പരിണാമ ജനിതകം
സേവന ആനുകൂല്യങ്ങൾ
ടാക്കഗി മറ്റുള്ളവരും.,പ്ലാന്റ് ജേണൽ, 2013
●സമഗ്ര ബയോഫോർമറ്റിക് വിശകലനം:ഇംപ്രിമെന്റുകളുടെ പരിണാമ സാധ്യതയെ പ്രതിഫലിപ്പിക്കുന്നതും സംയോജിത പരിണാമത്തിന്റെയും സ്വാധീനമുള്ള വിശ്വസനീയമായ ഫൈലോജെനെറ്റിക് ബന്ധം വെളിപ്പെടുത്തുന്ന ജനിതക വൈവിധ്യത്തിന്റെ കണക്കുകൂട്ടൽ പ്രാപ്തമാക്കുന്നു.
●ഓപ്ഷണൽ ഇച്ഛാനുസൃത വിശകലനം: ന്യൂക്ലിയേഡിലെയും അമിനോ ആസിഡുകളുടെ നിലയിലെയും വ്യത്യാസങ്ങളെ അടിസ്ഥാനമാക്കി വ്യതിചലന സമയവും വേഗതയും കണക്കാക്കുന്നു.
●വിപുലമായ വൈദഗ്ധ്യവും പ്രസിദ്ധീകരണ രേഖകളും: ജനസംഖ്യയിലും പരിണാമ ജനിതകശാസ്ത്ര പ്രോജക്റ്റുകളിലും ബിഎംകെജെൻ വൻ അനുഭവം നേടി, ആയിരക്കണക്കിന് ജീവികൾ, തന്മാത്ര സസ്യങ്ങൾ, പ്ലാന്റ് ബയോടെക്നോളജി ജേണൽ മുതലായവയിൽ പ്രസിദ്ധീകരിച്ച 1000 ഉന്നത പദ്ധതികൾക്ക് കാരണമായി.
● വളരെ വിദഗ്ധരായ ബയോ ഇൻഫോർമാറ്റിക്സ് ടീമും ഹ്രസ്വ വിശകലന ചക്രവും: വിപുലമായ ജീനോമിക്സ് വിശകലനത്തിൽ മികച്ച അനുഭവത്തോടെ, സ്വിഫ്റ്റ് ടേൺടൗണ്ട് സമയം ഉപയോഗിച്ച് ബിഎംകെജെൻ ടീം സമഗ്ര വിശകലനങ്ങൾ നൽകുന്നു.
Cast ന് ശേഷമുള്ള പിന്തുണ:ഞങ്ങളുടെ പ്രതിബദ്ധത 3 മാസത്തെ അപേക്ഷിച്ച് 3 മാസത്തെ തുടർന്നുള്ള സേവന കാലയളവിലൂടെ വിപുലീകരിക്കുന്നു. ഈ സമയത്ത്, ഫലങ്ങളുമായി ബന്ധപ്പെട്ട ഏതെങ്കിലും ചോദ്യങ്ങൾ പരിഹരിക്കുന്നതിന് ഞങ്ങൾ പ്രോജക്റ്റ് ഫോളോ-അപ്പ്, ട്രബിൾഷൂട്ടിംഗ് സഹായം, ക്യൂ & എ സെഷനുകൾ വാഗ്ദാനം ചെയ്യുന്നു.
