Hi-C дээр суурилсан хроматин харилцан үйлчлэл
Тангээлгийн байдал
● Illumina Novaseq дээр PE150-тай хамт.
● Үйлчилгээ нь COMPLEEHYDYE-тэй хөндлөн огтлолцсон бөгөөд цөмийн хүчлийн оронд Consiteddehyde-тэй холбож, ДНХ-Уургийн харилцан үйлчлэлийг дамжуулж,
● Hi-C Туршилт нь хязгаарлалт, эцэс төгсгөлгүй боодлын төгсгөл нь харилцан үйлчлэлийг хадгалдаг. ДНХ нь Stnapavavin Beavs-ийг Stneptaviin Beads-ийг доош нь татаад дараачийн номын санд ариутгана.
Үйлчилгээний давуу тал
●Оновчтой хязгаарлалт ферментийн загвар: 93% -ийн хүчинтэй харилцан үйлчлэлийн хосыг өөр өөр зүйл дээр өндөр Hi-C үр ашгийг хангах.
●Мэргэшсэн туршлага, хэвлэлийн бүртгэл:BMKGENE нь 800 өөр зүйл, янз бүрийн патент, янз бүрийн патентуудтай 2000 hi-ci-c-ийн хэрэглээний төслүүдтэй өргөн уудам туршлагатай. 100 гаруй нийтлэгдсэн тохиолдолд хуримтлагдсан нөлөөллийн хүчинд 900 гаруй хүчин зүйлтэй.
●Өндөр чадварлаг биоинформатикийн баг:Гэрийн патентууд болон програм хангамжийн зураг, програм хангамжийн зохиогчийн эрх, датаны шинжилгээ, өгөгдлийн шинжилгээ, өөрөө боловсруулсан харааны мэдээлэл.
●Борлуулалтын дараах дэмжлэг:Бидний амлалт нь төслийн хугацаа дуусахаас хойш 3 сарын дараа Төслийн гүйцэтгэлээс цааш үргэлжилнэ. Энэ хугацаанд бид төслийн дараагийн тусламж, асуудлыг шийдвэрлэхэд санал болгож буй тусламжийг санал болгож байна.
●Тал бүрэн шиалт гаргах: Бид олон судалгааг тодорхойлж, олон судалгааны төслүүдийн талаархи ойлголттой генийг ажиллуулж, тохирох баясгалт шинжилгээгээр дамжуулан генийг ажиллуулж, зохих ёсоор судалгааг өгөөрэй.
Үйлчилгээтэй
| Номын сан | Дараалсан стратеги | Санал болгож буй өгөгдлийн гарц | Hi-C дохионы нарийвчлал |
| Hi-C номын сан | Illumina pe150 | Хроматин давталт: 150x TAD: 50x | Хроматин давталт: 10KB TAD: 40KB |
Үйлчилгээний мэдлэг
| Дээжийн төрөл | Шаардлагатай хэмжээг |
| Амьтан | ≥2g |
| Бүхэл цус | ≥2ml |
| Мөөгөнцөр | ≥1g |
| Ургамал- Залуу эд | 1г / aliquot, 2-4 aliquotes ашиглахыг зөвлөж байна |
| Соцебүзнүүд | ≥1x107 |
Дараахь дүн шинжилгээ хийх:
● Түүхий дата QC;
● зураглал ба hi-c номын сан ба qc: Хүчин төгөлдөр бус харилцан үйлчлэлийн хос, харилцан үйлчлэлийн ялзралын байдал (IDES);
● Гомомен өргөн харилцан үйлчлэл: CIS / Trans / Trans Consection ба Hi-C харилцан үйлчлэлийн газрын зураг;
● A / B таслалтын тархалтын дүн шинжилгээ хийх;
● TADS болон хроматин гогцоо тодорхойлох;
● Холбоотой генийн тоонуудын хооронд 3D хроматины бүтцийн хувьд дифтолик дүн шинжилгээ.
CIS ба транс пропорциональ хуваарилалт
Дээжийн хоорондох хромосомын харилцан үйлчлэлийн халаалт
A / B тасалгааны геномын өргөн тархалт
Хроматин гогцоотой геномын тархалт
Tads-ийн дүрслэл
BMKGENE-ийн HI-C Hi-C ХӨДӨЛГӨӨНИЙ ТӨЛӨВЛӨГӨӨНИЙ ТӨЛӨВЛӨГӨӨНИЙ ТӨЛӨВЛӨГӨӨНИЙ ТӨЛӨВЛӨГӨӨНИЙ ТӨЛӨВЛӨГӨӨНИЙ ТӨЛӨВЛӨГӨӨ.
Meng, T. et al. (2021) 'Олон тооны нэгдсэн нийлмэл дүн шинжилгээ нь CHORDOMO-д зориулсан роман зорилтот байдлаар CA2-ийг тодорхойлдог.Нейро-Онкологи, 23 (10), PP. 1709-17222. DOI: 10.1093 / Neuonc / Noab156.
Xu, L. нар. (2021) '3D-ийн нээлт, Нанопор, Нанопор, РНОПОРДИЙН НЭГДСЭН НЭГДСЭН НЭГДСЭН НЭГДСЭН НЭГДСЭН НЭГДСЭН ШУУД ҮЗЭХ,ACTA POBLACECAUICA SINICA B, 11 (10), PP. 3150-3164. DOI: 10.1116 / J.PASTB.2021.02.02.02.02.02.022.
