Иллумина урьдчилсан номын сангууд
Ан тэмдэгт
●Платформууд:Illumina novaseq 6000 ба novaseq x plus
●Дараалсан горим:PE150 ба PE250
●Шүүмжлэхээс өмнө номын сангийн чанарын хяналт
●Дата qc ба Хүргэлтийг дараалан:QC-ийн тайлан, түүхий мэдээллийг demultiplesce and q30 уншсаны дараа Fastq-ийн тайлан, түүхий мэдээллийг хүргэх
Үйлчилгээний давуу тал
●Шүүмжлэх үйлчилгээний олон талт:Үйлчлүүлэгч нь эгнээний дарааллаар дараалан дарааллаар сонгож болно.
●Illumina Sequenting платформ дээр өргөн цар хүрээтэй туршлага:янз бүрийн зүйл бүхий олон мянган хаалттай төслүүдтэй.
●QC тайланг хүргэх.чанарын хэмжигдэхүүн, өгөгдлийн нарийвчлал, дарааллын төслийн төслийн гүйцэтгэл.
●Насанд хүрэгчдийн дарааллын үйл явц:богино эргэлттэй цаг.
●Хатуу чанарын хяналт: Бид QC QC-ийн хатуу өндөр чанартай үр дүнг хүргэхийг баталгаажуулахын тулд QC QC-ийг хэрэгжүүлдэг.
Дээжийн платформууд
| Платформ | Урсгалын нүд | Дарааллын горим | Нэгж | Тээш |
| Novaseq x | 10б (8 эгнээ) | Pe150 | Ганц эгнээ Хэсэг хэсэгчилсэн эгнээ | 375GB / эгнээ |
| 25b (8 эгнээ) | Pe150 | Ганц эгнээ Хэсэг хэсэгчилсэн эгнээ | 1000 ГБ / эгнээ | |
| Novaseq 6000 | SP урсгалын эс (2 эгнээ) | PE250 | Урсгалын нүд Ганц эгнээ Хэсэг хэсэгчилсэн эгнээ | 325-400 м унших / эгнээ |
| S4 урсгалын эс (4 эгнээ) | Pe150 | Урсгалын нүд Ганц эгнээ Хэсэг хэсэгчилсэн эгнээ | ~ 800 ГБ / эгнээ |
Дээжийн шаардлага
| Өгөгдлийн хэмжээ (x) | Төвлөрөл (QPCR / NM) | Хэмжээ | |
| Хэсэгчилсэн эгнээ дараалал
| X ≤ 10 ГБ | ≥ 1 nm | ≥55 мкл |
| 10 GB <X ≤ 50 ГБ | ≥ 2 nm | ≥55 мкл | |
| 50 GB <X ≤ 100 GB | ≥ 3 nm | ≥55 мкл | |
| X> 100 ГБ | ≥ 4 nm | ≥55 мкл | |
| Эгнээ шилжүүлэх | Нэг эгнээ | ≥ 1.5 NM / Номын сангийн усан сан | ≥5 μL / Номын сангийн усан сан |
Концентраци, нийт дүнгээс гадна тохиромжтой оргил хэлбэрийг шаарддаг.
Тэмдэглэл: Lane Lane-ийн эгнээний дараалал багатай тэмдгийн дараалал.
Урьдчилан усан сангийн номын санг дээж болгон ирүүлэхийг зөвлөж байна. Хэрэв та BMKGENE-ийг номын сангийн усан сан гүйцэтгэх шаардлагатай бол лавлана уу
Хэсэгчилсэн эгнээ дарааллын дагуу номын сангийн шаардлага.
Номын сангийн хэмжээ (PANEP MAP)
Үндсэн оргил нь 300-450 BP-ийн дотор байх ёстой.
Номын сангууд нэг үндсэн оргил байх ёстой, адаптерийн бохирдол, праймер бүдгэрч болохгүй.
Хэрэв таны дээжүүд эхлэх материалын шаардлагад нийцэхгүй бол бидэнтэй холбоо бариарай.
Үйлчилгээний ажлын урсгал
Дийнайын ариунгийн чанарын шийдвэр
Дараалал
Мэдээллийн чанарын хяналт
Төслийн хүргэлт
Номын сан QC тайлан
Номын сангийн чанарт Тайлангийн чанарыг дараалан, номын сангийн хэмжээ, хуваагдлыг үнэлэхээс өмнө өгнө.
QC тайланг шалгах
Хүснэгт 1. Шүүгээнд байгаа статистик мэдээлэл.
| Дээжийн ID | Bmkid | Түүхий эд уншдаг | Түүхий өгөгдөл (BP) | Цэвэр уншдаг (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Зураг 1. Дээж бүрт уншсан чанарын дагуу чанарын хуваарилалт
Зураг 2. Суурь агуулгын тархалт
Зураг 3. Уншлагын агуулгыг дараалан дарааллаар нь хуваарилах
