lncrna

ലോംഗ് നോൺ-കോഡിംഗ് ആർഎൻഎകൾ (എൽഎൻസിആർഎൻഎ) 200 ന്യൂക്ലിയോടൈഡുകളേക്കാൾ നീളമുള്ള ആർഎൻഎകളാണ്. എൽഎൻസിആർഎൻഎയും എംആർഎൻഎ എക്സ്പ്രഷനും ഒരുമിച്ച് വിശകലനം ചെയ്തുകൊണ്ട് ഉയർന്ന നിലവാരമുള്ള, നന്നായി വ്യാഖ്യാനിച്ച റഫറൻസ് ജീനോം ഉപയോഗിച്ച് ആർആർഎൻഎ ശോഷിച്ച ലൈബ്രറികളെ വിശകലനം ചെയ്യുന്നതിനാണ് ബിഎംകെക്ലൗഡ് എൽഎൻസിആർഎൻഎ പൈപ്പ്ലൈൻ രൂപകൽപ്പന ചെയ്തിരിക്കുന്നത്. റീഡ് ട്രിമ്മിംഗിനും ഗുണനിലവാര നിയന്ത്രണത്തിനും ശേഷം, ട്രാൻസ്‌ക്രിപ്റ്റുകൾ കൂട്ടിച്ചേർക്കുന്നതിന് റീഡുകൾ റഫറൻസ് ജീനോമുമായി വിന്യസിക്കുന്നു, തുടർന്നുള്ള ജീൻ ഘടന വിശകലനം ഇതര വിഭജനവും പുതിയ ജീനുകളും വെളിപ്പെടുത്തുന്നു. ട്രാൻസ്‌ക്രിപ്റ്റുകളെ mRNA അല്ലെങ്കിൽ lncRNA ആയി തിരിച്ചറിയുന്നു, കൂടാതെ ഡിഫറൻഷ്യൽ എക്സ്പ്രഷൻ വിശകലനം വ്യത്യസ്തമായി പ്രകടിപ്പിക്കുന്ന lncRNA-കളെയും അവയുടെ ലക്ഷ്യങ്ങളെയും വ്യത്യസ്തമായി പ്രകടിപ്പിക്കുന്ന ജീനുകളെയും (DEGS) തിരിച്ചറിയുന്നു. DEG-കളും വ്യത്യസ്തമായി പ്രകടിപ്പിക്കുന്ന lncRNA ടാർഗെറ്റുകളും സമ്പുഷ്ടമായ ഫങ്ഷണൽ വിഭാഗങ്ങൾ കണ്ടെത്താൻ പ്രവർത്തനപരമായി വ്യാഖ്യാനിക്കുന്നു.