സർക്ആർഎൻഎ

വൃത്താകൃതിയിലുള്ള ആർഎൻഎകൾ (സർക്ആർഎൻഎകൾ) നോൺ-കോഡിംഗ് ആർഎൻഎകളാണ്, അവ വൃത്താകൃതിയിലുള്ള ഘടനകൾ രൂപപ്പെടുത്തുകയും ടാർഗെറ്റ് ജീനുകൾക്കും പ്രോട്ടീൻ ബൈൻഡിംഗിനുമായി മൈആർഎൻഎയുമായി മത്സരിക്കുന്നത് ഉൾപ്പെടെ ഒന്നിലധികം നിയന്ത്രണ റോളുകളുള്ളതുമാണ്. ബിഎംകെക്ലൗഡ് സർക്ആർഎൻഎ പൈപ്പ്ലൈൻ രൂപകൽപന ചെയ്തിരിക്കുന്നത്, നന്നായി വ്യാഖ്യാനിച്ചതും ഉയർന്ന നിലവാരമുള്ളതുമായ റഫറൻസ് ജീനോം ഉള്ള ആർആർഎൻഎ ഡിപ്ലീറ്റഡ് ലൈബ്രറികളുടെ വിശകലനത്തിനായാണ്. വിശകലനം ആരംഭിക്കുന്നത് റീഡ് ട്രിമ്മിംഗും ഗുണനിലവാര നിയന്ത്രണവും ഉപയോഗിച്ചാണ്, തുടർന്ന് റഫറൻസ് ജീനോമിലേക്കുള്ള റീഡ് അലൈൻമെൻ്റും നോവൽ സർക്ആർഎൻഎകളുടെ പ്രവചനവും ഡാറ്റാബേസുകളിൽ നിന്ന് അറിയപ്പെടുന്ന സർക്ആർഎൻഎകളെ തിരിച്ചറിയുന്നു. അനുബന്ധ miRNA ടാർഗെറ്റുകളും സർക്ആർഎൻഎ ഹോസ്റ്റുകളും പിന്നീട് തിരിച്ചറിയുന്നു. ഡിഫറൻഷ്യൽ എക്സ്പ്രഷൻ വിശകലനം വ്യത്യസ്തമായി പ്രകടിപ്പിക്കുന്ന സർക്ആർഎൻഎകൾ വെളിപ്പെടുത്തുന്നു, കൂടാതെ സമ്പുഷ്ടമായ ബയോളജിക്കൽ ഫംഗ്ഷനുകൾ എക്‌സ്‌ട്രാക്റ്റുചെയ്യുന്നതിന് അനുബന്ധ ഹോസ്റ്റുകൾ പ്രവർത്തനപരമായി വ്യാഖ്യാനിക്കുന്നു.