Мала РНК секвенционирање-Илумина
Карактеристики
● Подготовката на библиотеката вклучува чекор за избор на големина
● Биоинформатичка анализа во центарот на предвидување на miRNA и нивните цели
Предности на услугата
●Сеопфатна анализа на биоинформатика:Овозможување на идентификација на познати и романи miRNA, идентификација на целите на miRNAS и соодветно функционално прибележување и збогатување со повеќе бази на податоци (KEGG, GO)
●Ригорозна контрола на квалитетот: Ние имплементираме основни контролни точки во сите фази, од подготовка на примероци и библиотека до секвенционирање и биоинформатика. Овој прецизен мониторинг обезбедува испорака на постојано квалитетни резултати.
●Поддршка по продажбата: Нашата заложба се протега надвор од завршувањето на проектот со 3-месечен период на услуга по продажба. За тоа време, ние нудиме следење на проектот, помош за смена на проблеми и сесии за Q&A за решавање на какви било прашања поврзани со резултатите.
●Широка експертиза: Со учинокот за успешно затворање на повеќе проекти на sRNA кои опфаќаат над 300 видови во различни домени за истражување, нашиот тим носи богатство на искуство на секој проект.
Барања за примероци и испорака
| Библиотека | Платформа | Препорачани податоци | Податоци QC |
| Избрана големина | Илумина SE50 | 10m-20m чита | Q30≥85% |
Барања за примероци:
Нуклеотиди:
| Конкон (ng/μl) | Количина (μg) | Чистота | Интегритет |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280 = 1,7-2.5 OD260/230 = 0,5-2,5 Ограничена или без загадување на протеини или ДНК прикажана на гел. | Rin≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; ограничено или без основно покачување |
● Растенија:
Корен, стебло или ливче: 450 мг
Лист или семе: 300 мг
Овошје: 1,2 g
● Animalивотно:
Срце или црево: 450 мг
Висцера или мозок: 240 мг
Мускул: 600 мг
Коски, коса или кожа: 1,5 g
● Артроподи:
Инсекти: 9g
Crustacea: 450 mg
● Цела крв: 2 цевки
● клетки: 106 клетки
● Серум и плазма:6 мл
Препорачана испорака на примероци
Контејнер: цевка за центрифуга од 2 мл (калај фолија не се препорачува)
Етикетирање на примерокот: Група+Репликација на ЕГ А1, А2, А3; Б1, Б2, Б3.
Испорака:
1. Сува-мраз: Примероците треба да бидат спакувани во торби и да се закопаат во сув мраз.
2.
Проток на работа на услуги
Дизајн на експерименти
Испорака на примерок
Екстракција на РНК
Библиотека изградба
Секвенцирање
Анализа на податоците
Услуги по продажба
Биоинформатика
● Контрола на квалитетот на суровините на податоците
● Класификација на sRNA
● Усогласување со референтен геном
● Идентификација на познат и роман miRNA
● Анализа на изразување на диференцијална miRNA
● Функционално прибележување на целите на miRNA
Идентификација на miRNA: структура и длабочина
Диференцијално изразување на miRNA - Hiearchical Clastering
Функционално прибележување на целта на различно изразените miRNA
Истражете ги напредокот во истражувањето олеснети со услугите за секвенционирање на sRNA на BMKgene преку курирана колекција на публикации.
Чен, Х. и др. (2023) „Вирусни инфекции ја инхибираат биосинтезата на сапонин и фотосинтезата во Panax Notoginseng“, физиологија на растенијата и биохемија, 203, стр. 108038. Doi: 10.1016/j.plaphy.2023.108038.
Ли, Х. и др. (2023) „Доменот на фабриката FYVE - кој содржи протеини со протеини Free1 со компоненти на микропроцесор за да ја потиснат miRNA биогенезата“, пренесува ЕМБО, 24 (1). doi: 10.15252/embr.202255037/supt_file/embr202255037-sup-0004-sdatafig4.tif.
Ју, Ј и др. (2023) 'MicroRNA AME-Bantam-3P го контролира развојот на ларвалните кутриња со таргетирање на повеќекратните домени на факторот на раст 8 (MEGF8) во медоносецот, APIS Mellifera', Меѓународен весник на молекуларни науки, 24 (6), P . 5726. DOI: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Angанг, М. и др. (2018) 'Интегрираната анализа на miRNA и гените поврзани со квалитетот на месото открива дека GGA-MIR-140-5P влијае на интрамускулно таложење на маснотии кај кокошки, клеточна физиологија и биохемија, 46 (6), стр. 2421–2433. doi: 10.1159/000489649.
