ജനമമായ പരിണാമം
പിനാസ്
പരിണാമ ഉത്ഭവവും വളർത്തുമൃഗങ്ങളുടെയും ചരിത്രം ഗോൾഡ് ഫിഷിന്റെ ചരിത്രം (കാരാസിയസ് ururats ർ)
പാസിബിയോ | Llulmina | ബയാനോ ജെനോം മാപ്പ് | ഹായ്-സി ജെൻഡോം അസംബ്ലി | ജനിതക മാപ്പ് | ഗ്വാസ് | Rna-seq
ഹൈലൈറ്റുകൾ
1. ഗർഭവിദ്യാരോഗമുള്ള ഒരു നിയമസഭാ പതിപ്പിനൊപ്പം, 95.75% ആങ്കർജ്ജം 50 സ്യൂഡോക്രോമോസോമെസിലേക്ക് (സ്കാർഫോൾഡ് N50 = 31.84 എംബി) ആങ്കർ. രണ്ട് അശ്രദ്ധങ്ങൾ പരിമിതപ്പെടുത്തി.
2. ആഡേറ്റീവ് സ്വീപ്പുകളുടെ വിവിധ സ്വീപ്പുകളുടെ പ്രദേശങ്ങൾ 201 വ്യക്തികളെ പുനരാരംഭിക്കുന്നതിൽ നിന്ന് തിരിച്ചറിഞ്ഞു, 390 സ്ഥാനാർത്ഥി ജീനുകളെക്കുറിച്ച് അനാച്ഛാദനം ചെയ്തു, അത് വളർന്നുവരുന്ന 390 സ്ഥാനാർത്ഥി ജീനുകളുമായി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു.
3.GWAL ഡോർസൽ ഫിനിംഗിലെ ഗോൾഡ് ഫിഷിൽ 378 സ്ഥാനാർത്ഥി ജീനുകൾ വെളിപ്പെടുത്തി. ഒരു ടൈറോസിൻ-പ്രോട്ടീൻ കീനെസ് റിപ്പോർട്ടർ സുതാര്യതയുമായി ബന്ധപ്പെട്ട ഒരു സ്ഥാനാർത്ഥി
പശ്ചാത്തലം
പുരാതന ചൈനയിലെ ക്രൂസിയൻ കരിമീനിൽ നിന്ന് വളർന്നുവരുന്ന ഒരു ആരാധനാ മത്സ്യങ്ങളിലൊന്നാണ് ഗോൾഡ് ഫിഷ് (കാരിഷോസ് അറററ്റേസ്). ചാൾസ് ഡാർവിൻ അവരെ അഭിപ്രായമിട്ടു "എന്നതിന്റെ അനന്തമായ വൈവിധ്യത്തെ മറികടന്ന് ഞങ്ങൾ ഘടനയുടെ ഏറ്റവും അസാധാരണമായ മാറ്റങ്ങൾ നിറവേറ്റുന്നു". വളരെ വൈവിധ്യമാർന്ന സവിശേഷതകളും പ്രജനനത്തിന്റെയും വിവിധ സവിശേഷതകളും പ്രജനനത്തിന്റെയും ദൈർഘ്യമേറിയ ചരിത്രവും മത്സ്യ ഫിസിയോളജിക്കും പരിണാമത്തിനും സ്വർണ്ണ മത്സ്യത്തെ മികച്ച ജനിതക മാതൃകയാക്കുന്നു.
