Pacbio Транскриптом со целосна должина

PacBio Full-Length Transcriptome Sequencing, Isoseq, овозможува прецизна идентификација на изоформите на транскриптот, расветлувајќи ја алтернативната полиаденилација и спојување и доведува до попрецизна анализа на генската експресија. Нафтоводот BMKCloud PacBio со целосна должина на транскриптом е дизајниран да ги анализира библиотеките на cDNA секвенционирани во режим на Циркуларно консензусно секвенционирање (CCS) и идентификува секвенци со целосна должина, нехимерички (FLNC), кои потоа се групирани во неизлишни транскрипти. Последователната анализа на BUSCO ја проценува комплетноста на склопот на транскриптом. Од собраниот транскриптом, се вршат повеќе анализи: алтернативно спојување, повторување на едноставна секвенца (SSR), предвидување на lncRNA и соодветните целни гени, предвидување на нови гени, анализа на генско семејство, анализа на факторот на транскрипција и функционална анотација на транскриптите.