
പാക്ബിയോ മുഴുനീള ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ്
PacBio ഫുൾ-ലെംഗ്ത്ത് ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം സീക്വൻസിംഗ്, ഐസോസെക്, ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ് ഐസോഫോമുകളുടെ കൃത്യമായ തിരിച്ചറിയൽ പ്രാപ്തമാക്കുന്നു, ഇതര പോളിഡെനൈലേഷനിലും സ്പ്ലിക്കിംഗിലും വെളിച്ചം വീശുകയും കൂടുതൽ കൃത്യമായ ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ വിശകലനത്തിലേക്ക് നയിക്കുകയും ചെയ്യുന്നു. BMKCloud PacBio ഫുൾ-ലെങ്ത്ത് ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം പൈപ്പ്ലൈൻ രൂപകൽപ്പന ചെയ്തിരിക്കുന്നത് സിഡിഎൻഎ ലൈബ്രറികളെ സർക്കുലർ കൺസെൻസസ് സീക്വൻസിംഗ് (CCS) മോഡിൽ വിശകലനം ചെയ്യുകയും ഫുൾ-ലെംഗ്ത്ത് നോൺ-ചൈമെറിക് (FLNC) സീക്വൻസുകൾ തിരിച്ചറിയുകയും ചെയ്യുന്നു, അവ അനാവശ്യമായ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റുകളായി ക്ലസ്റ്റർ ചെയ്യുന്നു. തുടർന്നുള്ള ഒരു BUSCO വിശകലനം ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ് അസംബ്ലിയുടെ പൂർണ്ണതയെ വിലയിരുത്തുന്നു. കൂട്ടിച്ചേർത്ത ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോമിൽ നിന്ന്, ഒന്നിലധികം വിശകലനങ്ങൾ നടത്തുന്നു: ഇതര സ്പ്ലൈസിംഗ്, സിമ്പിൾ സീക്വൻസ് റിപ്പീറ്റ് (എസ്എസ്ആർ), എൽഎൻസിആർഎൻഎയുടെയും അനുബന്ധ ടാർഗെറ്റ് ജീനുകളുടെയും പ്രവചനം, നോവൽ ജീനുകളുടെ പ്രവചനം, ജീൻ ഫാമിലി അനാലിസിസ്, ട്രാൻസ്ക്രിപ്ഷൻ ഫാക്ടർ വിശകലനം, ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റുകളുടെ പ്രവർത്തനപരമായ വ്യാഖ്യാനം.
ബയോ ഇൻഫോർമാറ്റിക്സ്
