Bmkmun s3000_SPatial ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം
Bmkmuu s3000 സ്പേഷ്യൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം സാങ്കേതിക സ്കീം
ഫീച്ചറുകൾ
- മിഴിവ്: 3.5 μm
- സ്പോട്ട് വ്യാസം: 2.5 μm
- പാടുകളുടെ എണ്ണം: ഏകദേശം 4 ദശലക്ഷം
- 3 സാധ്യമായ ക്യാപ്ചർ ഏരിയ ഫോർമാറ്റുകൾ: 6.8 മില്ലീമീറ്റർ * 6.8 മില്ലീമീറ്റർ, 11 മില്ലീമീറ്റർ * 11 മില്ലീമീറ്റർ അല്ലെങ്കിൽ 15 മില്ലീമീറ്റർ * 20 മില്ലീമീറ്റർ
- ഓരോ ബാർകോഡ് ചെയ്ത കൊന്തയും 4 വിഭാഗങ്ങൾ അടങ്ങിയ പ്രൈമർമാരുമായി ലോഡുചെയ്യുന്നു:
• എംആർഎൻഎൻഎ പ്രാഥമികത്തിനും സിഡിഎൻഎ സിന്തസിസിനുമായി മാലി (ഡിടി) വാൽ,
ആംപ്ലിഫിക്കേഷൻ ബയസ് ശരിയാക്കാനുള്ള അദ്വിതീയ മോളിക്യുലർ ഐഡന്റിഫയർ (യുഎംഐ)
• സ്പേഷ്യൽ ബാർകോഡ്
The ഭാഗിക റീഡ് 1 സീക്വൻസിംഗ് പ്രൈമർ ബന്ധപ്പെട്ട്
- എച്ച് & ഇ, ഫ്ലൂറസീവ് സ്റ്റെയിനിംഗ് വിഭാഗങ്ങളുടെ സ്റ്റെയിനിംഗ്
- സെൽ സെഗ്മെന്റേഷൻ ടെക്നോളജി ഉപയോഗിക്കാനുള്ള സാധ്യത: എച്ച് & ഇ കറയിംഗ്, ഫ്ലൂറസീവ് സ്റ്റെയിനിംഗ്, ആർഎൻഎ സീക്വൻസിംഗ് എന്നിവയുടെ സംയോജനം സെൽ ബിൻ അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള ഡൗൺസ്ട്രീം സ്പേഷ്യൽ പ്രൊഫൈലിംഗ് വിശകലനം പ്രോസസ്സ് ചെയ്യുക.
- മൾട്ടി ലെവൽ റെസല്യൂഷൻ വിശകലനം നേടാൻ സാധ്യമാണ്: 100 മുതൽ 3.5 ഉം വരെ അല്ലെങ്കിൽ ഒപ്റ്റിമൽ റെസല്യൂഷനിൽ.
ബിഎംകെമ്മു എസ് 3000 ന്റെ പ്രയോജനങ്ങൾ
-ക്യാപ്ചർ സ്ഥലങ്ങൾ 4 ദശലക്ഷമായി ഇരട്ടിയാക്കുന്നു: 3.5 ഉം മെച്ചപ്പെട്ട മിഴിവുള്ളതിനാൽ, ഒരു സെല്ലിന് ഉയർന്ന ജീനിലേക്കും യുഎംഐ കണ്ടെത്തലിലേക്കും നയിക്കുന്നു. ടിഷ്യൂകളുടെ ഘടനയുമായി പൊരുത്തപ്പെടുന്ന മികച്ച വിശദാംശങ്ങൾ ട്രാൻസ്ക്രിപ്ഷൽ പ്രൊഫൈലുകളെ അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള സെല്ലുകൾ മെച്ചപ്പെടുത്തിയ കോശങ്ങളെ മെച്ചപ്പെട്ട ക്ലസ്റ്ററുകളിലാണ്.
