mRNA-seq (NGS) - ഡി നോവോ

എംആർഎൻഎ സീക്വൻസിങ്, സെല്ലുകളിലെ എല്ലാ എംആർഎൻഎ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റുകളുടെയും പ്രൊഫൈൽ പ്രത്യേക വ്യവസ്ഥകളിൽ അനുവദിക്കുന്നു, വിവിധ ഗവേഷണ മേഖലകളിൽ വ്യാപകമായി ഉപയോഗിക്കുന്ന സാങ്കേതികവിദ്യയാണിത്. BMKCloud De novo mRNA-seq പൈപ്പ്ലൈൻ രൂപകൽപ്പന ചെയ്തിരിക്കുന്നത് റഫറൻസ് ജീനോം ലഭ്യമല്ലാത്തപ്പോൾ പോളി-എ സമ്പുഷ്ടമായ സീക്വൻസിങ് ലൈബ്രറികൾ വിശകലനം ചെയ്യുന്നതിനാണ്. പൈപ്പ്ലൈൻ ആരംഭിക്കുന്നത് ഗുണനിലവാര നിയന്ത്രണത്തോടെയാണ്, തുടർന്ന്ഡി നോവോട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ് അസംബ്ലിയും യൂണിജീൻ സെറ്റ് സെലക്ഷനും. ഏകീകൃത ഘടന വിശകലനം കോഡിംഗ് സീക്വൻസും (സിഡിഎസ്) സിമ്പിൾ സീക്വൻസ് റിപ്പീറ്റുകളും (എസ്എസ്ആർ) പ്രവചിക്കുന്നു. തുടർന്ന്, ഡിഫറൻഷ്യൽ എക്‌സ്‌പ്രഷൻ വിശകലനം പരിശോധിച്ച അവസ്ഥകളിൽ ഡിഫറൻഷ്യലി എക്‌സ്‌പ്രസ് ചെയ്‌ത ജീനുകളെ (ഡിഇജി) കണ്ടെത്തുന്നു, തുടർന്ന് ജീവശാസ്ത്രപരമായ ഉൾക്കാഴ്ചകൾ എക്‌സ്‌ട്രാക്റ്റുചെയ്യുന്നതിന് ഡിഇജികളുടെ പ്രവർത്തനപരമായ വ്യാഖ്യാനവും സമ്പുഷ്ടീകരണവും.