നാനോപോർ മുഴുനീള ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ്

നാനോപോർ ട്രാൻസ്‌ക്രിപ്‌റ്റോം സീക്വൻസിംഗ് എന്നത് പൂർണ്ണ ദൈർഘ്യമുള്ള സിഡിഎൻഎകൾ ക്രമപ്പെടുത്തുന്നതിനും ട്രാൻസ്‌ക്രിപ്റ്റ് ഐസോഫോമുകൾ കൃത്യമായി തിരിച്ചറിയുന്നതിനും അളക്കുന്നതിനുമുള്ള ശക്തമായ ഒരു രീതിയാണ്. BMKCloud നാനോപോർ ഫുൾ-ലെംഗ്ത്ത് ട്രാൻസ്‌ക്രിപ്‌റ്റോം പൈപ്പ്‌ലൈൻ രൂപകൽപ്പന ചെയ്‌തിരിക്കുന്നത് നാനോപോർ പ്ലാറ്റ്‌ഫോമിൽ ജനറേറ്റുചെയ്‌ത RNA-Seq ഡാറ്റയെ ഉയർന്ന നിലവാരമുള്ള നന്നായി വ്യാഖ്യാനിച്ച റഫറൻസ് ജീനോമിനെതിരെ വിശകലനം ചെയ്യുന്നതിനാണ്, ഇത് ജീൻ, ട്രാൻസ്‌ക്രിപ്റ്റ് തലത്തിൽ ഗുണപരവും അളവ്പരവുമായ വിശകലനം നൽകുന്നു. ഗുണനിലവാര നിയന്ത്രണത്തിന് ശേഷം, ഫുൾ-ലെംഗ്ത്ത് നോൺ-ചിമെറിക് (FLNC) സീക്വൻസുകൾ നേടുകയും അനാവശ്യ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റുകൾ നീക്കം ചെയ്യുന്നതിനായി കൺസെൻസസ് സീക്വൻസുകൾ റഫറൻസ് ജീനോമിലേക്ക് മാപ്പ് ചെയ്യുകയും ചെയ്യുന്നു. ഈ ട്രാൻസ്‌ക്രിപ്റ്റ് സെറ്റിൽ നിന്ന്, എക്സ്പ്രഷൻ അളക്കുകയും വ്യത്യസ്തമായി പ്രകടിപ്പിക്കുന്ന ജീനുകളും ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റുകളും തിരിച്ചറിയുകയും പ്രവർത്തനപരമായി വ്യാഖ്യാനിക്കുകയും ചെയ്യുന്നു. പൈപ്പ്ലൈനിൽ ഇതര പോളിഡൈനലേഷൻ (എപിഎ) വിശകലനം, ഇതര സ്പ്ലിസിംഗ് വിശകലനം, സിമ്പിൾ സീക്വൻസ് റിപ്പീറ്റ് (എസ്എസ്ആർ) വിശകലനം, എൽഎൻസിആർഎൻഎയുടെയും അനുബന്ധ ലക്ഷ്യങ്ങളുടെയും പ്രവചനം, കോഡിംഗ് സീക്വൻസുകളുടെ പ്രവചനം (സിഡിഎസ്), ജീൻ ഫാമിലി അനാലിസിസ്, ട്രാൻസ്ക്രിപ്ഷൻ ഫാക്ടർ വിശകലനം, നോവൽ ജീനുകളുടെ പ്രവചനം എന്നിവയും ഉൾപ്പെടുന്നു. ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റുകളുടെ പ്രവർത്തനപരമായ വ്യാഖ്യാനവും.