Транскриптом е врската помеѓу геномските генетски информации и протеомот на биолошката функција. Регулацијата на нивото на транскрипција е најважниот и најшироко проучениот режим на регулирање на организмите. Секвенционирањето на транскриптното може да го секвенцира транскриптот во кој било момент на време или под која било состојба, со резолуција точна за единечен нуклеотид. Може динамично да го одразува нивото на транскрипција на гени, истовремено да ги идентификува и квантифицира ретките и нормалните транскрипти и да обезбеди структурни информации на Пример специфични записници.
Во моментов, технологијата за транскриптом секвенционирање е широко користена во агрономијата, медицината и другите полиња за истражување, вклучително и регулирање на развој на животни и растенија, адаптација на животната средина, имунолошка интеракција, генетска локализација, генетска еволуција на видови и откривање на тумор и генетска болест.