നേട്ടങ്ങൾ
ഗോൾഡ് ഫിഷ് പ്രായോഗികം
Jപാക്ബിയോ, പ്രശ്നമുള്ള ജോഡി-അവസാനം തുടർച്ചയായ ഡാറ്റയുടെ തൈലി വിശകലനം ആരംഭിക്കുന്നത് പ്രാരംഭ 1.657 ഗ്രാം ഡ്രാഫ്റ്റ് അസംബ്ലി (contig N50 = 474 KB). ബയോണാനോ ഒപ്റ്റിക്കൽ മാപ്പ് ജനറേറ്റുചെയ്തു, നിയമസഭയുടെ വലുപ്പം (കണക്കാക്കിയ ജീനോം വലുപ്പം: 1.8 ജിബി). ഹൈ-സി അധിഷ്ഠിത നിയമസഭ 606 കെബി മുതൽ 31.84 എംബി വരെ മെച്ചപ്പെടുത്തി. 95.75 ശതമാനം (1.65 ജിബി) ഓറിയന്റഡ്, ആങ്കറിംഗ് നിരക്ക് നേടിയത്. 56,251 കോഡിംഗ് ജീനുകളും 10,098 ലോംഗ് നോൺ-കോഡിംഗ് ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റും ഉൾപ്പെടുന്നു. മാത്രമല്ല, 38 സാധ്യതയുള്ള കേന്ദ്ര പ്രദേശങ്ങൾ 50 ക്രോമസോമുകളിൽ പ്രവചിക്കപ്പെട്ടു.
FIG.1 സ്വർണ്ണ മത്സ്യം ജീനോം
Tഒരു പുരാതന ഹൈബ്രിഡൈസേഷൻ ഇവന്റിൽ നിന്ന് ഉണ്ടായ 50 ഗോൾഡ് ഫിഷ് ക്രോമസോമുകളിൽ കബോർഡ് സെറ്റുകൾ തിരിച്ചറിഞ്ഞു. സ്വർണ്ണ മത്സ്യവും ബാർബിനയും തമ്മിലുള്ള ചേരുന്ന വായനകൾ ഉള്ള ക്രോമസോമുകളുടെ സെറ്റ് (CHRA01 ~ A25), അതായത് ബാർബിനയ്ക്ക് പൊതുവായതും അവശിഷ്ടങ്ങളും ഉപജീവനം b25).
വളർത്തുമൃഗവും സെലക്ടീവ് സ്വീപ്പുകളും
Aമൊത്തം 16 കാട്ടു തരം ക്രൂസ്യൻ കാർപുകളും 185 പ്രതിനിധി ഗോൾഡ് ഫിഷ് വേരിയന്റുകളും ഏകദേശം 12.5x ന്റെ (4.3 erabes) പ്രതിഫലമായിരുന്നു,,, ഡാറ്റയുടെ 4.3 ടെറാബാസുകൾ സൃഷ്ടിക്കുന്നു. ഫൈലോജെനിറ്റിക് പുനർനിർമ്മാണവും പിസിഎ വിശകലനവും സാധാരണ ഗോൾഡ് ഫിഷ്, മറ്റ് ഗോൾഡ് ഫിഷിനേക്കാൾ അടുത്ത ബന്ധം സ്ഥിരീകരിച്ചു.
Lനാല് ഉപവിഷക്കഷണങ്ങളെക്കുറിച്ച് ഡിസ്ക് ആർട്ട് വിശകലനം നടത്തിയത് ഗോൾഡ്ഫിഷിലെ വളർത്തുമറിയും ശക്തമായ കൃത്രിമ തിരഞ്ഞെടുപ്പും സംബന്ധിച്ച ജനസംഖ്യാ ജനിതക കുടലിന്റെ നിലനിൽപ്പിനെ പിന്തുണയ്ക്കുന്നു. വെൻ ഗോൾഡ് ഫിഷും മുട്ട ഗോൾഡ് ഫിഷും ഈ ജനിതകനായ വൈവിധ്യത്തെ () വർദ്ധിച്ചുവരുന്ന തന്ത്രപരമായ വൈവിധ്യത്തെ (π) വർദ്ധിച്ചു. 50 സെലക്ടീവ് സ്വീപ്പ് ജെപ്മെന്റിക് പ്രദേശങ്ങളും 946 ഉല്പത്തവും പ്രതിനിധി ഡാറ്റയിൽ നിന്ന് (33 ഗോൾഡ് ഫിഷ്, 16 ക്രൂഷ്യൻ ക്രാപ്പ്) എന്നിവയിൽ നിന്ന് കണ്ടെത്തി. 201 വ്യക്തികളായി വിശകലനം വികസിപ്പിക്കുക, 393 ജീനുകൾ പൂർത്തിയാക്കിയ സെലക്ടീവ് സ്വീപ്പ്. ഗോൾഡ്ഫിഷിലെ പ്രധാന വളർത്തുമറി സ്വഭാവവിശേഷങ്ങളുമായി ബന്ധപ്പെട്ട ഫിനോടൈപ്പുകൾക്ക് ഈ ജീനുകൾ കണ്ടെത്തിയ ഏറ്റവും കുറഞ്ഞ വൈവിധ്യത്തെ കണ്ടെത്തി.
