-
സിംഗിൾ ന്യൂക്ലിയസ് ആർഎൻഎ സീക്വൻസിങ്
സിംഗിൾ-സെൽ ക്യാപ്ചർ, ഇഷ്‌ടാനുസൃത ലൈബ്രറി നിർമ്മാണ സാങ്കേതികവിദ്യകളുടെ വികസനം, ഉയർന്ന ത്രൂപുട്ട് സീക്വൻസിംഗിനൊപ്പം, സെൽ തലത്തിൽ ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ പഠനങ്ങളിൽ വിപ്ലവം സൃഷ്ടിച്ചു. ഈ മുന്നേറ്റം സങ്കീർണ്ണമായ സെൽ പോപ്പുലേഷനുകളുടെ ആഴമേറിയതും സമഗ്രവുമായ വിശകലനം അനുവദിക്കുന്നു, എല്ലാ കോശങ്ങളിലെയും ശരാശരി ജീൻ എക്സ്പ്രഷനുമായി ബന്ധപ്പെട്ട പരിമിതികൾ മറികടക്കുകയും ഈ പോപ്പുലേഷനുകൾക്കുള്ളിലെ യഥാർത്ഥ വൈവിധ്യം സംരക്ഷിക്കുകയും ചെയ്യുന്നു. സിംഗിൾ-സെൽ ആർഎൻഎ സീക്വൻസിംഗിന് (scRNA-seq) നിഷേധിക്കാനാവാത്ത ഗുണങ്ങളുണ്ടെങ്കിലും, ചില ടിഷ്യൂകളിൽ ഇത് വെല്ലുവിളികൾ നേരിടുന്നു, അവിടെ ഒറ്റ-കോശ സസ്പെൻഷൻ സൃഷ്ടിക്കുന്നത് ബുദ്ധിമുട്ടാണെന്നും പുതിയ സാമ്പിളുകൾ ആവശ്യമായി വരുമെന്നും തെളിയിക്കുന്നു. BMKGene-ൽ, അത്യാധുനിക 10X ജീനോമിക്സ് ക്രോമിയം സാങ്കേതികവിദ്യ ഉപയോഗിച്ച് സിംഗിൾ ന്യൂക്ലിയസ് ആർഎൻഎ സീക്വൻസിംഗ് (snRNA-seq) വാഗ്ദാനം ചെയ്തുകൊണ്ട് ഞങ്ങൾ ഈ തടസ്സം പരിഹരിക്കുന്നു. ഈ സമീപനം സിംഗിൾ-സെൽ തലത്തിൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ് വിശകലനത്തിന് അനുയോജ്യമായ സാമ്പിളുകളുടെ സ്പെക്ട്രം വിശാലമാക്കുന്നു.
ഇരട്ട ക്രോസിംഗുകളുള്ള എട്ട്-ചാനൽ മൈക്രോഫ്ലൂയിഡിക്‌സ് സിസ്റ്റം ഫീച്ചർ ചെയ്യുന്ന നൂതനമായ 10X ജീനോമിക്സ് ക്രോമിയം ചിപ്പ് വഴിയാണ് ന്യൂക്ലിയസുകളെ വേർതിരിക്കുന്നത്. ഈ സംവിധാനത്തിനുള്ളിൽ, ബാർകോഡുകൾ, പ്രൈമറുകൾ, എൻസൈമുകൾ, ഒരൊറ്റ ന്യൂക്ലിയസ് എന്നിവ ഉൾപ്പെടുന്ന ജെൽ ബീഡുകൾ നാനോലിറ്റർ വലിപ്പമുള്ള എണ്ണ തുള്ളിയിൽ പൊതിഞ്ഞ് ജെൽ ബീഡ്-ഇൻ-എമൽഷൻ (ജിഇഎം) രൂപീകരിക്കുന്നു. GEM രൂപീകരണത്തെത്തുടർന്ന്, ഓരോ GEM-നുള്ളിലും സെൽ ലിസിസും ബാർകോഡ് റിലീസും സംഭവിക്കുന്നു. തുടർന്ന്, mRNA തന്മാത്രകൾ 10X ബാർകോഡുകളും യുണീക് മോളിക്യുലാർ ഐഡൻ്റിഫയറുകളും (UMIs) സംയോജിപ്പിച്ച് cDNA-കളിലേക്ക് റിവേഴ്സ് ട്രാൻസ്ക്രിപ്ഷൻ നടത്തുന്നു. ഈ സിഡിഎൻഎകൾ പിന്നീട് സ്റ്റാൻഡേർഡ് സീക്വൻസിംഗ് ലൈബ്രറി നിർമ്മാണത്തിന് വിധേയമാക്കുന്നു, ഇത് സിംഗിൾ-സെൽ തലത്തിൽ ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ പ്രൊഫൈലുകളുടെ ശക്തവും സമഗ്രവുമായ പര്യവേക്ഷണം സുഗമമാക്കുന്നു.