- സബ് സെല്ലുലാർ റെസലൂഷൻ:ക്യാപ്ചർ ഏരിയയിൽ> 2 ദശലക്ഷം സ്പേഷ്യൽ ബാർകോഡ് പാടുകൾ, സ്പോട്ട് സെന്ററുകൾക്കിടയിൽ 2 ദശലക്ഷം സ്പേഷ്യൽ ബാർകോഡ് സ്പോട്ടുകൾ. സബ് സെല്ലുലാർ റെസലൂഷൻ (5 μm) സ്പീസിയൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം വിശകലനം പ്രാപ്തമാക്കുന്നു.
-മൾട്ടി ലെവൽ റെസല്യൂഷൻ വിശകലനം:ഒപ്റ്റിമൽ റെസല്യൂഷനിൽ വൈവിധ്യമാർന്ന ടിഷ്യു സവിശേഷതകൾ പരിഹരിക്കുന്നതിന് 100 μm മുതൽ 5 μm വരെ വഴങ്ങുന്ന വളച്ച മൾട്ടി-ലെവൽ വിശകലനം.
-"ഒരു സ്ലൈഡിൽ" ഉപയോഗിക്കാനുള്ള സാധ്യത സെൽ സെഗ്മെന്റേഷൻ ടെക്നോളജി:ഫ്ലൂറൂമെൻസ് സ്റ്റെയിനിംഗ്, എച്ച് & ഇ സ്റ്റെയിനിംഗ്, എച്ച്എൻഎ സീക്വൻസിംഗ്, ഒരൊറ്റ സ്ലൈഡിൽ രചി സീക്വൻസിംഗ്, തുടർന്നുള്ള സെൽ അധിഷ്ഠിത ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോമിക്സിനായി സെൽ അതിരുകൾ തിരിച്ചറിയുന്നതിനെ പങ്കുവയ്ക്കുന്നു.
-ഒന്നിലധികം സീക്വൻസിംഗ് പ്ലാറ്റ്ഫോമുകളുമായി പൊരുത്തപ്പെടുന്നു: എൻജിഎസും ലോംഗ്-റീഡ് സീക്വൻസും ലഭ്യമാണ്.
-1-8 സജീവ ക്യാപ്ചർ ഏരിയയുടെ ഫ്ലെക്സിബിൾ ഡിസൈൻ: ക്യാപ്ചർ പ്രദേശത്തിന്റെ വലുപ്പം വഴക്കമുള്ളതാണ്, 3 ഫോർമാറ്റുകൾ (6.8 മില്ലീമീറ്റർ * 6.8 മില്ലീമീറ്റർ ഉപയോഗിക്കാൻ കഴിയും., 11 മില്ലീമീറ്റർ * 11 മില്ലീമീറ്റർ, 15 മില്ലീമീറ്റർ)
-വൺ-സ്റ്റോപ്പ് സേവനം: ക്രവ-വകുപ്പ്, സ്റ്റെയിനിംഗ്, ടിഷ്യു ഒപ്റ്റിമൈസേഷൻ, സ്പേഷ്യൽ ബാർകോഡിംഗ്, ലൈബ്രറി തയ്യാറാക്കൽ, സീക്വിംഗ്, ബയോ ഇൻഫോർമാറ്റിക്സ് എന്നിവ ഉൾപ്പെടെ എല്ലാ അനുഭവങ്ങളും നൈപുണ്യവും അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള നടപടികളും സമന്വയിപ്പിക്കുന്നു.
-സമഗ്രമായ ബയോ ഇൻഫോർമാറ്റിക്സും ഫലങ്ങളുടെ അനുകൂലമായ ദൃശ്യവൽക്കരണവും:സെൽ വിഭജതയും സ്പോട്ട് ക്ലസ്റ്ററിംഗും ദൃശ്യവൽക്കരിക്കാനും ഇഷ്ടാനുസൃതമാക്കാനും ഉള്ള വികസിത സോഫ്റ്റ്വെയർ ഉപയോഗിച്ച സോഫ്റ്റ്വെയർ ഉപയോഗിച്ച സോഫ്റ്റ്വെയർ വികസിപ്പിച്ചെടുത്ത 29 വിശകലനങ്ങളും 100+ ഉയർന്ന നിലവാരമുള്ള രൂപങ്ങളും പാക്കേജിൽ ഉൾപ്പെടുന്നു.