FIG 3. ജീനോം-വൈഡ് ഡോർസ്റ്റേഷൻ-അനുബന്ധ വിശകലനം
ഡൊമിറ്റഡ് ഗോൾഡ് ഫിഷിലെ ഗ്വാസ്
Dഒർസൽ ഫിൻ ഒരു പ്രധാന സവിശേഷതയാണ് മുട്ട ഗോൾഡ് ഫിഷിൽ നിന്ന് വേർതിരിച്ചത്. 96 വെൻ ഗോൾഡ് ഫിഷിലും 87 മുട്ട ഗോൾഡ് ഫിഷ് ചെയ്യുന്ന ജിഡബ്ല്യുഎമാർ 378 ക്രോമസോമുകളിലും വ്യാപിച്ചുകിടക്കുന്ന 378 സ്ഥാനാർത്ഥി ജീനുകൾ വെളിപ്പെടുത്തി. ഈ കാൻഡിഡേറ്റ് ജീനുകളിലെ പ്രവർത്തനപരമായ വിശകലനം "സെൽ ഉപരിതല റിസപ്റ്റർ സിഗ്നിംഗ്", "ട്രാൻസ്പ്രെൻ ഗതാഗതം", "എക്റ്റെമ്പ് ബ്രഗേഷൻ", "എക്വേൽ സിസ്റ്റം ഡെവലപ്മെന്റ്" തുടങ്ങിയ ബയോളജിക്കൽ പ്രോസസ്സുകൾ ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്തു.
ഡൊൺസ്റ്ററേറ്റഡ് ഗോൾഡ് ഫിഷിലെ ചിത്രം 4 ഗ്വാസ്
Iസുതാര്യമായ സ്കെയിലുമായി ബന്ധപ്പെട്ട സ്വഭാവവിശേഷങ്ങളുടെ n gwas, ഒരു ശക്തമായ അസോസിയേഷൻ കൊടുമുടി കണ്ടെത്തി. ഒരു ടൈറോസിൻ-പ്രോട്ടീൻ കീനാസ് റിസപ്റ്റർ ഒരു ജീൻ എൻകോഡിംഗ് തിരിച്ചറിഞ്ഞു.
സുതാര്യമായ സ്കെയിലുമായി ബന്ധപ്പെട്ട സ്വഭാവവിശേഷങ്ങളുടെ ചിത്രം 5 ഗ്വാസ്
ബന്ധപ്പെടല്
Cഹെൻ ഡി ഇറ്റ് അൽ. പരിണാമ ഉത്ഭവവും വളർത്തിയെടുക്കലും ഗോൾഡ് ഫിഷിന്റെ (കാരാസിയസ് urura വാറ്റസ്). Pnas (2020)
വാര്ത്ത ബയോമാർക്കർ ടെക്നോളജീസ് ഉപയോഗിച്ച് ഏറ്റവും പുതിയ വിജയകരമായ കേസുകൾ പങ്കിടുന്നതിൽ ലക്ഷ്യമിടുന്നു, നോവൽ ശാസ്ത്രീയ നേട്ടങ്ങൾ ക്യാപ്ചർ ചെയ്യുന്നു, കൂടാതെ പഠനസമയത്ത് പ്രയോഗിച്ച പ്രമുഖരീതികളുമുണ്ട്.
പോസ്റ്റ് സമയം: ജനുവരി -04-2022