പ്ലാറ്റ്ഫോം: 10× ജീനോമിക്സ് ക്രോമിയം, ഇല്ലുമിന നോവസെക് പ്ലാറ്റ്ഫോം
-
10x ജീനോമിക്സ് വിസിയം സ്പേഷ്യൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം
സ്പേഷ്യൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോമിക്സ് എന്നത് ഒരു അത്യാധുനിക സാങ്കേതിക വിദ്യയാണ്, അത് ടിഷ്യൂകൾക്കുള്ളിലെ ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ പാറ്റേണുകളെ അവയുടെ സ്പേഷ്യൽ സന്ദർഭം നിലനിർത്തിക്കൊണ്ട് അന്വേഷിക്കാൻ ഗവേഷകരെ അനുവദിക്കുന്നു. ഈ ഡൊമെയ്‌നിലെ ഒരു ശക്തമായ പ്ലാറ്റ്ഫോം 10x ജീനോമിക്സ് വിസിയവും ഇലുമിന സീക്വൻസിംഗും ആണ്. 10X വിസിയത്തിൻ്റെ തത്വം ടിഷ്യൂ സെക്ഷനുകൾ സ്ഥാപിക്കുന്ന ഒരു പ്രത്യേക ക്യാപ്ചർ ഏരിയയുള്ള ഒരു പ്രത്യേക ചിപ്പിലാണ്. ഈ ക്യാപ്ചർ ഏരിയയിൽ ബാർകോഡ് ചെയ്ത പാടുകൾ അടങ്ങിയിരിക്കുന്നു, അവ ഓരോന്നും ടിഷ്യുവിനുള്ളിലെ ഒരു പ്രത്യേക സ്പേഷ്യൽ ലൊക്കേഷനുമായി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു. ടിഷ്യുവിൽ നിന്ന് പിടിച്ചെടുത്ത ആർഎൻഎ തന്മാത്രകൾ റിവേഴ്സ് ട്രാൻസ്ക്രിപ്ഷൻ പ്രക്രിയയിൽ യുണീക് മോളിക്യുലാർ ഐഡൻ്റിഫയറുകൾ (യുഎംഐ) ഉപയോഗിച്ച് ലേബൽ ചെയ്യുന്നു. ഈ ബാർകോഡ് ചെയ്ത പാടുകളും UMI-കളും ഒരു സെൽ റെസല്യൂഷനിൽ കൃത്യമായ സ്പേഷ്യൽ മാപ്പിംഗും ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ്റെ അളവും പ്രാപ്തമാക്കുന്നു. സ്പേഷ്യൽ ബാർകോഡുള്ള സാമ്പിളുകളുടെയും യുഎംഐകളുടെയും സംയോജനം സൃഷ്ടിക്കുന്ന ഡാറ്റയുടെ കൃത്യതയും പ്രത്യേകതയും ഉറപ്പാക്കുന്നു. ഈ സ്പേഷ്യൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോമിക്സ് സാങ്കേതികവിദ്യ ഉപയോഗിക്കുന്നതിലൂടെ, ഗവേഷകർക്ക് കോശങ്ങളുടെ സ്പേഷ്യൽ ഓർഗനൈസേഷനെക്കുറിച്ചും ടിഷ്യൂകൾക്കുള്ളിൽ സംഭവിക്കുന്ന സങ്കീർണ്ണമായ തന്മാത്രാ ഇടപെടലുകളെക്കുറിച്ചും ആഴത്തിലുള്ള ധാരണ നേടാനാകും, ഓങ്കോളജി, ന്യൂറോ സയൻസ്, ഡെവലപ്‌മെൻ്റൽ ബയോളജി, ഇമ്മ്യൂണോളജി എന്നിവയുൾപ്പെടെ ഒന്നിലധികം മേഖലകളിലെ ജൈവ പ്രക്രിയകൾക്ക് അടിസ്ഥാനമായ സംവിധാനങ്ങളെക്കുറിച്ച് അമൂല്യമായ ഉൾക്കാഴ്ചകൾ വാഗ്ദാനം ചെയ്യുന്നു. , ബൊട്ടാണിക്കൽ പഠനങ്ങൾ.
