മുഴുവനായും പുനരവലോകനം

സാർ-സിഒ -2 ന്റെ ജീനോമിക്സ് നിരീക്ഷണം ഒരു എൻഎസ്പി 1 ഇല്ലാതാക്കപ്പെടുന്ന ഒരു എൻഎസ്പി 1 ഇല്ലാതാക്കത്വം ഞാൻ ഇന്റർഫെറോൺ പ്രതികരണം
നാനോപോർ | Llulmina | മുഴുവനായും മുഴുവൻ ജീവനക്കാരും | മെറ്റാജെനോമിക്സ് | Rna-seq | ഞെരുങ്ങിപ്പൂ
ഈ പഠനത്തിലെ സാമ്പിൾ സീക്വൻസിംഗിന് ബയോമാർക്കർ ടെക്നോളജീസ് സാങ്കേതിക സഹായം നൽകി.
ഹൈലൈറ്റുകൾ
1.സാർസ്-കോത്ത് -2 പ്രാന്തപ്രദേശവും ഫിലോഗ്നറ്റിക് വിശകലനവും 31 എസ്എൻപികൾ, 4 ഇന്നിൾ എന്നിവയുൾപ്പെടെ 35 ആവർത്തിച്ചുള്ള മ്യൂട്ടേഷനുകൾ തിരിച്ചറിയുന്നു.
2. 117 ക്ലിനിക്കൽ ഫിനോടൈപ്പുകളുള്ള സോസിയേഷൻ വെളിപ്പെടുത്തുന്നത്
പ്രധാന മ്യൂട്ടേഷനുകൾ.
Δ500-532 എൻഎസ്പി 1 കോഡിംഗ് മേഖലയിൽ താഴ്ന്ന വൈറൽ ഉപയോഗിച്ച് പരസ്പര ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു
3. ലോഡുചെയ്യുക, സെറം ifn-.
4. δ500-532 മ്യൂട്ടേഷൻ ഉപയോഗിച്ച് വിഘടനയുള്ള ഒറ്റത്തവണ ലോവർ -1
രോഗം ബാധിച്ച കോശങ്ങളിലെ പ്രതികരണം.
പരീക്ഷണാത്മക രൂപകൽപ്പന

നേട്ടങ്ങൾ


1. കോറിഡ് -19 എപ്പിഡെമോളജിക്കൽ, ജീനോമിക് നിരീക്ഷണം
2020, 2020 മുതൽ 2020 വരെ സിചുവാൻ പ്രവിശ്യയിൽ ചൈനയിൽ ക്ലിനിക്കൽ ഡാറ്റ ശേഖരിച്ചു. മൂലധനം. സിചുവാനിലെ സ്ഥിരീകരിച്ച കേസുകൾ ഗണ്യമായി വർദ്ധിച്ചു, ജനുവരി 30 ന് ഉയർന്നു. കൂടാതെ, വൈറസ് സ്പ്രെഡ് തടയുന്നതിൽ സാമൂഹിക അകലം ഒരു പ്രധാന ഘടകമായിരിക്കുമെന്ന് ഡാറ്റ പിന്തുണയ്ക്കുന്നു.
ചിത്രം 1. സിചുവാൻ പ്രവിശ്യയിലെ സിചുവാൻ പ്രവിശ്യയിൽ നടന്ന എപ്പിഡെമോളജിക്കൽ പഠനം
2. സാർസ്-കോത്ത് -2 ജീനോം നിർമ്മാണവും വേരിയന്റുകളും തിരിച്ചറിയൽ
മൾട്ടിപ്ലക് പിസിആർ ആംപ്ലിസേഷനുമായി, നാനോപോർ സീക്വൻസിംഗ്, 248 രോഗികളിൽ നിന്ന് 310 അല്ലെങ്കിൽ ഭാഗിക-സമ്പൂർണ്ണ ജീനോമുകൾ ഏകദേശം ജനറേറ്റുചെയ്തു. 80% ജെനുമൺസ് 10 വായനകൾ (ശരാശരി ഡെപ്ത്: 0.39 മീറ്റർ വായന).

