-
BMKMANU S3000_സ്പേഷ്യൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ്
സ്പേഷ്യൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോമിക്സ് ശാസ്ത്രീയ നവീകരണത്തിൻ്റെ മുൻനിരയിൽ നിൽക്കുന്നു, ടിഷ്യൂകൾക്കുള്ളിലെ സങ്കീർണ്ണമായ ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ പാറ്റേണുകൾ അവയുടെ സ്പേഷ്യൽ സന്ദർഭം നിലനിർത്തിക്കൊണ്ട് പരിശോധിക്കാൻ ഗവേഷകരെ പ്രാപ്തരാക്കുന്നു. വിവിധ പ്ലാറ്റ്‌ഫോമുകൾക്കിടയിൽ, BMKGene BMKManu S3000 സ്പേഷ്യൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം ചിപ്പ് വികസിപ്പിച്ചെടുത്തു, 3.5µm ൻ്റെ മെച്ചപ്പെടുത്തിയ റെസല്യൂഷൻ, ഉപസെല്ലുലാർ ശ്രേണിയിലെത്തുന്നു, മൾട്ടി-ലെവൽ റെസലൂഷൻ ക്രമീകരണങ്ങൾ പ്രവർത്തനക്ഷമമാക്കുന്നു. S3000 ചിപ്പ്, ഏകദേശം 4 ദശലക്ഷം സ്പോട്ടുകൾ ഉൾക്കൊള്ളുന്നു, സ്പേഷ്യൽ ബാർകോഡ് ക്യാപ്‌ചർ പ്രോബുകൾ കൊണ്ട് ലോഡുചെയ്‌ത മുത്തുകൾ കൊണ്ട് പാളികളുള്ള മൈക്രോവെല്ലുകൾ ഉപയോഗിക്കുന്നു. സ്പേഷ്യൽ ബാർകോഡുകളാൽ സമ്പുഷ്ടമായ ഒരു cDNA ലൈബ്രറി, S3000 ചിപ്പിൽ നിന്ന് തയ്യാറാക്കുകയും പിന്നീട് Illumina NovaSeq പ്ലാറ്റ്‌ഫോമിൽ ക്രമപ്പെടുത്തുകയും ചെയ്യുന്നു. സ്പേഷ്യൽ ബാർകോഡുള്ള സാമ്പിളുകളുടെയും യുഎംഐകളുടെയും സംയോജനം സൃഷ്ടിക്കുന്ന ഡാറ്റയുടെ കൃത്യതയും പ്രത്യേകതയും ഉറപ്പാക്കുന്നു. BMKManu S3000 ചിപ്പ് വളരെ വൈവിധ്യമാർന്നതാണ്, വിവിധ ടിഷ്യൂകളിലേക്കും ആവശ്യമുള്ള വിശദാംശങ്ങളിലേക്കും നന്നായി ട്യൂൺ ചെയ്യാൻ കഴിയുന്ന മൾട്ടി-ലെവൽ റെസലൂഷൻ ക്രമീകരണങ്ങൾ വാഗ്ദാനം ചെയ്യുന്നു. ഈ അഡാപ്റ്റബിലിറ്റി, വൈവിധ്യമാർന്ന സ്പേഷ്യൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോമിക്സ് പഠനങ്ങൾക്കുള്ള മികച്ച ചോയിസായി ചിപ്പിനെ സ്ഥാപിക്കുന്നു, കുറഞ്ഞ ശബ്ദത്തോടെ കൃത്യമായ സ്പേഷ്യൽ ക്ലസ്റ്ററിംഗ് ഉറപ്പാക്കുന്നു. BMKManu S3000 ഉപയോഗിച്ചുള്ള സെൽ സെഗ്‌മെൻ്റേഷൻ സാങ്കേതികവിദ്യയുടെ ഉപയോഗം, കോശങ്ങളുടെ അതിരുകളിലേക്കുള്ള ട്രാൻസ്‌ക്രിപ്‌ഷണൽ ഡാറ്റയുടെ ഡീലിമിറ്റേഷൻ പ്രാപ്തമാക്കുന്നു, ഇത് നേരിട്ട് ജൈവശാസ്ത്രപരമായ അർത്ഥമുള്ള ഒരു വിശകലനത്തിന് കാരണമാകുന്നു. കൂടാതെ, S3000-ൻ്റെ മെച്ചപ്പെട്ട റെസല്യൂഷൻ ഓരോ സെല്ലിലും ഉയർന്ന എണ്ണം ജീനുകളും UMI-കളും കണ്ടെത്തുന്നതിന് കാരണമാകുന്നു, ഇത് സ്പേഷ്യൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്ഷൻ പാറ്റേണുകളുടെയും സെല്ലുകളുടെ ക്ലസ്റ്ററിംഗിൻ്റെയും കൂടുതൽ കൃത്യമായ വിശകലനം സാധ്യമാക്കുന്നു.