പ്ലാറ്റ്ഫോം: 10X ജീനോമിക്സ് വിസിയം, ഇല്ലുമിന നോവസെക്ക്
-
മുഴുനീള mRNA സീക്വൻസിങ്-നാനോപോർ
NGS-അധിഷ്ഠിത mRNA സീക്വൻസിംഗ് ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ അളക്കുന്നതിനുള്ള ഒരു ബഹുമുഖ ഉപകരണമാണെങ്കിലും, ഹ്രസ്വ വായനകളെ ആശ്രയിക്കുന്നത് സങ്കീർണ്ണമായ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോമിക് വിശകലനങ്ങളിൽ അതിൻ്റെ ഫലപ്രാപ്തിയെ നിയന്ത്രിക്കുന്നു. മറുവശത്ത്, നാനോപോർ സീക്വൻസിംഗ് ദീർഘനേരം വായിക്കുന്ന സാങ്കേതികവിദ്യ ഉപയോഗിക്കുന്നു, ഇത് മുഴുനീള mRNA ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റുകളുടെ ക്രമം പ്രാപ്തമാക്കുന്നു. ഇതര വിഭജനം, ജീൻ ഫ്യൂഷനുകൾ, പോളി-അഡെനൈലേഷൻ, എംആർഎൻഎ ഐസോഫോമുകളുടെ അളവ് എന്നിവയെക്കുറിച്ചുള്ള സമഗ്രമായ പര്യവേക്ഷണം ഈ സമീപനം സഹായിക്കുന്നു.
നാനോപോർ ഏക തന്മാത്ര തത്സമയ വൈദ്യുത സിഗ്നലുകളെ ആശ്രയിക്കുന്ന ഒരു രീതിയായ നാനോപോർ സീക്വൻസിംഗ്, തത്സമയ ഫലങ്ങൾ നൽകുന്നു. മോട്ടോർ പ്രോട്ടീനുകളാൽ നയിക്കപ്പെടുന്ന, ഡബിൾ സ്ട്രാൻഡഡ് ഡിഎൻഎ ഒരു ബയോഫിലിമിൽ ഉൾച്ചേർത്ത നാനോപോർ പ്രോട്ടീനുകളുമായി ബന്ധിപ്പിക്കുന്നു, വോൾട്ടേജ് വ്യത്യാസത്തിൽ നാനോപോർ ചാനലിലൂടെ കടന്നുപോകുമ്പോൾ അത് വിച്ഛേദിക്കുന്നു. ഡിഎൻഎ സ്‌ട്രാൻഡിലെ വ്യത്യസ്‌ത അടിത്തറകൾ സൃഷ്ടിക്കുന്ന വ്യതിരിക്തമായ വൈദ്യുത സിഗ്നലുകൾ കൃത്യവും നിരന്തരവുമായ ന്യൂക്ലിയോടൈഡ് സീക്വൻസിംഗ് സുഗമമാക്കിക്കൊണ്ട് തത്സമയം കണ്ടെത്തുകയും തരംതിരിക്കുകയും ചെയ്യുന്നു. ഈ നൂതന സമീപനം ഹ്രസ്വ-വായന പരിമിതികളെ മറികടക്കുകയും സങ്കീർണ്ണമായ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോമിക് പഠനങ്ങൾ ഉൾപ്പെടെയുള്ള സങ്കീർണ്ണമായ ജീനോമിക് വിശകലനത്തിന് ചലനാത്മക പ്ലാറ്റ്ഫോം പ്രദാനം ചെയ്യുകയും ഉടനടി ഫലങ്ങൾ നൽകുകയും ചെയ്യുന്നു.
