ
Биоинформатик
Дифференциал генийн илэрхийлэл (DEGs) шинжилгээ
lncRNA илэрхийллийн тоон үзүүлэлт – кластерчлал
lncRNA зорилтот генийг баяжуулах
Хамтарсан мРНХ ба lncRNA байрлалын шинжилгээ – Циркосын график (дунд тойрог нь мРНХ, дотоод цикл нь lncRNA)
BMKGene-ийн lncRNA-ийн тэгшитгэх үйлчилгээнд тусгагдсан дэвшлүүдтэй танилцаарай.
Жи, H. нар. (2020) 'Хархны элэг дэх хүйтэн стресстэй холбоотой lncRNA-г тодорхойлох, функциональ таамаглал ба гол lncRNA баталгаажуулалт', Шинжлэх ухааны тайлан 2020 10:1, 10(1), хуудас 1–14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Жиа, З. нар. (2021) 'Нэгдмэл транскриптомийн шинжилгээ нь CyHV-3-тэсвэртэй нийтлэг мөрөг загасны омгийн дархлааны механизмыг харуулж байна', Дархлаа судлалын хил хязгаар, 12, х. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Ван, XJ нар. (2022) 'Уушигны жижиг эсийн хорт хавдар дахь өрсөлдөөнт эндоген РНХ зохицуулалтын сүлжээнүүдийн олон төрлийн интеграцчлалд суурилсан тэргүүлэх чиглэл: молекулын шинж чанар ба эмийн нэр дэвшигчид', Онкологийн хүрээ, 12, х. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Шиао, Л. нар. (2020) 'Populus дахь фотосинтезийн үндсэн генийн хамтын экспрессийн сүлжээний генетик задрал', Ургамлын биотехнологийн сэтгүүл, 18(4), 1015-1026 хуудас. doi: 10.1111/PBI.13270.
Zheng, H. et al. (2022) 'Грэйвсийн өвчин ба Хашимотогийн бамбай булчирхайн үрэвслийн бичил орчин дахь дархлааны эсүүд дэх зохицуулалтгүй генийн илэрхийлэл ба хэвийн бус бодисын солилцооны дохиоллын дэлхийн зохицуулалтын сүлжээ', Дархлаа судлалын хил хязгаар, 13, х. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
