miRNA, siRNA, piRNA എന്നിവയുൾപ്പെടെ ശരാശരി 18-30 nt ദൈർഘ്യമുള്ള ഹ്രസ്വമായ നോൺ-കോഡിംഗ് RNA ആണ് ചെറിയ RNAകൾ. mRNA ഡീഗ്രേഡേഷൻ, ട്രാൻസ്ലേഷൻ ഇൻഹിബിഷൻ, ഹെറ്ററോക്രോമാറ്റിൻ രൂപീകരണം തുടങ്ങിയ വിവിധ ജൈവ പ്രക്രിയകളിൽ ഈ ചെറിയ ആർഎൻഎകൾ ഉൾപ്പെട്ടതായി റിപ്പോർട്ട് ചെയ്യപ്പെട്ടിട്ടുണ്ട്. മൃഗങ്ങൾ/സസ്യ വികസനം, രോഗം, വൈറസ് മുതലായവയെക്കുറിച്ചുള്ള പഠനങ്ങളിൽ ചെറിയ ആർഎൻഎ സീക്വൻസിങ് വിശകലനം വ്യാപകമായി പ്രയോഗിച്ചിട്ടുണ്ട്. സീക്വൻസിങ് അനാലിസിസ് പ്ലാറ്റ്ഫോം സ്റ്റാൻഡേർഡ് അനാലിസിസും അഡ്വാൻസ്ഡ് ഡാറ്റ മൈനിംഗും ഉൾക്കൊള്ളുന്നു. RNA-seq ഡാറ്റയുടെ അടിസ്ഥാനത്തിൽ, സ്റ്റാൻഡേർഡ് വിശകലനത്തിന് miRNA ഐഡൻ്റിഫിക്കേഷനും പ്രവചനവും, miRNA ടാർഗെറ്റ് ജീൻ പ്രവചനവും, വ്യാഖ്യാനവും എക്സ്പ്രഷൻ വിശകലനവും നേടാൻ കഴിയും. വിപുലമായ വിശകലനം ഇഷ്ടാനുസൃതമാക്കിയ miRNA തിരയലും വേർതിരിച്ചെടുക്കലും, വെൻ ഡയഗ്രം ജനറേഷൻ, miRNA, ടാർഗെറ്റ് ജീൻ നെറ്റ്വർക്ക് നിർമ്മാണം എന്നിവ പ്രാപ്തമാക്കുന്നു.