സേവന സവിശേഷതകളും ആവശ്യകതകളും
| സീക്വൻസിംഗ് തരം | ശുപാർശ ചെയ്യുന്ന ജനസംഖ്യാ സ്കെയിൽ | സീക്വൻസിംഗ് തന്ത്രം | ന്യൂക്ലിയോടൈഡ് ആവശ്യകതകൾ |
| മുഴുവൻ ജെനോം സീക്വൻസിംഗും | ≥ 30 വ്യക്തികൾ, ഓരോ ഉപഗ്രൂപ്പുകളിൽ നിന്നും 10 വ്യക്തികളുമായി
| 10x | ഏകാഗ്രത: ≥ 1 NG / μL ആകെ തുക 30n പരിമിതമായ അല്ലെങ്കിൽ അധ d പതനമോ മലിനീകരണമോ ഇല്ല |
| നിർദ്ദിഷ്ട-ലോക്കസ് ആംപ്ലിഫൈഡ് ശകലം (സ്ലാഫ്) | ടാഗ് ഡെപ്ത്: 10x ടാഗുകളുടെ എണ്ണം: <400 MB: WGS ശുപാർശ ചെയ്യുന്നു <1GB: 100 കെ ടാഗുകൾ 1 ജിബി > 2 ജിബി: 300 കെ ടാഗുകൾ പരമാവധി 500k ടാഗുകൾ | ഏകാഗ്രത ≥ 5 NG / μL ആകെ തുക ≥ 80 എൻജി നാനോഡ്രോപ്പ് ഒഡസ്റ്റ് 680 = 1.6-2.5 അഗരോസ് ജെൽ: ഇല്ല അല്ലെങ്കിൽ പരിമിതമായ തകർച്ച അല്ലെങ്കിൽ മലിനീകരണം
|
സേവന ജോലിയുടെ ഒഴുക്ക്
പരീക്ഷണം രൂപകൽപ്പന
സാമ്പിൾ ഡെലിവറി
ലൈബ്രറി നിർമ്മാണം
സീക്വിംഗ്
ഡാറ്റ വിശകലനം
വിൽപ്പന സേവനങ്ങൾ
സേവനത്തിൽ ജനസംഖ്യാ ഘടന (ഫൈലോജെനെറ്റിക് ട്രീ, പിസിഎ, പിസിഎ, പോൾസേഷൻ സ്ട്രാറ്റിഫിക്കേഷൻ ചാർട്ട്), ജനസംഖ്യാ വൈവിധ്യവും ജനസംഖ്യാ തിരഞ്ഞെടുക്കലും (പ്രയോജനകരമായ സൈറ്റുകളുടെ സെലക്ടീവ് സ്വീപ്പ്-തിരഞ്ഞെടുക്കൽ) സേവനത്തിൽ ഉൾപ്പെടുന്നു. കറ്റമൈസ് ചെയ്ത വിശകലനവും സേവനത്തിൽ ഉൾപ്പെടുത്താം (ഉദാ. വ്യതിചലിക്കുന്ന സമയം, ജീൻ ഒഴുക്ക്).
*ഇവിടെ കാണിച്ചിരിക്കുന്ന ഡെമോ ഫലങ്ങൾ എല്ലാം ബിഎംകെജെൻ ഉപയോഗിച്ച് പ്രസിദ്ധീകരിച്ച ജീനോമുകളിൽ നിന്നുള്ളവരാണ്
1. നാണയ വിശകലനത്തിൽ, ജനിതക വ്യതിയാനങ്ങളെ അടിസ്ഥാനമാക്കി ഫൈലോജെനെറ്റിക് ട്രീ, പോപ്പുലേറ്റിക് ട്രീ, പിസിഎ എന്നിവയുടെ നിർമ്മാണം അടങ്ങിയിരിക്കുന്നു.
ഫൈലോജെനെറ്റിക് ട്രീ പൊതുവായ പൂർവ്വികനുമായുള്ള ഇനം ഉൾക്കൊള്ളുന്നവയെയും പരിണാമബന്ധങ്ങളെയും പ്രതിനിധീകരിക്കുന്നു.
സബ് ജനസംഖ്യകൾ തമ്മിലുള്ള അടുപ്പം ദൃശ്യവൽക്കരിക്കുകയാണ് പിസിഎ ലക്ഷ്യമിടുന്നത്.
അന്നെൽ ഫ്രീക്വൻസികളുടെ അടിസ്ഥാനത്തിൽ ജനിതകപരമായി വ്യത്യസ്ത സബ് ജനസംഖ്യയുടെ സാന്നിധ്യം പോപ്പുലേഷൻ ഘടന കാണിക്കുന്നു.