പ്ലാറ്റ്ഫോം: നാനോപോർ പ്രോമിതിയോൺ 48
-
മുഴുനീള mRNA സീക്വൻസിങ് -PacBio
NGS-അധിഷ്ഠിത mRNA സീക്വൻസിംഗ് ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ അളക്കുന്നതിനുള്ള ഒരു ബഹുമുഖ ഉപകരണമാണെങ്കിലും, ഹ്രസ്വ വായനകളെ ആശ്രയിക്കുന്നത് സങ്കീർണ്ണമായ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോമിക് വിശകലനങ്ങളിൽ അതിൻ്റെ ഉപയോഗത്തെ നിയന്ത്രിക്കുന്നു. മറുവശത്ത്, PacBio സീക്വൻസിംഗ് (Iso-Seq) ദീർഘനേരം വായിക്കുന്ന സാങ്കേതികവിദ്യ ഉപയോഗിക്കുന്നു, ഇത് മുഴുവൻ നീളമുള്ള mRNA ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റുകളുടെ ക്രമം പ്രാപ്തമാക്കുന്നു. ഇതര വിഭജനം, ജീൻ സംയോജനം, പോളി-അഡിനൈലേഷൻ എന്നിവയുടെ സമഗ്രമായ പര്യവേക്ഷണം ഈ സമീപനം സഹായിക്കുന്നു. എന്നിരുന്നാലും, ഉയർന്ന അളവിലുള്ള ഡാറ്റ ആവശ്യമുള്ളതിനാൽ ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ ക്വാണ്ടിഫിക്കേഷനായി മറ്റ് തിരഞ്ഞെടുപ്പുകളുണ്ട്. PacBio സീക്വൻസിംഗ് സാങ്കേതികവിദ്യ ഒറ്റ-തന്മാത്ര, തത്സമയ (SMRT) സീക്വൻസിംഗിനെ ആശ്രയിക്കുന്നു, ഇത് മുഴുനീള mRNA ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റുകൾ ക്യാപ്ചർ ചെയ്യുന്നതിൽ ഒരു പ്രത്യേക നേട്ടം നൽകുന്നു. സീറോ-മോഡ് വേവ് ഗൈഡുകളും (ZMWs) മൈക്രോ ഫാബ്രിക്കേറ്റഡ് കിണറുകളും ഉപയോഗിക്കുന്നത് ഈ നൂതന സമീപനത്തിൽ ഉൾപ്പെടുന്നു, അത് സീക്വൻസിങ് സമയത്ത് ഡിഎൻഎ പോളിമറേസ് പ്രവർത്തനത്തിൻ്റെ തത്സമയ നിരീക്ഷണം സാധ്യമാക്കുന്നു. ഈ ZMW-കൾക്കുള്ളിൽ, PacBio-യുടെ DNA പോളിമറേസ്, ഡിഎൻഎയുടെ ഒരു പൂരക സ്ട്രാൻഡ് സമന്വയിപ്പിക്കുന്നു, ഇത് മുഴുവൻ mRNA ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റുകളിലും വ്യാപിക്കുന്ന ദീർഘമായ വായനകൾ സൃഷ്ടിക്കുന്നു. സർക്കുലർ കൺസെൻസസ് സീക്വൻസിംഗ് (CCS) മോഡിലെ PacBio ഓപ്പറേഷൻ ഒരേ തന്മാത്രയെ ആവർത്തിച്ച് ക്രമീകരിച്ചുകൊണ്ട് കൃത്യത വർദ്ധിപ്പിക്കുന്നു. ജനറേറ്റുചെയ്‌ത ഹൈഫൈ റീഡുകൾക്ക് എൻജിഎസുമായി താരതമ്യപ്പെടുത്താവുന്ന കൃത്യതയുണ്ട്, ഇത് സങ്കീർണ്ണമായ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോമിക് സവിശേഷതകളുടെ സമഗ്രവും വിശ്വസനീയവുമായ വിശകലനത്തിന് കൂടുതൽ സംഭാവന നൽകുന്നു.
