Целосно транскриптно секвенционирање - Илумина
Карактеристики
● Двојна библиотека за секвенца на целосен транскриптом: осиромашување на rRNA проследено со подготовка на библиотеката PE150 и избор на големина проследена со подготовка на библиотеката SE50
● Комплетна анализа на биоинформатика на mRNA, lncRNA, circrNA и miRNA во одделни извештаи за биоинформатика
● Заедничка анализа на целиот израз на РНК во комбиниран извештај, вклучително и анализа на мрежите Cerna.
Предности на услугата
●Длабока анализа на регулаторните мрежи: Анализата на мрежата на Церна е овозможена со заедничко секвенционирање на mRNA, lncRNA, circrNA и miRNA и со исцрпна биоинформатички работен тек.
●Сеопфатно прибележување: Ние користиме повеќе бази на податоци за функционално анотирање на различно изразените гени (DEGs) и да ја извршиме соодветната анализа на збогатувањето, обезбедувајќи увид во клеточните и молекуларните процеси кои се однесуваат на реакцијата на транскриптом.
●Широка експертиза: Со евиденција за успешно затворање на над 2100 цели транскриптоми во разни домен на истражување, нашиот тим носи богатство на искуство на секој проект.
●Ригорозна контрола на квалитетот: Ние имплементираме основни контролни точки во сите фази, од подготовка на примероци и библиотека до секвенционирање и биоинформатика. Овој прецизен мониторинг обезбедува испорака на постојано квалитетни резултати.
●Поддршка по продажбата: Нашата заложба се протега надвор од завршувањето на проектот со 3-месечен период на услуга по продажба. За тоа време, ние нудиме следење на проектот, помош за смена на проблеми и сесии за Q&A за решавање на какви било прашања поврзани со резултатите
Барања за примероци и испорака
| Библиотека | Стратегија за секвенцирање | Препорачани податоци | Контрола на квалитетот |
| rRNA осиромашена | Илумина PE150 | 16 GB | Q30≥85% |
| Избрана големина | Илумина SE50 | 10-20м чита |
Барања за примероци:
Нуклеотиди:
| Конкон (ng/μl) | Количина (μg) | Чистота | Интегритет |
| ≥ 80 | ≥ 1,6 | OD260/280 = 1,7-2.5 OD260/230 = 0,5-2,5 Ограничена или без загадување на протеини или ДНК прикажана на гел. | Rin≥6.0 5.0≥28S/18S≥1.0; ограничено или без основно покачување |
Препорачана испорака на примероци
Контејнер: цевка за центрифуга од 2 мл (калај фолија не се препорачува)
Етикетирање на примерокот: Група+Репликација на ЕГ А1, А2, А3; Б1, Б2, Б3.
Испорака:
1. Сува-мраз: Примероците треба да бидат спакувани во торби и да се закопаат во сув мраз.
2.
Проток на работа на услуги
Дизајн на експерименти
Испорака на примерок
Екстракција на РНК
Библиотека изградба
Секвенцирање
Анализа на податоците
Услуги по продажба
Биоинформатика
Преглед на изразот на РНК
Различно изразени гени
Анализа на Церна
Различно изразени miRNA и сродни РНК
Истражете ги напредокот во истражувањето олеснети со услугите за секвенционирање на БМКГЕНЕ, преку курирана колекција на публикации.
Даи, Ј. И др. (2022) „Сеопфатни профили на изразување на mRNA, lncRNA и miRNA во Кашин-Бек болест, идентификувани со РНК-секвенционирање“, молекуларни омики, 18 (2), стр. 154–166. doi: 10.1039/d1mo00370d.
Лиу, Н. Нан и др. (2022) „Транскриптоми за целосна должина Анализа на ладно отпорност на APIS Cerana во планината Чангбаи за време на периодот на презаситеност.“, Ген, 830, стр. 146503–146503. doi: 10.1016/j.gene.2022.146503.
Ванг, XJ et al. (2022) 'Приоритизација заснована врз интеграцијата заснована на интеграција на конкурентни мрежни мрежни регулативи на РНК во карцином на белите дробови на мали клетки: Молекуларни карактеристики и кандидати за лекови', Фронти во онкологијата, 12, стр. 904865. Doi: 10.3389/fonc.2022.904865/bibtex.
Xu, P. et al. (2022) „Интегрирана анализа на профилите на изразување lncRNA/circrNA-mirNA-mRNA открива нови увид во потенцијалните механизми како одговор на нематоди на корен-јазол во кикирики“, геномика на BMC, 23 (1), стр. 1–12. doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/Слика/7.
Јан, З. и др. (2022) „Целосно-транскриптомот РНК секвенционирање ги истакнува молекуларните механизми поврзани со одржувањето на квалитетот на постројката во брокулата со црвена LED зрачење“, Постраст-биологија и технологија, 188, стр. 111878. Doi: 10.1016/j.postharvbio.2022.111878.