ചെൻ, മറ്റുള്ളവ. അൽ.,പിനാസ്, 2020
2. ഹെക്ടറക്റ്റീവ് സ്വീപ്പ്
ഒരു ആനുകൂല്യമായ സൈറ്റ് തിരഞ്ഞെടുത്ത ഒരു പ്രക്രിയയെ തിരഞ്ഞെടുക്കുന്ന ഒരു പ്രക്രിയയെ സൂചിപ്പിക്കുന്നു, ഒപ്പം ലിങ്കുചെയ്ത ന്യൂട്രൽ സൈറ്റുകളുടെ ആവൃത്തി വർദ്ധിപ്പിക്കുകയും അൺലിൻകില്ലാത്ത സൈറ്റുകൾ കുറയുകയും ചെയ്യുന്നു, ഇത് പ്രാദേശികവൽക്കരിക്കൽ.
സെലക്ടീവ് സ്വീപ്പ് പ്രദേശങ്ങളെക്കുറിച്ചുള്ള ഒരു വ്യാപകമായ കണ്ടെത്തലുകൾ (π, fst, tajima) ചില സ്ലിഡിംഗ് വിൻഡോയിൽ (100 കെബി) ഒരു സ്ലൈഡിംഗ് വിൻഡോയിൽ (100 കെബി) കണക്കാക്കുന്നത് പ്രോസസ്സ് ചെയ്യുന്നു.
ന്യൂക്ലിയോടൈഡ് വൈവിധ്യമാർന്ന (π)
താജിമയുടെ ഡി
ഫിക്സേഷൻ സൂചിക (FST)
Wu, et. അൽ.,തന്മാത്ലാർ പ്ലാന്റ്, 2018
3. തിരയൻ ഒഴുക്ക്
Wu, et. അൽ.,തന്മാത്ലാർ പ്ലാന്റ്, 2018
4. ഡിഡോഗ്രാഫിക് ചരിത്രം
Zhang, et. അൽ.,നേച്ചർ പരിസ്ഥിതിയും പരിണാമവും, 2021
5.ഡിവർഗെൻസ് സമയം
Zhang, et. അൽ.,നേച്ചർ പരിസ്ഥിതിയും പരിണാമവും, 2021
ഒരു ക്യൂറേറ്റുചെയ്ത പ്രസിദ്ധീകരണങ്ങളുടെ ശേഖരത്തിലൂടെ ബിഎംകെജെൻ പരിണാമ ജനിതകസേനകളെ സുഗമമാക്കിയ മുന്നേറ്റങ്ങൾ പര്യവേക്ഷണം ചെയ്യുക:
ഹസ്സന്റോ, എ കെ ഇറ്റ്. .ഇന്റർനാഷണൽ ജേണൽ ഓഫ് മോളിക്യുലർ സയൻസസ്, 24 (7). DOI: 10.3390 / IJMS2M24076238.
ചായ്, ജെ. മറ്റുള്ളവ. (2022) 'വന്യമായ, ജനിതകപരമായി ശുദ്ധമായ ചൈനീസ് ഭീമൻ സലാമന്ദർ കണ്ടെത്തി പുതിയ സംരക്ഷണ അവസരങ്ങൾ സൃഷ്ടിക്കുന്നു,സുവോളജിക്കൽ ഗവേഷണം, 2022, വാല്യം. 43, ലക്കം 3, പേജുകൾ: 469-480, 43 (3), പേജ് 469-480. DOI: 10.24272 / J.Issn.2095-8137.2022.101.
ഹാൻ, എം. മറ്റുള്ളവ. (2022) 'ഫൈലോജോഗ്രാഫിക്കൽ പാറ്റേണായും ജനസംഖ്യാ പരിണാമ പരിണാമ പരിണാമ പരിണാമത്തിന്റെ ചരിത്രം ക്വിങ്ഹായ്-ടിബറ്റൻ പീഠഭൂമിയിൽ',സസ്യശാസ്ത്രത്തിലെ അതിർത്തികൾ, 13, പി. 882601. DOI: 10.3389 / FPLS.2022.882601 / BIBTEX.
വാങ്, ജെ. മറ്റുള്ളവ. .ഹോർട്ടികൾച്ചർ ഗവേഷണം, 9. DOI: 10.1093 / hr / uhac021.