ചിത്രം 2. സിചുവാൻ കൂട്ടാളിലെ ഓരോ വേരിയന്റുകളുടെ ആവൃത്തി
മൊത്തം 104 എസ്എൻപികളും 18 ഇഡക്സുകളും കണ്ടെത്തിയ സാംസ്-കോത്ത് -2 ജീമുകളിൽ നിന്നാണ് തിരിച്ചറിഞ്ഞത്, അതിൽ 31 എസ്എൻപികളും 4 ഇൻഡക്സുകളും ആവർത്തിച്ചുള്ള ജനിതക വേരിയന്റുകളായി തിരിച്ചറിഞ്ഞു. വുഹനിൽ നിന്നുള്ള 169 സാമ്പിളുകളുമായി താരതമ്യപ്പെടുത്തുന്നതിലൂടെ, ജിസൈഡിലെ ഉയർന്ന നിലവാരമുള്ള പ്രസിദ്ധീകരണ മുൻതൂക്കങ്ങളുമായി താരതമ്യപ്പെടുത്തി, മറ്റ് ഭൂഖണ്ഡങ്ങളിൽ അവതരിപ്പിച്ച 35 വേരിയന്റുകളിൽ 29 എണ്ണം. , പ്രത്യേകിച്ച്, δ500-532, acca18108, t13243c എന്നിവയുൾപ്പെടെ നാല് വേരിയന്റുകൾ, ഈ വേരിയന്റുകൾ വ്ഹാനിൽ നിന്ന് വളരെ ആകർഷകമാകാൻ സാധ്യതയുണ്ടെന്ന് സൂചിപ്പിക്കുന്നു, ഇത് സന്ദർശിക്കുന്നു രോഗികളുടെ യാത്രാ രേഖകൾ.
പരമാവധി സാധ്യത (എംഎൽ) രീതിയും ബാസ്റ്റീഷ്യൻ മോളിക്യുലാർ ക്ലോക്കും അടുത്തിറങ്ങി 88 പുതിയ വൈറസ് എസ്എഫ്ആർഎ.എഫ്.എഫ്. Δ500-532 ഉള്ള ജീനോമുകൾ (എൻഎസ്പി 1 കോഡിംഗ് മേഖലയിലെ ഇല്ലാതാക്കലുകൾ) ഫൈലോജെനെറ്റിക് ട്രീയിൽ വിതരണം ചെയ്യുന്നതായി കണ്ടെത്തി. എൻഎസ്പി 1 വേരിയന്റുകളെക്കുറിച്ചുള്ള ഹാപ്ലോടൈപ്പ് വിശകലനം ഒന്നിലധികം നഗരങ്ങളിൽ നിന്ന് അവയെ തിരിച്ചറിഞ്ഞു. ഈ ഫലങ്ങൾ സൂചിപ്പിക്കുന്നത് ഒന്നിലധികം നഗരങ്ങളിൽ നടക്കാമെന്നും വുഹാനിൽ നിന്ന് ഒന്നിലധികം തവണ ഇറക്കുമതി ചെയ്യാനും നിർദ്ദേശിച്ചു.

ചിത്രം 2. സാർസ്-സിഒ -2 ജീമുകളിൽ ആവർത്തിച്ചുള്ള ജനിതക വേരിയന്റുകളും ഫൈലോജെനെറ്റിക് വിശകലനവും
3. ക്ലിനിക്കൽ പ്രത്യാഘാതങ്ങളുള്ള ആവർത്തിച്ചുള്ള ജനിതക വേരിയന്റുകളുടെ അസോസിയേഷൻ
117 ക്ലിനിക്കൽ ഫിനോടൈപ്പുകൾ കോവിഡ് -19 തീവ്രതയുമായി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു, അവിടെ 19 സെറ്റിയുമായി ബന്ധപ്പെട്ട ഫിനോടൈപ്പുകൾ കഠിനമായ, കടുത്ത സ്വഭാവവിശേഷങ്ങൾ എന്ന് തരംതിരിച്ചു. ഈ സ്വഭാവവിശേഷങ്ങളും 35 ആവർത്തിച്ചുള്ള ജനിതക വേരിയന്റുകളും തമ്മിലുള്ള ബന്ധം ദ്വി-ക്ലസ്റ്റർ ഹീറ്റ് മാപ്പിൽ കഴിഞ്ഞു. ഒരു ജിഎസ്ഇ-പോലെ റാങ്ക് റാങ്കിലുള്ള എൻറിക്മെന്റ് വിശകലനം esr, സെറം ifn-β and and + cd8 + t സെൽ എന്നിവയുമായി നെഗറ്റീവ് പെട്ടെന്നുതന്നെ ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു. മാത്രമല്ല, ക്യുപിആർ ടെസ്റ്റുകൾ δ500-532 ന് ഏറ്റവും ഉയർന്ന സിടി മൂല്യം, അതായത് ഏറ്റവും താഴ്ന്ന വൈറൽ ലോഡ് എന്നിവ കാണിക്കുന്നു.


