16S/18S/ITS ആംപ്ലിക്കൺ സീക്വൻസിങ്-പാക്ബയോ
സേവന സവിശേഷതകൾ
● സീക്വൻസിങ് പ്ലാറ്റ്ഫോം: PacBio Revio
● സീക്വൻസിങ് മോഡ്: CCS (HiFi റീഡുകൾ)
● ഹൈഫൈ SMRT ബെൽ ലൈബ്രറി തയ്യാറാക്കുന്നതിന് മുമ്പ് ടാർഗെറ്റ് റീജിയൻ്റെ ആംപ്ലിഫിക്കേഷനും ആംപ്ലിക്കോണുകളുടെ ടാൻഡം ലിങ്കിംഗും
സേവന നേട്ടങ്ങൾ
●ഉയർന്ന ടാക്സോണമിക് റെസല്യൂഷൻ: ടിഹാൻ ഷോർട്ട്-ആംപ്ലിക്കോൺ സീക്വൻസിങ്,സ്പീഷീസ് തലത്തിൽ ഉയർന്ന OTU വർഗ്ഗീകരണ നിരക്ക് പ്രാപ്തമാക്കുന്നു.
●വളരെ കൃത്യമായ അടിസ്ഥാന കോളിംഗ്: PacBio CCS മോഡ് സീക്വൻസിങ് (HiFi റീഡുകൾ).
●ഒറ്റപ്പെടൽ-രഹിതം: പാരിസ്ഥിതിക സാമ്പിളുകളിൽ സൂക്ഷ്മജീവികളുടെ ഘടന ദ്രുതഗതിയിലുള്ള തിരിച്ചറിയൽ.
●വ്യാപകമായി ബാധകമാണ്: വൈവിധ്യമാർന്ന സൂക്ഷ്മജീവ സമൂഹ പഠനങ്ങൾ.
●സമഗ്രമായ ബയോ ഇൻഫോർമാറ്റിക് വിശകലനം: ഡാറ്റാബേസ്, വ്യാഖ്യാനം, OTU/ASV എന്നിവയിൽ വൈവിധ്യമാർന്ന വിശകലനങ്ങളുള്ള ഏറ്റവും പുതിയ QIIME2 പാക്കേജ് (മൈക്രോബയൽ ഇക്കോളജിയിലേക്കുള്ള അളവ് ഉൾക്കാഴ്ച).
●വിപുലമായ വൈദഗ്ധ്യം: പ്രതിവർഷം ആയിരക്കണക്കിന് ആംപ്ലിക്കൺ സീക്വൻസിങ് പ്രോജക്ടുകൾ നടത്തുമ്പോൾ, BMKGENE ഒരു ദശാബ്ദത്തിലേറെ അനുഭവസമ്പത്തും ഉയർന്ന വൈദഗ്ധ്യമുള്ള വിശകലന സംഘവും സമഗ്രമായ ഉള്ളടക്കവും മികച്ച വിൽപ്പനാനന്തര പിന്തുണയും നൽകുന്നു.
സേവന സവിശേഷതകൾ
| ലൈബ്രറി | സീക്വൻസിങ് സ്ട്രാറ്റജി | ഡാറ്റ ശുപാർശ ചെയ്യുന്നു |
| ആംപ്ലിക്കൺ | PacBio റിവിയോ | 10/30/50 കെ ടാഗുകൾ (CCS) |
സാമ്പിൾ ആവശ്യകതകൾ
| ഏകാഗ്രത (ng/µL) | ആകെ തുക (µg) | വോളിയം (µL) |
| ≥5 | ≥0.3 | ≥20 |
ശുപാർശ ചെയ്യുന്ന സാമ്പിൾ ഡെലിവറി
സാമ്പിളുകൾ ദ്രവ നൈട്രജനിൽ 3-4 മണിക്കൂർ ഫ്രീസ് ചെയ്ത് ലിക്വിഡ് നൈട്രജൻ അല്ലെങ്കിൽ -80 ഡിഗ്രി മുതൽ ദീർഘകാല സംവരണം വരെ സൂക്ഷിക്കുക. ഡ്രൈ-ഐസ് ഉള്ള സാമ്പിൾ ഷിപ്പിംഗ് ആവശ്യമാണ്.
സർവീസ് വർക്ക് ഫ്ലോ
സാമ്പിൾ ഡെലിവറി
ലൈബ്രറി നിർമ്മാണം
സീക്വൻസിങ്
ഡാറ്റ വിശകലനം
വിൽപ്പനാനന്തര സേവനങ്ങൾ
ഇനിപ്പറയുന്ന വിശകലനം ഉൾപ്പെടുന്നു:
●റോ ഡാറ്റ ഗുണനിലവാര നിയന്ത്രണം
●OTU ക്ലസ്റ്ററിംഗ്/ഡി-നോയിസ്(ASV)
●OTU വ്യാഖ്യാനം
●ആൽഫ വൈവിധ്യ വിശകലനം: ഷാനൺ, സിംസൺ, എസിഇ എന്നിവയുൾപ്പെടെ ഒന്നിലധികം സൂചികകൾ.