-ഇഷ്ടാനുസൃതമാക്കിയ ഡാറ്റ വിശകലനവും ദൃശ്യവൽക്കരണവും: വ്യത്യസ്ത ഗവേഷണ അഭ്യർത്ഥനകൾക്കായി ലഭ്യമാണ്
-വളരെ വിദഗ്ധ സാങ്കേതിക ടീം: മനുഷ്യ, മൗസ്, സസ്തനി, മത്സ്യം, സസ്യങ്ങൾ എന്നിവയുൾപ്പെടെ 250 ലധികം ടിഷ്യു തങ്ങളുടെ അനുഭവവും 100+ ഇനങ്ങളും.
-മുഴുവൻ പ്രോജക്റ്റിലും തത്സമയ അപ്ഡേറ്റുകൾ: പരീക്ഷണാത്മക പുരോഗതിയുടെ പൂർണ്ണ നിയന്ത്രണത്തോടെ.
-സിംഗിൾ-സെൽ മിസ്റ്റർ സീക്വൻസിംഗ് ഉള്ള ഓപ്ഷണൽ ജോയിന്റ് വിശകലനം
സേവന സവിശേഷതകൾ
| സാമ്പിൾ ആവശ്യകതകൾ | ഗന്ഥശാല | സീക്വൻസിംഗ് തന്ത്രം | ഡാറ്റ ശുപാർശചെയ്യുന്നു | ഗുണനിലവാര നിയന്ത്രണം |
| ഒക്ടോബർ ഉൾച്ചേർത്ത ക്രയോ സാമ്പിളുകൾ (ഒപ്റ്റിമൽ വ്യാസം: ഏകദേശം. 6 × 6 × 6 mm³) ഒരു സാമ്പിളിന് 2 ബ്ലോക്കുകൾ 1 പരീക്ഷണത്തിനായി, ബാക്കപ്പിനായി 1 | S3000 സിഡിഎൻഎ ലൈബ്രറി | Lulickinulin p150 | ഒരു 100υM ന് 160 കെ PE വായിക്കുന്നു (250 ജിബി) | റിൻ> 7 |
സാമ്പിൾ തയ്യാറെടുപ്പുകളെയും സേവന വർക്ക്ഫ്ലോയെയും കുറിച്ചുള്ള കൂടുതൽ വിവരങ്ങൾക്ക്, ദയവായി സംസാരിക്കാൻ മടിക്കേണ്ടബിഎംകെജെൻ വിദഗ്ദ്ധൻ
സേവന ജോലിയുടെ ഒഴുക്ക്
സാമ്പിൾ തയ്യാറെടുപ്പ് ഘട്ടത്തിൽ, ഉയർന്ന നിലവാരമുള്ള ആർഎൻഎ ലഭിക്കുമെന്ന് ഉറപ്പാക്കുന്നതിന് ഒരു പ്രാരംഭ ബൾക്ക് ആർഎൻഎ എക്സ്ട്രാക്ഷൻ ട്രയൽ നടത്തുന്നു. ടിഷ്യു ഒപ്റ്റിമൈസേഷൻ സ്റ്റേജിൽ വിഭാഗങ്ങൾ കറയും ദൃശ്യവൽക്കരിച്ചതും ടിഷ്യു മുതൽ ടിഷ്യു റിലീസ് ചെയ്യുന്നതിനുള്ള പ്രവേശന അവസ്ഥകൾ ഒപ്റ്റിമൈസ് ചെയ്തിരിക്കുന്നു. ലൈബ്രറി നിർമ്മാണ സമയത്ത് ഒപ്റ്റിമൈസ് ചെയ്ത പ്രോട്ടോക്കോൾ അപേക്ഷിക്കുന്നു, തുടർന്ന് സീക്വൻസിംഗും ഡാറ്റ വിശകലനവും.