-
സിംഗിൾ ന്യൂക്ലിയസ് ആർഎൻഎ സീക്വൻസിങ്
സിംഗിൾ-സെൽ ക്യാപ്‌ചർ, ഇഷ്‌ടാനുസൃത ലൈബ്രറി നിർമ്മാണ സാങ്കേതികവിദ്യകളുടെ വികസനം, ഉയർന്ന ത്രൂപുട്ട് സീക്വൻസിംഗിനൊപ്പം, സെൽ തലത്തിൽ ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ പഠനങ്ങളിൽ വിപ്ലവം സൃഷ്ടിച്ചു. ഈ മുന്നേറ്റം സങ്കീർണ്ണമായ സെൽ പോപ്പുലേഷനുകളുടെ ആഴമേറിയതും സമഗ്രവുമായ വിശകലനം അനുവദിക്കുന്നു, എല്ലാ കോശങ്ങളിലെയും ശരാശരി ജീൻ എക്സ്പ്രഷനുമായി ബന്ധപ്പെട്ട പരിമിതികൾ മറികടക്കുകയും ഈ പോപ്പുലേഷനുകൾക്കുള്ളിലെ യഥാർത്ഥ വൈവിധ്യം സംരക്ഷിക്കുകയും ചെയ്യുന്നു. സിംഗിൾ-സെൽ ആർഎൻഎ സീക്വൻസിംഗിന് (scRNA-seq) നിഷേധിക്കാനാവാത്ത ഗുണങ്ങളുണ്ടെങ്കിലും, ചില ടിഷ്യൂകളിൽ ഇത് വെല്ലുവിളികൾ നേരിടുന്നു, അവിടെ ഒറ്റ-കോശ സസ്പെൻഷൻ സൃഷ്ടിക്കുന്നത് ബുദ്ധിമുട്ടാണെന്നും പുതിയ സാമ്പിളുകൾ ആവശ്യമായി വരുമെന്നും തെളിയിക്കുന്നു. BMKGene-ൽ, അത്യാധുനിക 10X ജീനോമിക്സ് ക്രോമിയം സാങ്കേതികവിദ്യ ഉപയോഗിച്ച് സിംഗിൾ ന്യൂക്ലിയസ് ആർഎൻഎ സീക്വൻസിംഗ് (snRNA-seq) വാഗ്ദാനം ചെയ്തുകൊണ്ട് ഞങ്ങൾ ഈ തടസ്സം പരിഹരിക്കുന്നു. ഈ സമീപനം സിംഗിൾ-സെൽ തലത്തിൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ് വിശകലനത്തിന് അനുയോജ്യമായ സാമ്പിളുകളുടെ സ്പെക്ട്രം വിശാലമാക്കുന്നു.
ഇരട്ട ക്രോസിംഗുകളുള്ള എട്ട്-ചാനൽ മൈക്രോഫ്ലൂയിഡിക്‌സ് സിസ്റ്റം ഫീച്ചർ ചെയ്യുന്ന നൂതനമായ 10X ജീനോമിക്സ് ക്രോമിയം ചിപ്പ് വഴിയാണ് ന്യൂക്ലിയസുകളെ വേർതിരിക്കുന്നത്. ഈ സംവിധാനത്തിനുള്ളിൽ, ബാർകോഡുകൾ, പ്രൈമറുകൾ, എൻസൈമുകൾ, ഒരൊറ്റ ന്യൂക്ലിയസ് എന്നിവ ഉൾപ്പെടുന്ന ജെൽ ബീഡുകൾ നാനോലിറ്റർ വലിപ്പമുള്ള എണ്ണ തുള്ളിയിൽ പൊതിഞ്ഞ് ജെൽ ബീഡ്-ഇൻ-എമൽഷൻ (ജിഇഎം) രൂപീകരിക്കുന്നു. GEM രൂപീകരണത്തെത്തുടർന്ന്, ഓരോ GEM-നുള്ളിലും സെൽ ലിസിസും ബാർകോഡ് റിലീസും സംഭവിക്കുന്നു. തുടർന്ന്, mRNA തന്മാത്രകൾ 10X ബാർകോഡുകളും യുണീക് മോളിക്യുലാർ ഐഡൻ്റിഫയറുകളും (UMIs) സംയോജിപ്പിച്ച് cDNA-കളിലേക്ക് റിവേഴ്സ് ട്രാൻസ്ക്രിപ്ഷൻ നടത്തുന്നു. ഈ സിഡിഎൻഎകൾ പിന്നീട് സ്റ്റാൻഡേർഡ് സീക്വൻസിംഗ് ലൈബ്രറി നിർമ്മാണത്തിന് വിധേയമാക്കുന്നു, ഇത് സിംഗിൾ-സെൽ തലത്തിൽ ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ പ്രൊഫൈലുകളുടെ ശക്തവും സമഗ്രവുമായ പര്യവേക്ഷണം സുഗമമാക്കുന്നു.
