mRNA-seq (NGS) со референтен геном
RNA-Seq е стандардна алатка низ животот и културата, премостувајќи го јазот помеѓу геномите и протеомите. Неговата јачина лежи во откривањето на нови записници и квантифицирање на нивниот израз во една анализа. Широко се користи за компаративни транскриптомски студии, осветлување на гените поврзани со разни црти или фенотипови, како споредување на мутанти со диви типови или откривање на изразување на гени под специфични услови. Апликацијата BMKCloud mRNA (Reference) интегрира квантификација на изразување, анализа на диференцијално изразување (DEG) и анализи на структурата на секвенци во гасоводот mRNA-Seq (NGS) на биоинформатиката и ги спојува предностите на јаките страни на сличен софтвер, обезбедувајќи погодност и пријателство за корисници. Корисниците можат да ги постават своите податоци за РНК-сек во облакот, каде што апликацијата нуди сеопфатно, едношалтерско решение за биоинформатичка анализа. Покрај тоа, тоа му дава приоритет на искуството на клиентите, нудејќи персонализирани операции прилагодени на специфичните потреби на корисниците. Корисниците можат сами да постават параметри и сами да ја достават мисијата на гасоводот, да го проверат интерактивниот извештај, да ги видат податоците/дијаграмите и целосното рударство на податоци, како што се: Избор на целни гени, функционално кластерирање, дијаграмирање, итн.
Платформата:Илумина, МГИ
Стратегија:РНК-сек
Распоред: Паризирана, чиста податоци.
Тип на библиотека:FR-Unstranded, FR-FirstStrand или FR-SecondStrand
Прочитајте ја должината:150 б.п.
Тип на датотека:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz или *.fq.gz. Системот ќеавтоматски спарете ги датотеките .fastq според нивните имиња на датотеки,на пр. *_1.fastq спарен со *._ 2.fastq.
Број на примероци:Нема ограничувања на бројотна примероци, но времето за анализа ќе се зголеми како број наПримероците растат.
Препорачана количина на податоци:6G по примерок