പ്ലാറ്റ്ഫോം: PacBio സീക്വൽ II; PacBio റിവിയോ
-
യൂക്കറിയോട്ടിക് mRNA സീക്വൻസിങ്-NGS
mRNA സീക്വൻസിംഗ്, ഒരു ബഹുമുഖ സാങ്കേതികവിദ്യ, പ്രത്യേക വ്യവസ്ഥകളിൽ സെല്ലുകൾക്കുള്ളിലെ എല്ലാ mRNA ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റുകളുടെയും സമഗ്രമായ പ്രൊഫൈലിംഗ് ശക്തിപ്പെടുത്തുന്നു. അതിൻ്റെ വിപുലമായ ആപ്ലിക്കേഷനുകൾ ഉപയോഗിച്ച്, ഈ അത്യാധുനിക ഉപകരണം സങ്കീർണ്ണമായ ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ പ്രൊഫൈലുകൾ, ജീൻ ഘടനകൾ, വൈവിധ്യമാർന്ന ജൈവ പ്രക്രിയകളുമായി ബന്ധപ്പെട്ട തന്മാത്രാ സംവിധാനങ്ങൾ എന്നിവ അനാവരണം ചെയ്യുന്നു. അടിസ്ഥാന ഗവേഷണം, ക്ലിനിക്കൽ ഡയഗ്‌നോസ്റ്റിക്‌സ്, ഡ്രഗ് ഡെവലപ്‌മെൻ്റ് എന്നിവയിൽ വ്യാപകമായി സ്വീകരിച്ച എംആർഎൻഎ സീക്വൻസിംഗ് സെല്ലുലാർ ഡൈനാമിക്‌സിൻ്റെയും ജനിതക നിയന്ത്രണത്തിൻ്റെയും സങ്കീർണതകളെക്കുറിച്ചുള്ള ഉൾക്കാഴ്ചകൾ വാഗ്ദാനം ചെയ്യുന്നു, ഇത് വിവിധ മേഖലകളിലെ അതിൻ്റെ സാധ്യതകളെക്കുറിച്ചുള്ള ജിജ്ഞാസ ജനിപ്പിക്കുന്നു.
പ്ലാറ്റ്ഫോം: ഇല്ലുമിന നോവസെക് എക്സ്; DNBSEQ-T7
-
നോൺ-റഫറൻസ് അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള mRNA സീക്വൻസിംഗ്-NGS
mRNA സീക്വൻസിങ് പ്രത്യേക വ്യവസ്ഥകളിൽ സെല്ലുകൾക്കുള്ളിലെ എല്ലാ mRNA ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റുകളുടെയും സമഗ്രമായ പ്രൊഫൈലിങ്ങിനെ പ്രാപ്തമാക്കുന്നു. ഈ അത്യാധുനിക സാങ്കേതികവിദ്യ, സങ്കീർണ്ണമായ ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ പ്രൊഫൈലുകൾ, ജീൻ ഘടനകൾ, വൈവിധ്യമാർന്ന ജൈവ പ്രക്രിയകളുമായി ബന്ധപ്പെട്ട തന്മാത്രാ സംവിധാനങ്ങൾ എന്നിവ അനാവരണം ചെയ്യുന്ന ഒരു ശക്തമായ ഉപകരണമായി വർത്തിക്കുന്നു. അടിസ്ഥാന ഗവേഷണം, ക്ലിനിക്കൽ ഡയഗ്‌നോസ്റ്റിക്‌സ്, ഡ്രഗ് ഡെവലപ്‌മെൻ്റ് എന്നിവയിൽ വ്യാപകമായി സ്വീകരിച്ച എംആർഎൻഎ സീക്വൻസിംഗ് സെല്ലുലാർ ഡൈനാമിക്‌സിൻ്റെയും ജനിതക നിയന്ത്രണത്തിൻ്റെയും സങ്കീർണതകളിലേക്ക് ഉൾക്കാഴ്ച നൽകുന്നു.