പ്ലാറ്റ്ഫോം: 10× ജീനോമിക്സ് ക്രോമിയം, ഇല്ലുമിന നോവസെക് പ്ലാറ്റ്ഫോം
-
10x ജീനോമിക്സ് വിസിയം സ്പേഷ്യൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം
സ്പേഷ്യൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോമിക്സ് എന്നത് ഒരു അത്യാധുനിക സാങ്കേതിക വിദ്യയാണ്, അത് ടിഷ്യൂകൾക്കുള്ളിലെ ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ പാറ്റേണുകളെ അവയുടെ സ്പേഷ്യൽ സന്ദർഭം നിലനിർത്തിക്കൊണ്ട് അന്വേഷിക്കാൻ ഗവേഷകരെ അനുവദിക്കുന്നു. ഈ ഡൊമെയ്‌നിലെ ഒരു ശക്തമായ പ്ലാറ്റ്ഫോം 10x ജീനോമിക്സ് വിസിയവും ഇലുമിന സീക്വൻസിംഗും ആണ്. 10X വിസിയത്തിൻ്റെ തത്വം ടിഷ്യൂ സെക്ഷനുകൾ സ്ഥാപിക്കുന്ന ഒരു പ്രത്യേക ക്യാപ്‌ചർ ഏരിയയുള്ള ഒരു പ്രത്യേക ചിപ്പിലാണ്. ഈ ക്യാപ്‌ചർ ഏരിയയിൽ ബാർകോഡ് ചെയ്ത പാടുകൾ അടങ്ങിയിരിക്കുന്നു, അവ ഓരോന്നും ടിഷ്യുവിനുള്ളിലെ ഒരു പ്രത്യേക സ്പേഷ്യൽ ലൊക്കേഷനുമായി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു. ടിഷ്യുവിൽ നിന്ന് പിടിച്ചെടുത്ത ആർഎൻഎ തന്മാത്രകൾ റിവേഴ്സ് ട്രാൻസ്ക്രിപ്ഷൻ പ്രക്രിയയിൽ യുണീക് മോളിക്യുലാർ ഐഡൻ്റിഫയറുകൾ (യുഎംഐ) ഉപയോഗിച്ച് ലേബൽ ചെയ്യുന്നു. ഈ ബാർകോഡ് ചെയ്ത പാടുകളും UMI-കളും ഒരു സെൽ റെസല്യൂഷനിൽ കൃത്യമായ സ്പേഷ്യൽ മാപ്പിംഗും ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ്റെ അളവും പ്രാപ്തമാക്കുന്നു. സ്പേഷ്യൽ ബാർകോഡുള്ള സാമ്പിളുകളുടെയും യുഎംഐകളുടെയും സംയോജനം സൃഷ്ടിക്കുന്ന ഡാറ്റയുടെ കൃത്യതയും പ്രത്യേകതയും ഉറപ്പാക്കുന്നു. ഈ സ്പേഷ്യൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോമിക്സ് സാങ്കേതികവിദ്യ ഉപയോഗിക്കുന്നതിലൂടെ, ഗവേഷകർക്ക് കോശങ്ങളുടെ സ്പേഷ്യൽ ഓർഗനൈസേഷനെക്കുറിച്ചും ടിഷ്യൂകൾക്കുള്ളിൽ സംഭവിക്കുന്ന സങ്കീർണ്ണമായ തന്മാത്രാ ഇടപെടലുകളെക്കുറിച്ചും ആഴത്തിലുള്ള ധാരണ നേടാനാകും, ഓങ്കോളജി, ന്യൂറോ സയൻസ്, ഡെവലപ്‌മെൻ്റൽ ബയോളജി, ഇമ്മ്യൂണോളജി എന്നിവയുൾപ്പെടെ ഒന്നിലധികം മേഖലകളിലെ ജൈവ പ്രക്രിയകൾക്ക് അടിസ്ഥാനമായ സംവിധാനങ്ങളെക്കുറിച്ച് അമൂല്യമായ ഉൾക്കാഴ്ചകൾ വാഗ്ദാനം ചെയ്യുന്നു. , ബൊട്ടാണിക്കൽ പഠനങ്ങൾ.
പ്ലാറ്റ്ഫോം: 10X ജീനോമിക്സ് വിസിയം, ഇല്ലുമിന നോവസെക്ക്