മിനുസമാർന്ന പ്രോജക്റ്റ് പ്രോജക്റ്റ് വധശിക്ഷ ഉറപ്പാക്കുന്ന ഒരു പ്രതികരണകരമായ ഫീഡ്ബാക്ക് ലൂപ്പ് നിലനിർത്തുന്നതിനായി സമ്പൂർണ്ണ സേവന വർക്ക്ഫ്ലോയിൽ തത്സമയ അപ്ഡേറ്റുകളും ക്ലയന്റ് സ്ഥിരീകരണങ്ങളും ഉൾപ്പെടുന്നു.
ബിഎംകെജെൻ രൂപകൽപ്പന ചെയ്ത സോഫ്റ്റ്വെയർ "ബിഎസ്ടിമാത്രിക്സ്" എന്ന സോഫ്റ്റ്വെയർ ഉപയോഗിച്ചാണ് ബിഎംകെമ്മു എസ് 3000 സൃഷ്ടിച്ച ഡാറ്റ വിശകലനം ചെയ്ത്, ഇത് ഒരു സെൽ ലെവലും മൾട്ടി ലെവൽ റെസല്യൂഷൻ ജെൻ എക്സ്പ്രഷൻ മാട്രിക്സും ഉപയോഗിക്കുന്നു. അവിടെ നിന്ന്, ഡാറ്റ ഗുണനിലവാര നിയന്ത്രണം, ആന്തരിക-സാമ്പിൾ അനാലിസിസ്, ഇന്റർ ഗ്രൂപ്പ് വിശകലനം എന്നിവ ഉൾപ്പെടുന്ന ഒരു സാധാരണ റിപ്പോർട്ട് സൃഷ്ടിക്കപ്പെടുന്നു.
- ഡാറ്റ ഗുണനിലവാര നിയന്ത്രണം:
- ഡാറ്റ output ട്ട്പുട്ടും ഗുണനിലവാര സ്കോർ വിതരണവും
- ഓരോ സ്ഥലത്തിനും ജീൻ കണ്ടെത്തൽ
- ടിഷ്യു കവറേജ്
- ആന്തരിക-സാമ്പിൾ വിശകലനം:
- ജീൻ സമൃദ്ധമായത്
- കുറച്ച അളവിലെ കാഴ്ചയുള്ള സ്പോട്ട് ക്ലസ്റ്ററിംഗ്
- ക്ലസ്റ്ററുകൾ തമ്മിലുള്ള ഡിഫറൻഷ്യൽ എക്സ്പ്രഷൻ വിശകലനം: മാർക്കർ ജീനുകളുടെ തിരിച്ചറിയൽ
- പ്രവർത്തനപരവും അടയാളങ്ങളുടെ ജീനുകളുടെ സമ്പുഷ്ടീകരണവും
- ഇന്റർ ഗ്രൂപ്പ് വിശകലനം
- രണ്ട് സാമ്പിളുകളിൽ നിന്നും പാടുകൾ വീണ്ടും സംയോജിപ്പിക്കുക (ഉദാ. രോഗബാധിതവും നിയന്ത്രണവും) വീണ്ടും ക്ലസ്റ്റർ
- ഓരോ ക്ലസ്റ്ററിനും മാർക്കർ ജീനുകളുടെ തിരിച്ചറിയൽ
- പ്രവർത്തനപരവും അടയാളങ്ങളുടെ ജീനുകളുടെ സമ്പുഷ്ടീകരണവും
- ഗ്രൂപ്പുകൾ തമ്മിലുള്ള ഒരേ ക്ലസ്റ്ററിന്റെ ഡിഫറൻഷ്യൽ എക്സ്പ്രഷൻ
കൂടാതെ, ബിഎംകെജെൻ "ബിഎസ്ടിവ്യൂവർ" വികസിപ്പിച്ചെടുത്തു, വിവിധ റെസല്യൂഷനുകളിൽ സ്പോട്ട് ക്ലസ്റ്ററിംഗും സ്പോട്ട് ക്ലസ്റ്ററിംഗ്.