പ്ലാറ്റ്ഫോം: ഇല്ലുമിന നോവസെക് എക്സ്; DNBSEQ-T7
-
നീണ്ട നോൺ-കോഡിംഗ് സീക്വൻസിംഗ്-ഇല്ലുമിന
ലോംഗ് നോൺ-കോഡിംഗ് ആർഎൻഎകൾ (എൽഎൻസിആർഎൻഎ) 200 ന്യൂക്ലിയോടൈഡുകളേക്കാൾ ദൈർഘ്യമേറിയതാണ്, അവ ചുരുങ്ങിയ കോഡിംഗ് സാധ്യതയുള്ളതും കോഡിംഗ് അല്ലാത്ത ആർഎൻഎയ്ക്കുള്ളിലെ പ്രധാന ഘടകങ്ങളുമാണ്. ന്യൂക്ലിയസിലും സൈറ്റോപ്ലാസ്മിലും കാണപ്പെടുന്ന ഈ ആർഎൻഎകൾ എപ്പിജെനെറ്റിക്, ട്രാൻസ്ക്രിപ്ഷനൽ, പോസ്റ്റ്-ട്രാൻസ്ക്രിപ്ഷണൽ റെഗുലേഷൻ എന്നിവയിൽ നിർണായക പങ്ക് വഹിക്കുന്നു, സെല്ലുലാർ, മോളിക്യുലാർ പ്രക്രിയകൾ രൂപപ്പെടുത്തുന്നതിൽ അവയുടെ പ്രാധാന്യം അടിവരയിടുന്നു. സെൽ ഡിഫറൻഷ്യേഷൻ, ഒൻ്റോജെനിസിസ്, ഹ്യൂമൻ ഡിസീസ് എന്നിവയിൽ LncRNA സീക്വൻസിങ് ഒരു ശക്തമായ ഉപകരണമാണ്.
പ്ലാറ്റ്ഫോം: Illumina NovaSeq
-
ചെറിയ RNA സീക്വൻസിങ്-ഇല്ലുമിന
ചെറിയ ആർഎൻഎ (എസ്ആർഎൻഎ) തന്മാത്രകൾ, മൈക്രോആർഎൻഎകൾ (മൈആർഎൻഎകൾ), ചെറിയ ഇടപെടൽ ആർഎൻഎകൾ (സിആർഎൻഎകൾ), പിവി-ഇൻ്ററാക്ടിങ് ആർഎൻഎകൾ (പിആർഎൻഎകൾ) എന്നിവ ഉൾപ്പെടുന്നു. ഇവയിൽ, ഏകദേശം 18-25 ന്യൂക്ലിയോടൈഡുകൾ നീളമുള്ള മൈആർഎൻഎകൾ, വിവിധ സെല്ലുലാർ പ്രക്രിയകളിലെ സുപ്രധാനമായ നിയന്ത്രണ റോളുകൾക്ക് പ്രത്യേകിച്ചും ശ്രദ്ധേയമാണ്. ടിഷ്യൂ-നിർദ്ദിഷ്ടവും ഘട്ടം-നിർദ്ദിഷ്ടവുമായ എക്സ്പ്രഷൻ പാറ്റേണുകൾ ഉപയോഗിച്ച്, miRNA-കൾ വിവിധ സ്പീഷീസുകളിലുടനീളം ഉയർന്ന സംരക്ഷണം പ്രകടിപ്പിക്കുന്നു.