●ബീറ്റ വൈവിധ്യ വിശകലനം
●ഇൻ്റർ-ഗ്രൂപ്പ് വിശകലനം
●പരസ്പര വിശകലനം: പാരിസ്ഥിതിക ഘടകങ്ങളും ബാഹ്യ ഘടനയും വൈവിധ്യവും തമ്മിൽ
●16S ഫങ്ഷണൽ ജീൻ പ്രവചനം
ടാക്സോണമിക് വിതരണത്തിൻ്റെ ഹിസ്റ്റോഗ്രാം
കമ്മ്യൂണിറ്റി ഡിസ്ട്രിബ്യൂഷൻ ഫൈലോജെനെറ്റിക് ട്രീ
ആൽഫ വൈവിധ്യ വിശകലനം: എസിഇ
സൂചിക
ബീറ്റ വൈവിധ്യ വിശകലനം: പിസിഒഎ
ഇൻ്റർഗ്രൂപ്പ് വിശകലനം: ANOVA
BMKGene-ൻ്റെ ആംപ്ലിക്കൺ സീക്വൻസിംഗ് സേവനങ്ങൾ PacBio-നൊപ്പം പ്രസിദ്ധീകരണങ്ങളുടെ ക്യൂറേറ്റ് ചെയ്ത ശേഖരത്തിലൂടെ സുഗമമാക്കിയ പുരോഗതികൾ പര്യവേക്ഷണം ചെയ്യുക.
Gao, X. and Wang, H. (2023) 'ആൽപൈൻ പുൽത്തകിടിയിൽ രണ്ട് വളരുന്ന ഘട്ടങ്ങളുള്ള ആൽപൈൻ മെറിനോ ഷീപ്പിലെ വ്യത്യസ്‌ത ഫിനോളജിക്ക് (റീഗ്രീൻ വേഴ്സസ്. ഗ്രാസ്സി) അഡാപ്റ്റേഷൻ സമയത്ത് Rumen ബാക്ടീരിയ പ്രൊഫൈലുകളുടെയും പ്രവർത്തനങ്ങളുടെയും താരതമ്യ വിശകലനം', ഫെർമെൻ്റേഷൻ, 9( 1), പേ. 16. doi: 10.3390/FERMENTATION9010016/S1.
ലി, എസ്. തുടങ്ങിയവർ. (2023) 'കൾച്ചറോമിക്‌സ് അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള മെറ്റാജെനോമിക്‌സും ഉയർന്ന റെസല്യൂഷൻ വിശകലനവും ഉപയോഗിച്ച് മരുഭൂമിയിലെ മണ്ണിലെ സൂക്ഷ്മജീവികളുടെ ഇരുണ്ട ദ്രവ്യം പിടിച്ചെടുക്കൽ', npj ബയോഫിലിംസ് ആൻഡ് മൈക്രോബയോമുകൾ 2023 9:1, 9(1), പേജ്. 1–14. doi: 10.1038/s41522-023-00439-8.
മു, എൽ. തുടങ്ങിയവർ. (2022) 'പയറുവർഗ്ഗങ്ങൾ, അരി വൈക്കോൽ, ഗോതമ്പ് തവിട് എന്നിവ ഉപയോഗിച്ച് തയ്യാറാക്കിയ മിക്സഡ് സൈലേജിൻ്റെ അഴുകൽ സവിശേഷതകൾ, ബാക്ടീരിയൽ വൈവിധ്യം, എയറോബിക് സ്ഥിരത എന്നിവയിൽ ഫാറ്റി ആസിഡ് ലവണങ്ങളുടെ സ്വാധീനം', ജേണൽ ഓഫ് ദി സയൻസ് ഓഫ് ഫുഡ് ആൻഡ് അഗ്രികൾച്ചർ, 102(4), പേജ്. 1475– 1487. doi: 10.1002/JSFA.11482.
യാങ്, ജെ. തുടങ്ങിയവർ. (2023) 'സോങ്കസ് ബ്രാക്യോട്ടസ് ഡിസിയിൽ നിന്നുള്ള എക്സ്ട്രാക്‌റ്റുകളുടെ ആൻ്റിഓക്‌സിഡൻ്റ് ഇഫക്റ്റുകളിൽ ഓക്സിഡേറ്റീവ് സ്ട്രെസ് ബയോമാർക്കറുകളും ഗട്ട് മൈക്രോബയോട്ടയും തമ്മിലുള്ള ഇടപെടൽ. പ്രായപൂർത്തിയായ സീബ്രാഫിഷിലെ ഓക്സാസലോൺ-ഇൻഡ്യൂസ്ഡ് ഇൻറസ്റ്റൈനൽ ഓക്സിഡേറ്റീവ് സ്ട്രെസ്, ആൻ്റിഓക്‌സിഡൻ്റുകൾ 2023, വാല്യം. 12, പേജ് 192, 12(1), പേ. 192. doi: 10.3390/ANTIOX12010192.