ബിഎംകെജെൻ കൃത്യമായ സിംഗിൾ-സെൽ റെസല്യൂഷനിൽ സ്പേഷ്യൽ പ്രൊഫൈലിംഗ് സേവനങ്ങൾ വാഗ്ദാനം ചെയ്യുന്നു (സെൽ ബിൻ അല്ലെങ്കിൽ മൾട്ടി ലെവൽ സ്ക്വയർ ബിൻ മുതൽ 3.5 വരെ).
ടിഷ് വിഭാഗങ്ങളിൽ നിന്നുള്ള സ്പേഷ്യൽ പ്രൊഫൈലിംഗ് ഡാറ്റ S3000 സ്ലൈഡിലെ മികച്ച പ്രകടനം കാഴ്ചവച്ചു.
കേസ് പഠനം 1: മൗസ് മസ്തിഷ്കം
S3000 ഉള്ള ഒരു മൗസ് ബ്രെയിൻ വിഭാഗത്തിന്റെ വിശകലനം ഫലമായി ~ 94 000 സെല്ലുകൾ തിരിച്ചറിയാൻ കാരണമായി, ഒരു സെല്ലിന് ~ 2000 ജീനുകൾ 3.5 ഉം മെച്ചപ്പെടുത്തിയ പ്രമേയം ട്രാൻസ്ക്രിപ്ഷ്യൽ പാറ്റേണുകളെ അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള സെല്ലുകൾ വളരെ വിശദമായ ഒരു ക്ലസ്റ്ററിന് കാരണമായി, തലച്ചോറിനെ അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള സെല്ലുകളുടെ ക്ലസ്റ്ററുകൾ. ഒളിഗോഡെൻഡ്രോസിടെസ്, മൈക്രോഗ്ലിയ സെല്ലുകൾ എന്നിവയുടെ വിതരണം ദൃശ്യമാകുന്ന സെല്ലുകളുടെ വിതരണം ദൃശ്യമാക്കുന്നതിലൂടെ ഇത് എളുപ്പത്തിൽ നിരീക്ഷിക്കുന്നു, അവ ചാരനിറത്തിലുള്ളതും വെളുത്തതുമായ കാര്യങ്ങളിൽ മാത്രമായി സ്ഥിതിചെയ്യുന്നു.
കേസ് പഠനം 2: മൗസ് ഭ്രൂണം
S3000 ഉള്ള ഒരു മൗസ് ഭ്രൂണ വിഭാഗത്തിന്റെ വിശകലനം ഫലമായി ~ 2200 000 സെല്ലുകൾ തിരിച്ചറിയുന്നു, ഒരു സെല്ലിന് ~ 1600 ജീനുകൾ 3.5 ഉം മെച്ചപ്പെടുത്തിയ പ്രമേയം ട്രാൻസ്ക്രിപ്ഷനൽ പാറ്റേണുകളുടെ അടിസ്ഥാനത്തിൽ സെല്ലുകൾ അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള സെല്ലുകൾ വളരെ വിശദമായി ബാധിച്ചു, തലച്ചോറിന്റെ പ്രദേശത്തെ 12 ക്ലസ്റ്ററുകളും തലച്ചോറിന്റെ പ്രദേശത്തെ 2 ക്ലസ്റ്ററുകളും.
ആന്തരിക-സാമ്പിൾ വിശകലനം സെൽ ക്ലസ്റ്ററിംഗ്:
മാർക്കർ ജീനുകൾ തിരിച്ചറിയലും സ്പേഷ്യൽ വിതരണവും:
- (സ്ക്വയർ ബിൻ: 3.5 μm).
- ഉയർന്ന ക്യാപ്ചർ കാര്യക്ഷമത: S1000 സ്ലൈഡിനുമായി താരതമ്യപ്പെടുത്തുമ്പോൾ, ശരാശരി_മിക്ക് 30% മുതൽ 70% വരെ ഉയരുമെന്ന് ശരാശരി
S1000 ചിപ്പിന്റെ സ്കീം:
S3000 ചിപ്പിന്റെ സ്കീം:
