Геномын хэмжээний холбооны шинжилгээ
Ажлын урсгал
Үйлчилгээний давуу тал
●Өргөн хүрээний шинжээч, нийтлэлийн бүртгэл: GWAS-д хуримтлуулсан туршлагаараа BMKGene нь GWAS-ийн популяцийн судалгааны олон зуун зүйлийн төслийг хэрэгжүүлж, 100 гаруй өгүүлэл нийтлэхэд судлаачдад тусалсан бөгөөд хуримтлагдсан нөлөөллийн хүчин зүйл нь 500-д хүрсэн.
● Био-информатикийн цогц шинжилгээ: ажлын урсгалд нэр дэвшигчийн генийн багц болон тэдгээрийн холбогдох функциональ тэмдэглэгээг хүргэх SNP-шинжлэлийн холбооны шинжилгээ орно.
●Өндөр ур чадвартай биоинформатикийн баг, богино шинжилгээний мөчлөг: Дэвшилтэт геномикийн шинжилгээний асар их туршлагатай, BMKGene-ийн баг нь иж бүрэн шинжилгээг хурдан хугацаанд гүйцэтгэдэг.
●Борлуулалтын дараах дэмжлэг:Бидний амлалт нь төслийн гүйцэтгэлээс давж, борлуулалтын дараах 3 сарын үйлчилгээний хугацаа юм. Энэ хугацаанд бид үр дүнтэй холбоотой аливаа асуултыг шийдвэрлэхийн тулд төслийн хяналт, алдааг олж засварлах, асуулт хариултын сессүүдийг санал болгодог.
Үйлчилгээний үзүүлэлт ба шаардлага
| Дарааллын төрөл | Санал болгож буй хүн амын тоо | Дараалсан стратеги | Нуклеотидын шаардлага |
| Бүхэл геномын дараалал | 200 дээж | 10x | Концентраци: ≥ 1 нг/ µL Нийт дүн≥ 30нг Хязгаарлагдмал буюу доройтол, бохирдолгүй |
| Тодорхой байршилтай олшруулсан фрагмент (SLAF) | Шошгын гүн: 10x Шошгоны тоо: < 400 Mb: WGS ашиглахыг зөвлөж байна < 1Гб: 100К шошго 1 Гб > 2Гб: 300К шошго Хамгийн ихдээ 500 мянган шошго | Концентраци ≥ 5 нг/мкл Нийт хэмжээ ≥ 80 нг Nanodrop OD260/280=1.6-2.5 Агароз гель: доройтол, бохирдол байхгүй эсвэл хязгаарлагдмал
|
Материалын сонголт
Төрөл бүрийн сорт, дэд зүйл, газар нутаг/удамшил/холимог гэр бүл/зэрлэг нөөц
Янз бүрийн сорт, дэд зүйл, газар нутаг
Хагас sib гэр бүл/бүтэн sib гэр бүл/ зэрлэг нөөц
Үйлчилгээний ажлын урсгал
Туршилтын загвар
Дээж хүргэх
РНХ олборлолт
Номын сангийн барилга
Дараалал
Өгөгдлийн шинжилгээ
Борлуулалтын дараах үйлчилгээ
Дараах шинжилгээг багтаасан болно.
- Геномын хэмжээнд хамаарлын шинжилгээ: LM, LMM, EMMAX, FASTLMM загвар
- Нэр дэвшигч генийн функциональ тайлбар
SNP-шинжлэлийн холбоодын шинжилгээ - Манхэттэний төлөвлөгөө
SNP-шинжлэлийн холбоодын шинжилгээ - QQ график
BMKGene-ийн de GWAS үйлчилгээгээр хангасан дэвшилтүүдийг нийтлэлийн цуглуулгаар судлаарай:
Lv, L. et al. (2023) "Геномын өргөн хүрээний нийгэмлэгийн судалгаагаар сахлын хясаа Sinonovacula constricta-ийн аммиакийн хүлцлийн генетик үндэслэлийн талаархи ойлголт",Усны аж ахуй, 569, х. 739351. дой: 10.1016/Ж.УС АЖИЛЛАГАА.2023.739351.
Ли, X. нар. (2022) '398 үнэгэн сүүлний шар будааны нэгдэлд хийсэн олон төрлийн шинжилгээгээр гаршуулах, метаболит шинж чанар, үрэвслийн эсрэг үйлчилгээтэй холбоотой геномын бүс нутгийг илрүүлсэн',Молекулын ургамал, 15(8), хуудас 1367–1383. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.
Li, J. et al. (2022) 'Ган орчин дахь геномын өргөн хүрээний нийгэмлэгийн зураглал',Ургамлын шинжлэх ухааны хил хязгаар, 13, х. 924892. doi: 10.3389/FPLS.2022.924892/BIBTEX.
Жао, X. нар. (2021) 'Сульфотрансферазыг кодлодог GmST1 нь шар буурцгийн мозайк вирусын G2 ба G3 омогт тэсвэртэй',Ургамал, эс ба хүрээлэн буй орчин, 44(8), хуудас 2777–2792. doi: 10.1111/PCE.14066.