പ്ലാറ്റ്ഫോം: Illumina NovaSeq
-
സർക്ആർഎൻഎ സീക്വൻസിംഗ്-ഇല്ലുമിന
വൃത്താകൃതിയിലുള്ള RNA സീക്വൻസിങ് (circRNA-seq) എന്നത് വൃത്താകൃതിയിലുള്ള RNA-കളെ പ്രൊഫൈൽ ചെയ്യുകയും വിശകലനം ചെയ്യുകയും ചെയ്യുന്നതാണ്, ഇത് കാനോനിക്കൽ അല്ലാത്ത വിഭജന സംഭവങ്ങൾ കാരണം അടച്ച ലൂപ്പുകളായി മാറുന്ന ഒരു തരം RNA തന്മാത്രകൾ, ഈ RNA-യ്ക്ക് വർദ്ധിച്ച സ്ഥിരത നൽകുന്നു. ചില സർക്ആർഎൻഎകൾ മൈക്രോആർഎൻഎ സ്പോഞ്ചുകളായി പ്രവർത്തിക്കുകയും, മൈക്രോആർഎൻഎകളെ വേർതിരിക്കുകയും അവയുടെ ടാർഗെറ്റ് എംആർഎൻഎകളെ നിയന്ത്രിക്കുന്നതിൽ നിന്ന് തടയുകയും ചെയ്യുന്നുവെങ്കിലും, മറ്റ് സർക്ആർഎൻഎകൾ പ്രോട്ടീനുകളുമായി ഇടപഴകുകയോ ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ മോഡുലേറ്റ് ചെയ്യുകയോ സെല്ലുലാർ പ്രക്രിയകളിൽ പങ്കുവഹിക്കുകയോ ചെയ്യാം. സർക്ആർഎൻഎ എക്സ്പ്രഷൻ വിശകലനം ഈ തന്മാത്രകളുടെ നിയന്ത്രിത റോളുകളെക്കുറിച്ചും വിവിധ സെല്ലുലാർ പ്രക്രിയകൾ, വികസന ഘട്ടങ്ങൾ, രോഗാവസ്ഥകൾ എന്നിവയിൽ അവയുടെ പ്രാധാന്യത്തെക്കുറിച്ചും ഉള്ള ഉൾക്കാഴ്ചകൾ നൽകുന്നു, ഇത് ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ്റെ പശ്ചാത്തലത്തിൽ ആർഎൻഎ നിയന്ത്രണത്തിൻ്റെ സങ്കീർണ്ണതയെക്കുറിച്ച് ആഴത്തിൽ മനസ്സിലാക്കാൻ സഹായിക്കുന്നു.
-
മുഴുവൻ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം സീക്വൻസിംഗ് - ഇല്ലുമിന
കോഡിംഗും (mRNA), നോൺ-കോഡിംഗ് RNA-കളും (lncRNA, circRNA, miRNA) ഉൾക്കൊള്ളുന്ന, വൈവിധ്യമാർന്ന RNA തന്മാത്രകളെ പ്രൊഫൈൽ ചെയ്യുന്നതിനുള്ള ഒരു സമഗ്രമായ സമീപനം ഹോൾ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം സീക്വൻസിംഗ് വാഗ്ദാനം ചെയ്യുന്നു. സെല്ലുലാർ പ്രക്രിയകളെക്കുറിച്ച് സമഗ്രമായ ധാരണ സാധ്യമാക്കാൻ ഈ സാങ്കേതികത ഒരു നിശ്ചിത നിമിഷത്തിൽ നിർദ്ദിഷ്ട സെല്ലുകളുടെ മുഴുവൻ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റും പിടിച്ചെടുക്കുന്നു. "മൊത്തം ആർഎൻഎ സീക്വൻസിങ്" എന്നും അറിയപ്പെടുന്നു, ഇത് ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം തലത്തിൽ സങ്കീർണ്ണമായ റെഗുലേറ്ററി നെറ്റ്‌വർക്കുകൾ അനാവരണം ചെയ്യാൻ ലക്ഷ്യമിടുന്നു, മത്സരിക്കുന്ന എൻഡോജെനസ് ആർഎൻഎ (സിആർഎൻഎ), ജോയിൻ്റ് ആർഎൻഎ വിശകലനം എന്നിവ പോലുള്ള ആഴത്തിലുള്ള വിശകലനം സാധ്യമാക്കുന്നു. ഇത് പ്രവർത്തനപരമായ സ്വഭാവരൂപീകരണത്തിലേക്കുള്ള പ്രാരംഭ ഘട്ടത്തെ അടയാളപ്പെടുത്തുന്നു, പ്രത്യേകിച്ചും സർക്ആർഎൻഎ-മൈആർഎൻഎ-എംആർഎൻഎ-അധിഷ്ഠിത സിആർഎൻഎ ഇടപെടലുകൾ ഉൾപ്പെടുന്ന റെഗുലേറ്ററി നെറ്റ്‌വർക്കുകൾ അനാവരണം ചെയ്യുന്നതിൽ.