ചിത്രം 3. ക്ലിനിക്കൽ ഫിനോടൈപ്പുകളുള്ള ആവർത്തിച്ചുള്ള ജനിതക വേരിയന്റുകളുടെ അസോസിയേഷനുകൾ
4. വൈറൽ മ്യൂട്ടേഷൻ അനുബന്ധ ക്ലിനിക്കൽ ഫിനോടൈപ്പുകളിൽ മൂല്യനിർണ്ണയം
എൻഎസ്പി 1 ഫംഗ്ഷനുകളിൽ δ500-532 ന്റെ ഫലങ്ങൾ മനസിലാക്കാൻ, പൂർണ്ണ-നീളം, wt nsp1 പ്രകടിപ്പിക്കുന്ന പ്ലാസ്മിഡുകളും ഇല്ലാതാക്കുകളും ഇല്ലാതാക്കുക. ഓരോ ചികിത്സിക്കുന്ന ഓരോ ട്രീറ്റ് ചെയ്യപ്പെട്ട ഹെക്ക് 39 ടി സെല്ലുകളും പിസിഎ വിശകലനത്തിനായി പ്രോസസ്സ് ചെയ്തു, ഇത് ഇല്ലാതാക്കൽ മ്യൂട്ടന്റുകൾ താരതമ്യേന കൂടുതൽ അടുത്ത് കൂട്ടമായി, wt nsp1 ൽ നിന്ന് വളരെ വ്യത്യസ്തമായിരുന്നു. മ്യൂട്ടന്റുകളിൽ ഗണ്യമായി മുന്നേറ്റപ്പെട്ട ജീനുകൾ "റെബോയിസിനെറ്റിൻ കോംപ്ലക്സിസ് ബയോജെനെസിസ്", "മെംബ്രെയ്ൻ / എർ", ", മെംബ്രൺ / എ മുതലായവ, രണ്ട് ഇല്ലാതാക്കലുകളും ഡബ്ല്യുടിയിൽ നിന്ന് ഒരു പ്രത്യേക എക്സ്ഷൻസേഷൻ പാറ്റേൺ കാണിച്ചു.

ചിത്രം 4. WT NSP1 നൽകുന്ന HEK239T സെല്ലുകളിലെ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം വിശകലനം, അത് ഇല്ലാതാക്കുക
ഐഎഫ്എൻ -1 പ്രതികരണത്തിൽ ഇല്ലാതാക്കലുകളുടെ ബാധകതയും അമിത സുരക്ഷാ പഠനത്തിൽ പരീക്ഷിച്ചു. പരീക്ഷിച്ച എല്ലാ ഇല്ലാതാക്കലുകളും കൈമാറ്റം Hek239t ലംഘിച്ച HEK239T, A549 സെല്ലുകൾ എന്നിവയും ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം ലെവലിലും പ്രോട്ടീൻ ലെവലും കുറയ്ക്കുന്നതായി കാണിച്ചു. ഇല്ലാതാക്കുന്നതിലെ "വൈറസ് പ്രതികരണത്തെ", "വൈറൽ ജെനോം റെപ്ലിക്കേഷൻ", "ആർന്ന പോളിമറേസ്", "ആർഎൻഎ പോളിമറേസ് II എന്നിവയിൽ സമ്പന്നരായിരുന്നു എന്നതാണ് ശ്രദ്ധേയം.

ചിത്രം 5. Δ500-532 മ്യൂട്ടന്റിൽ ഇന്റർഫെറോൺ സിഗ്നലിംഗ് പാതകളുടെ നിയന്ത്രണം
ഈ പഠനത്തിൽ, വൈറസിലെ ഈ ഇല്ലാതാക്കലുകളുടെ സ്വാധീനം വൈറൽ അണുബാധ പഠനങ്ങൾ സ്ഥിരീകരിച്ചു. ചില മ്യൂട്ടന്റുകളുള്ള വൈറസുകൾ ക്ലിനിക്കൽ സാമ്പിളുകളിൽ നിന്ന് ഒറ്റപ്പെട്ടു, ഒപ്പം കാലൂ -3 സെല്ലുകൾക്കും രോഗം ബാധിച്ചു. വൈറൽ അണുബാധ പഠനത്തെക്കുറിച്ചുള്ള വിശദമായ ഫലങ്ങൾ പേപ്പറിൽ വായിക്കാൻ കഴിയും.
doi:10.1016 / J.CHOM.2021.01.01.015
ബന്ധപ്പെടല്
ലിൻ ജെ, ടാംഗ് സി, വെയ് എച്ച്, മറ്റുള്ളവർ. സാർ-കോത്ത് -2 പേർ ഓർമിപ്പിക്കുന്നത് ഒരു എൻഎസ്പി 1 ഇല്ലാതാക്കപ്പെടാൻ അൺഡുലേറ്റ്സ് തരം ഞാൻ ഇന്റർഫെറോൺ പ്രതികരണം [j]. സെൽ ഹോസ്റ്റും മൈക്രോസും, 2021.
വാർത്തകളും ഹൈലൈറ്റുകളും ബയോമാർക്കർ ടെക്നോളജീസ് ഉപയോഗിച്ച് ഏറ്റവും പുതിയ വിജയകരമായ കേസുകൾ പങ്കിടുന്നതിൽ ലക്ഷ്യമിടുന്നു, നോവൽ ശാസ്ത്രീയ നേട്ടങ്ങൾ ക്യാപ്ചർ ചെയ്യുന്നു, കൂടാതെ പഠനസമയത്ത് പ്രയോഗിച്ച പ്രമുഖരീതികളുമുണ്ട്.
പോസ്റ്റ് സമയം: ജനുവരി -06-2022