De novo мөөгөнцрийн геномын угсралт
BMKGENE нь Мөөгөнцөрийн геномын олон тооны геномын эсрэг шийдлийг санал болгодог. Богино унших Illumina дарааллыг дангаар нь ашиглах нь геномын геномын үе үе үеийг ашиглах боломжийг олгодог. Нанопор эсвэл Пакбио ашиглан богино унших, урттай дараалал нь илүү боловсронгуй болсон. Түүнээс гадна, Hi-C дарааллыг нэгтгэх нь бүрэн хромосом түвшний геномыг сайжруулж сайжруулж байна.
Тангээлгийн байдал
Геномын бүрэн бүрэн гүйцэд байхаас хамааран гурван боломжит сонголтуудтай:
● Геномын сонголт: Illumina NoveAmina PE150-тай богино унших дарааллаар.
● Мөөгөнцрийн нарийн геном сонголт:
Геномын судалгаа: Illumina novaseq pe150.
Genome angmblay: PACBIO REVIO (HIFI READIO) эсвэл Нанопор Рометрион 48.
● Chromosome-Lete Fingal Genome:
Геномын судалгаа: Illumina novaseq pe150.
Genome angmblay: PACBIO REVIO (HIFI READIO) эсвэл Нанопор Рометрион 48.
Hi-C ТЕХНИКИЙН АЖИЛЛАГАА.
Үйлчилгээний давуу тал
●Олон тооны дарааллын стратеги: Олон тооны судалгааны зорилго, геномын бүрэн бүрэн байдлын талаар
●Бүрэн биоинформатикийн ажлын урсгал:Үүнд геномын угсралт, олон удмын элементүүд, үйл ажиллагааны генийн тэмдэглэгээ, ба
●Өргөтгөсөн туршлага: 12,000 гаруй микробын геномын хамт угсарч, бид маш чадварлаг туршлагатай, хамгийн чадварлаг шинжилгээний баг, дэлгэрэнгүй мэдээлэл, дэлгэрэнгүй мэдээлэл,
●Борлуулалтын дараах дэмжлэг:Бидний амлалт нь төслийн хугацаа дуусахаас хойш 3 сарын дараа Төслийн гүйцэтгэлээс цааш үргэлжилнэ. Энэ хугацаанд бид төслийн дараагийн тусламж, асуудлыг шийдвэрлэхэд санал болгож буй тусламжийг санал болгож байна.
Үйлчилгээтэй
| Үйлчилгээ | Дараалсан стратеги | Чанарын шалгалт |
| Гомомын ноорог | Illumina pe150 100x | Q30 inse85% |
| Нарийн геном | Геномын судалгаа: Illumina pe150 50 x PACBIO HIFI 30X эсвэл NANOPORE 100X | CONDIG N50 ≥1MB (PACBIO UNICLELLLEAL) CONDIG N50 ins2MB (ONT Unicellular) CONDIG N50 inst500KB (бусад) |
| Хромосоме-түвшний геном | Геномын судалгаа: Illumina pe150 50 x PACBIO HIFI 30X эсвэл NANOPORE 100X Hi-C Хүлээгдэж буй 100x | Contrig Couchoring харьцаа> 90%
|
Үйлчилгээний мэдлэг
| Төвлөрөл (NG / мкл) | Нийт дүн (мкг) | Хэмжээ (мкл) | OD260 / 280 | OD260 / 230 | |
| Тамирчин | ≥20 | ≥2 | ≥20 | 1.7-2.2 | ≥1.6 |
| Nand төрлийн | ≥404 | ≥2 | ≥20 | 1.7-2.2 | 1.0-3.0 |
| Эергэм | ≥1 | ≥0.06 | ≥20 | - | - |
Unicellllearkleark-ийн мөөгөнцөр: ≥3.5x1010 тэх
Макро Мөөгөнцөр: ≥10 гр
Үйлчилгээний ажлын урсгал
Түүвэрлэлтийг хүргэх
Номын санний барилга
Дараалал
Мэдээллийн дүн шинжилгээ хийх
Худалдах үйлчилгээ
Дараахь дүн шинжилгээ хийх:
Геном судалгаа:
- Мэдээллийн чанарын хяналт шалгалт
- Genome тооцоо: Хэмжээ, гетерозигиз, давтагдах элементүүд
Нарийн геномын угсралт:
- Мэдээллийн чанарын хяналт шалгалт
- ДэовоХурал
- Genome Component-ийн дүн шинжилгээ: CD болон олон тооны геномын элементүүдийг урьдчилан таамаглах
- Олон ерөнхий мэдээллийн сантай функциональ тэмдэглэгээ (GO, GO, KEY, KEY, ETC) ба ДЭЛГЭРЭХГҮЙ АЖИЛЛАГАА (КАРТ, VFDB, VFDB гэх мэт)
Hi-C Чуулганы:
- Hi-C номын сангийн үнэлгээ.
- Contribing Clustring Clustering, захиалах, чиглүүлэх
- Hi-C Testion-ийн үнэлгээ: Лавлах геном, дулааны газрын зураг дээр үндэслэсэн
Геномын судалгаа: K-Mer-ийн тархалт
Геномын угсралт: Gene Homologous тэмдэглэгээ (NR мэдээллийн сан)
Genome unsblay: Функциональ Ген тэмдэглэл (Явах)
BMKGENE'S's Fungal Genome Genome Chesclesses Endercly Place-ийн тусламжтайгаар хэвлэл мэдээллийн хэрэгслээр дамжуулан хэвлэгдсэн.
Хао, Ж. АЛ. (2023) 'Эмийн мөөгний мөөгний Ingonacus inmiCust-ийг живсэн нөхцөлдBMC геномикууд, 24 (1), PP 1-12. DOI: 10.11866 / S12864-023-026-09656-Z / тоо / 3.
Lu, l. et al. (2023) 'Genome Seepencing нь улаан буудайн хурц үзүүр, эмгэг эмгэг эмгэг эмгэг төрлийг илтгэдэг.Тариалангийн сэтгүүл, 11 (2), PP. 405-416. DOI: 10.116016 / J.CJ.2022.02.07.07.024.
Жан, H. ET. (2023) Дөрвөн Кларрезедийн геномын төрөл нь олон янзын турфаспрассад долларын геномын нөөц ',Дайрины өвчин, 107 (3), PP. 929-934. DOI: 10.1094 / PDIS-08-22-1921-А
Жан, ss et al. (2023) 'MUSHAPIALE MUSHIRALE MUSHIRATE MUSHIRATA MANDIALE, MOLECALE, MOLECALE,Мөөгөнцрийн сэтгүүл, 9 (10), p. 959. DOI: 10.3390 / JOF9195959 / S1.
